RNA–Protein interactions for RNA: tW(UCA)Q

tW(UCA)Q, Transcript of Mitochondrial tRNA, annotated as tryptophanyl tRNA (tRNA-Trp), yeastyeast

Gene tW(UCA)Q, Length 74 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(UCA)QtW(UCA)Q DEF1P35732 738 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q UGA2P38067 497 aa3.6□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q CHS7P38843 316 aa3.6□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPS26AP39938 119 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPS26BP39939 119 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q YFL054CP43549 646 aa3.6□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q MET12P46151 657 aa3.6□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q SUN4P53616 420 aa3.6□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q RMD1Q03441 430 aa3.6□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q ESF1Q06344 628 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPL11AP0C0W9 174 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q PEP7P32609 515 aa3.59□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q YPT53P36019 220 aa3.59□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q MND2P40577 368 aa3.59□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q GTF1P53260 183 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q TIF35Q04067 274 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPL11BQ3E757 174 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
tW(UCA)QtW(UCA)Q BI4P03879 638 aa3.58□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q HIS5P07172 385 aa3.58□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q RAD53P22216 821 aa3.58□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q SLA2P33338 968 aa3.58□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q RER2P35196 286 aa3.58□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q POA1P38218 177 aa3.58□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q PNT1P38969 423 aa3.58□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q SNF7P39929 240 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q YJR107WP47145 328 aa3.58□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q ADY3Q07732 790 aa3.58□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q TPO1Q07824 586 aa3.58□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q YLL058WQ12198 575 aa3.58□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q PLB1P39105 664 aa3.57□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q MXR1P40029 184 aa3.57□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q CHA4P43634 648 aa3.57□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q POL32P47110 350 aa3.57□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q PHO23P50947 330 aa3.57□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q MCM7P38132 845 aa3.56□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q ZRG8P40021 1076 aa3.56□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q SIP5P40210 489 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q HFM1P51979 1187 aa3.56□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q SPP382Q06411 708 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q ATG19P35193 415 aa3.55□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q MSS4P38994 779 aa3.55□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q GCV2P49095 1034 aa3.55□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q EXG2P52911 562 aa3.55□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q ENB1Q08299 606 aa3.55□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q OSW2Q12202 724 aa3.55□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q DBP2P24783 546 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q ASF1P32447 279 aa3.54□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q LYP1P32487 611 aa3.54□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q OAR1P35731 278 aa3.54□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q YAP1801P38856 637 aa3.54□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q MTC3P53077 123 aa3.54□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q KIN4Q01919 800 aa3.54□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q AIM39Q08223 395 aa3.54□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q RKM4Q12504 494 aa3.54□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q PFK1P16861 987 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q RPC82P32349 654 aa3.53□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q PSP2P50109 593 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q GUP2Q08929 609 aa3.53□□□□□ -1.84
tW(UCA)QtW(UCA)Q ENA1P13587 1091 aa3.52□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q HEM3P28789 327 aa3.52□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q MCM2P29469 868 aa3.52□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q YGR012WP53206 393 aa3.52□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q ENA2Q01896 1091 aa3.52□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q SPR28Q04921 423 aa3.52□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q RRP15Q06511 250 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q ENA5Q12691 1091 aa3.52□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q TRP2P00899 507 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q HSF1P10961 833 aa3.51□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q ATE1P16639 503 aa3.51□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q HRR25P29295 494 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q FUN30P31380 1131 aa3.51□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q MNR2P35724 969 aa3.51□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q MET10P39692 1035 aa3.51□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q FYV10P40492 516 aa3.51□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q URM1P40554 99 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q KRI1P42846 591 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q TYW3P53177 273 aa3.51□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q MDM38Q08179 573 aa3.51□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q PPM2Q08282 695 aa3.51□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q KCS1Q12494 1050 aa3.51□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q SPE1P08432 466 aa3.5□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q INO1P11986 533 aa3.5□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q CDC34P14682 295 aa3.5□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q YKL107WP34251 309 aa3.5□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q ECM21P38167 1117 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q MOH1P38191 138 aa3.5□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q CCC2P38995 1004 aa3.5□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q SRT1Q03175 343 aa3.5□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data3.5□□□□□ -1.85not detected
tW(UCA)QtW(UCA)Q SPO20Q04359 397 aa3.5□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q CDA1Q06702 301 aa3.5□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q DUT1P33317 147 aa3.49□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q PIN4P34217 668 aaKnown RBP RIP-Chip data3.49□□□□□ -1.85not detected
tW(UCA)QtW(UCA)Q XYL2Q07993 356 aa3.49□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q KTR4P38131 464 aa3.48□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q NCS6P53088 359 aa3.48□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q EEB1Q02891 456 aa3.48□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q NPC2Q12408 173 aa3.48□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q EFT1P32324 842 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
tW(UCA)QtW(UCA)Q PET112P33893 541 aa3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 131.5 ms