RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 ALDH1L2Q3SY69 923 aa25.32■■□□□ 1.64
CLN8-208ENST00000635751 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25.32■■□□□ 1.64
CLN8-208ENST00000635751 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CLN8-208ENST00000635751 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CLN8-208ENST00000635751 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa25.3■■□□□ 1.64
CLN8-208ENST00000635751 LAMB4A4D0S4 1761 aa25.29■■□□□ 1.64
CLN8-208ENST00000635751 CCDC30Q5VVM6 783 aa25.28■■□□□ 1.64
CLN8-208ENST00000635751 USP16Q9Y5T5 823 aa25.28■■□□□ 1.64
CLN8-208ENST00000635751 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
CLN8-208ENST00000635751 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
CLN8-208ENST00000635751 SKAP1Q86WV1 359 aa25.27■■□□□ 1.64
CLN8-208ENST00000635751 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CLN8-208ENST00000635751 PALLDQ8WX93 1383 aa25.27■■□□□ 1.64
CLN8-208ENST00000635751 TRIM37O94972 964 aa25.26■■□□□ 1.63
CLN8-208ENST00000635751 SLC4A9Q96Q91 983 aa25.26■■□□□ 1.63
CLN8-208ENST00000635751 AAMPQ13685 434 aa25.26■■□□□ 1.63
CLN8-208ENST00000635751 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CLN8-208ENST00000635751 SLC4A2P04920 1241 aa25.25■■□□□ 1.63
CLN8-208ENST00000635751 VSIG10Q8N0Z9 540 aa25.25■■□□□ 1.63
CLN8-208ENST00000635751 PANK1Q8TE04 598 aa25.25■■□□□ 1.63
CLN8-208ENST00000635751 CLUAP1Q96AJ1 413 aa25.24■■□□□ 1.63
CLN8-208ENST00000635751 STK31Q9BXU1 1019 aa25.24■■□□□ 1.63
CLN8-208ENST00000635751 CHMP4AQ9BY43 222 aa25.24■■□□□ 1.63
CLN8-208ENST00000635751 TJP1Q07157 1748 aa25.24■■□□□ 1.63
CLN8-208ENST00000635751 COG6Q9Y2V7 657 aa25.23■■□□□ 1.63
CLN8-208ENST00000635751 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CLN8-208ENST00000635751 CHPF2Q9P2E5 772 aa25.23■■□□□ 1.63
CLN8-208ENST00000635751 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CLN8-208ENST00000635751 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.22■■□□□ 1.63
CLN8-208ENST00000635751 SIK1P57059 783 aa25.22■■□□□ 1.63
CLN8-208ENST00000635751 DNAJC10Q8IXB1 793 aa25.22■■□□□ 1.63
CLN8-208ENST00000635751 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CLN8-208ENST00000635751 LY75O60449 1722 aa25.21■■□□□ 1.63
CLN8-208ENST00000635751 ATP6V1AP38606 617 aa25.21■■□□□ 1.63
CLN8-208ENST00000635751 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CLN8-208ENST00000635751 ANXA1P04083 346 aa25.2■■□□□ 1.62
CLN8-208ENST00000635751 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
CLN8-208ENST00000635751 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
CLN8-208ENST00000635751 KIF16BQ96L93 1317 aa25.2■■□□□ 1.62
CLN8-208ENST00000635751 G2E3Q7L622 706 aa25.19■■□□□ 1.62
CLN8-208ENST00000635751 ZNF831Q5JPB2 1677 aa25.18■■□□□ 1.62
CLN8-208ENST00000635751 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CLN8-208ENST00000635751 PDIA6Q15084 440 aa25.18■■□□□ 1.62
CLN8-208ENST00000635751 PROSER3Q2NL68 480 aa25.18■■□□□ 1.62
CLN8-208ENST00000635751 A1BGP04217 495 aa25.17■■□□□ 1.62
CLN8-208ENST00000635751 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa25.17■■□□□ 1.62
CLN8-208ENST00000635751 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CLN8-208ENST00000635751 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.62
CLN8-208ENST00000635751 TNNQ9UQP3 1299 aa25.16■■□□□ 1.62
CLN8-208ENST00000635751 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
