RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639482.1

SPIN3-222, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 3

Gene SPIN3, Length 3,719 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-222	ENST00000639482	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
SPIN3-222	ENST00000639482	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SPIN3-222	ENST00000639482	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
SPIN3-222	ENST00000639482	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
SPIN3-222	ENST00000639482	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SPIN3-222	ENST00000639482	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
SPIN3-222	ENST00000639482	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
SPIN3-222	ENST00000639482	TSPY26P	Q9H489	355 aa		12.18	□□□□□ -0.46
SPIN3-222	ENST00000639482	PIK3R4	Q99570	1358 aa		12.18	□□□□□ -0.46
SPIN3-222	ENST00000639482	FIBP	O43427	364 aa		12.18	□□□□□ -0.46
SPIN3-222	ENST00000639482	PDE1A	P54750	535 aa		12.18	□□□□□ -0.46
SPIN3-222	ENST00000639482	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	12.17	□□□□□ -0.46
SPIN3-222	ENST00000639482	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	12.17	□□□□□ -0.46
SPIN3-222	ENST00000639482	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	12.17	□□□□□ -0.46
SPIN3-222	ENST00000639482	HMMR	O75330	724 aa		12.17	□□□□□ -0.46
SPIN3-222	ENST00000639482	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		12.17	□□□□□ -0.46
SPIN3-222	ENST00000639482	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SPIN3-222	ENST00000639482	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	12.16	□□□□□ -0.46
SPIN3-222	ENST00000639482	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SPIN3-222	ENST00000639482	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	12.16	□□□□□ -0.46
SPIN3-222	ENST00000639482	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	12.16	□□□□□ -0.46
SPIN3-222	ENST00000639482	MCC	P23508	829 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SPIN3-222	ENST00000639482	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SPIN3-222	ENST00000639482	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	12.16	□□□□□ -0.46
SPIN3-222	ENST00000639482	CPA1	P15085	419 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SPIN3-222	ENST00000639482	CRB1	P82279	1406 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SPIN3-222	ENST00000639482	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		12.16	□□□□□ -0.46
SPIN3-222	ENST00000639482	SPC24	Q8NBT2	197 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SPIN3-222	ENST00000639482	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	12.15	□□□□□ -0.46
SPIN3-222	ENST00000639482	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SPIN3-222	ENST00000639482	IP6K1	Q92551	441 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SPIN3-222	ENST00000639482	ARHGEF10	O15013	1369 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SPIN3-222	ENST00000639482	TMEM94	Q12767	1356 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SPIN3-222	ENST00000639482	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		12.15	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	ATF3	P18847	181 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	USP48	Q86UV5	1035 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	MBD3	O95983	291 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	12.14	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	RTL1	A6NKG5	1358 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	KDR	P35968	1356 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	MX1	P20591	662 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	CBX1	P83916	185 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	STK31	Q9BXU1	1019 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	IL25	Q9H293	177 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	IGSF3	O75054	1194 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	ADCY5	O95622	1261 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	GNAI2	P04899	355 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	SPG7	Q9UQ90	795 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	BRD1	O95696	1058 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	SLC39A6	Q13433	755 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	FERMT3	Q86UX7	667 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	MAP3K5	Q99683	1374 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	CHML	P26374	656 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	NWD1	Q149M9	1564 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	RGS12	O14924	1447 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	FLII	Q13045	1269 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	CAMK4	Q16566	473 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	HS1BP3	Q53T59	392 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	ATP10D	Q9P241	1426 aa		12.08	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.47
SPIN3-222	ENST00000639482	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SPIN3-222	ENST00000639482	TEF	Q10587	303 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SPIN3-222	ENST00000639482	LTN1	O94822	1766 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SPIN3-222	ENST00000639482	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		12.08	□□□□□ -0.48

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