RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636280.1

DNM1-222, Transcript of dynamin 1, human

TSL 5

Gene DNM1, Length 2,462 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNM1-222	ENST00000636280	DCTPP1	Q9H773	170 aa		19.94	■□□□□ 0.78
DNM1-222	ENST00000636280	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	19.94	■□□□□ 0.78
DNM1-222	ENST00000636280	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		19.94	■□□□□ 0.78
DNM1-222	ENST00000636280	USP44	Q9H0E7	712 aa		19.94	■□□□□ 0.78
DNM1-222	ENST00000636280	DISP2	A7MBM2	1401 aa		19.94	■□□□□ 0.78
DNM1-222	ENST00000636280	BEND3	Q5T5X7	828 aa		19.93	■□□□□ 0.78
DNM1-222	ENST00000636280	USP16	Q9Y5T5	823 aa		19.93	■□□□□ 0.78
DNM1-222	ENST00000636280	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	19.92	■□□□□ 0.78
DNM1-222	ENST00000636280	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	19.92	■□□□□ 0.78
DNM1-222	ENST00000636280	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	19.92	■□□□□ 0.78
DNM1-222	ENST00000636280	KSR2	Q6VAB6	950 aa		19.91	■□□□□ 0.78
DNM1-222	ENST00000636280	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		19.91	■□□□□ 0.78
DNM1-222	ENST00000636280	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		19.9	■□□□□ 0.78
DNM1-222	ENST00000636280	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	19.9	■□□□□ 0.78
DNM1-222	ENST00000636280	GLI3	P10071	1580 aa		19.89	■□□□□ 0.77
DNM1-222	ENST00000636280	MYL6B	P14649	208 aa		19.89	■□□□□ 0.77
DNM1-222	ENST00000636280	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	19.89	■□□□□ 0.77
DNM1-222	ENST00000636280	HMMR	O75330	724 aa		19.88	■□□□□ 0.77
DNM1-222	ENST00000636280	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	19.88	■□□□□ 0.77
DNM1-222	ENST00000636280	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	19.88	■□□□□ 0.77
DNM1-222	ENST00000636280	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	19.88	■□□□□ 0.77
DNM1-222	ENST00000636280	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	19.88	■□□□□ 0.77
DNM1-222	ENST00000636280	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		19.87	■□□□□ 0.77
DNM1-222	ENST00000636280	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	19.87	■□□□□ 0.77
DNM1-222	ENST00000636280	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		19.87	■□□□□ 0.77
DNM1-222	ENST00000636280	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		19.86	■□□□□ 0.77
DNM1-222	ENST00000636280	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	19.86	■□□□□ 0.77
DNM1-222	ENST00000636280	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	19.86	■□□□□ 0.77
DNM1-222	ENST00000636280	ATP8B2	P98198	1209 aa		19.86	■□□□□ 0.77
DNM1-222	ENST00000636280	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		19.86	■□□□□ 0.77
DNM1-222	ENST00000636280	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		19.86	■□□□□ 0.77
DNM1-222	ENST00000636280	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		19.86	■□□□□ 0.77
DNM1-222	ENST00000636280	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		19.85	■□□□□ 0.77
DNM1-222	ENST00000636280	EXOC5	O00471	708 aa		19.85	■□□□□ 0.77
DNM1-222	ENST00000636280	COPS6	Q7L5N1	327 aa		19.85	■□□□□ 0.77
DNM1-222	ENST00000636280	NRAP	Q86VF7	1730 aa		19.85	■□□□□ 0.77
DNM1-222	ENST00000636280	PAPPA	Q13219	1627 aa		19.85	■□□□□ 0.77
DNM1-222	ENST00000636280	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		19.85	■□□□□ 0.77
DNM1-222	ENST00000636280	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	19.85	■□□□□ 0.77
DNM1-222	ENST00000636280	TNS2	Q63HR2	1409 aa		19.85	■□□□□ 0.77
DNM1-222	ENST00000636280	ALDH1L1	O75891	902 aa		19.84	■□□□□ 0.77
DNM1-222	ENST00000636280	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	19.83	■□□□□ 0.77
DNM1-222	ENST00000636280	PIGB	Q92521	554 aa		19.83	■□□□□ 0.77
DNM1-222	ENST00000636280	SEC24B	O95487	1268 aa		19.83	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		19.83	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	LINS1	Q8NG48	757 aa		19.83	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	SLIT2	O94813	1529 aa		19.83	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	APBB1	O00213	710 aa		19.82	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	19.82	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		19.82	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	19.82	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	19.82	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		19.81	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		19.81	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		19.81	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	NBPF26	B4DH59	902 aa		19.81	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	NBPF14	Q5TI25	921 aa		19.81	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	19.81	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	NBPF15	Q8N660	670 aa		19.81	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		19.81	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	ERBB4	Q15303	1308 aa		19.8	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	19.8	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		19.8	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	19.8	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	19.8	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		19.8	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	JCAD	Q9P266	1359 aa		19.8	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		19.8	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	19.8	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	IGKV5-2	P06315	115 aa		19.79	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		19.79	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		19.79	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	SSH3	Q8TE77	659 aa		19.79	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		19.79	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	19.79	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	ATG3	Q9NT62	314 aa		19.79	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	19.78	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	19.78	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	A1BG	P04217	495 aa		19.78	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		19.78	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	NBR1	Q14596	966 aa		19.78	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	DDB1	Q16531	1140 aa		19.78	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	19.78	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	BCL9	O00512	1426 aa		19.77	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	LRP6	O75581	1613 aa		19.77	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	POLA2	Q14181	598 aa		19.77	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	CERK	Q8TCT0	537 aa		19.77	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	ITGB4	P16144	1822 aa		19.77	■□□□□ 0.76
DNM1-222	ENST00000636280	GRM8	O00222	908 aa		19.77	■□□□□ 0.75
DNM1-222	ENST00000636280	MYD88	Q99836	296 aa		19.77	■□□□□ 0.75
DNM1-222	ENST00000636280	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		19.76	■□□□□ 0.75
DNM1-222	ENST00000636280	SRGAP3	O43295	1099 aa		19.76	■□□□□ 0.75
DNM1-222	ENST00000636280	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		19.76	■□□□□ 0.75
DNM1-222	ENST00000636280	C8orf37	Q96NL8	207 aa		19.76	■□□□□ 0.75
DNM1-222	ENST00000636280	UTY	O14607	1347 aa		19.76	■□□□□ 0.75
DNM1-222	ENST00000636280	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	19.76	■□□□□ 0.75
DNM1-222	ENST00000636280	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		19.76	■□□□□ 0.75
DNM1-222	ENST00000636280	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	19.75	■□□□□ 0.75
DNM1-222	ENST00000636280	NGLY1	Q96IV0	654 aa		19.75	■□□□□ 0.75
DNM1-222	ENST00000636280	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		19.75	■□□□□ 0.75

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