CLN8-208ENST00000635751 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
CLN8-208ENST00000635751 STARD3NLO95772 234 aa25.16■■□□□ 1.62
CLN8-208ENST00000635751 IGHDP01880 384 aa25.16■■□□□ 1.62
CLN8-208ENST00000635751 MYL6BP14649 208 aa25.16■■□□□ 1.62
CLN8-208ENST00000635751 KCNQ4P56696 695 aa25.16■■□□□ 1.62
CLN8-208ENST00000635751 ITPK1Q13572 414 aa25.16■■□□□ 1.62
CLN8-208ENST00000635751 FAM161AQ3B820 660 aa25.16■■□□□ 1.62
CLN8-208ENST00000635751 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
CLN8-208ENST00000635751 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
CLN8-208ENST00000635751 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CLN8-208ENST00000635751 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CLN8-208ENST00000635751 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.15■■□□□ 1.62
CLN8-208ENST00000635751 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa25.14■■□□□ 1.62
CLN8-208ENST00000635751 NBPF26B4DH59 902 aa25.14■■□□□ 1.61
CLN8-208ENST00000635751 FLIIQ13045 1269 aa25.14■■□□□ 1.61
CLN8-208ENST00000635751 NBPF14Q5TI25 921 aa25.14■■□□□ 1.61
CLN8-208ENST00000635751 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
CLN8-208ENST00000635751 NBPF15Q8N660 670 aa25.14■■□□□ 1.61
CLN8-208ENST00000635751 HYPKQ9NX55 129 aa25.14■■□□□ 1.61
CLN8-208ENST00000635751 RLBP1P12271 317 aa25.13■■□□□ 1.61
CLN8-208ENST00000635751 TRIM27P14373 513 aa25.13■■□□□ 1.61
CLN8-208ENST00000635751 ARHGAP45Q92619 1136 aa25.13■■□□□ 1.61
CLN8-208ENST00000635751 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CLN8-208ENST00000635751 ERBB4Q15303 1308 aa25.12■■□□□ 1.61
CLN8-208ENST00000635751 APBA3O96018 575 aa25.12■■□□□ 1.61
CLN8-208ENST00000635751 RGS3P49796 1198 aa25.12■■□□□ 1.61
CLN8-208ENST00000635751 PTPRCP08575 1304 aa25.11■■□□□ 1.61
CLN8-208ENST00000635751 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
CLN8-208ENST00000635751 LRP10Q7Z4F1 713 aa25.1■■□□□ 1.61
CLN8-208ENST00000635751 C8orf34Q49A92 452 aa25.09■■□□□ 1.61
CLN8-208ENST00000635751 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CLN8-208ENST00000635751 MVPQ14764 893 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CLN8-208ENST00000635751 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CLN8-208ENST00000635751 LINC00116Q8NCU8 138 aa25.09■■□□□ 1.61
CLN8-208ENST00000635751 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
CLN8-208ENST00000635751 CRKLP46109 303 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
CLN8-208ENST00000635751 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa25.08■■□□□ 1.61
CLN8-208ENST00000635751 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CLN8-208ENST00000635751 XAGE3Q8WTP9 111 aa25.07■■□□□ 1.6
CLN8-208ENST00000635751 DDRGK1Q96HY6 314 aa25.07■■□□□ 1.6
CLN8-208ENST00000635751 PLSCR1O15162 318 aa25.07■■□□□ 1.6
CLN8-208ENST00000635751 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CLN8-208ENST00000635751 COPS6Q7L5N1 327 aa25.07■■□□□ 1.6
CLN8-208ENST00000635751 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.07■■□□□ 1.6
CLN8-208ENST00000635751 CCDC87Q9NVE4 849 aa25.07■■□□□ 1.6
CLN8-208ENST00000635751 RREB1Q92766 1687 aa25.06■■□□□ 1.6
CLN8-208ENST00000635751 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
CLN8-208ENST00000635751 F6X3S4 739 aa25.05■■□□□ 1.6
CLN8-208ENST00000635751 PROM2Q8N271 834 aa25.05■■□□□ 1.6
CLN8-208ENST00000635751 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms