RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000631199.2

CNTNAP2-208, Transcript of contactin associated protein like 2, human

TSL 3

Gene CNTNAP2, Length 650 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNTNAP2-208	ENST00000631199	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-208	ENST00000631199	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-208	ENST00000631199	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		10.21	□□□□□ -0.77
CNTNAP2-208	ENST00000631199	COL15A1	P39059	1388 aa		10.21	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	WDR90	Q96KV7	1748 aa		10.21	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199		H0YIN7	160 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	SLC39A6	Q13433	755 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	NARF	Q9UHQ1	456 aa		10.2	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	DDR1	Q08345	913 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	FSTL1	Q12841	308 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	TTLL6	Q8N841	843 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	CFAP53	Q96M91	514 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	LGR6	Q9HBX8	967 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	CACNA1S	Q13698	1873 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	SERPINB2	P05120	415 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	LMNB1	P20700	586 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	RRAGC	Q9HB90	399 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	MRC1	P22897	1456 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	KCNA3	P22001	575 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	TM4SF1	P30408	202 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	PDE6B	P35913	854 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	NFIX	Q14938	502 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	10.17	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	NEFM	P07197	916 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	ST5	P78524	1137 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	NUDC	Q9Y266	331 aa		10.16	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	SETDB2	Q96T68	719 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CNTNAP2-208	ENST00000631199	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		10.15	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	RASSF7	Q02833	373 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	ZNF790	Q6PG37	636 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	CNBD1	Q8NA66	436 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	SCN7A	Q01118	1682 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	GLTPD2	A6NH11	291 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	BTBD11	A6QL63	1104 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	SOGA3	Q5TF21	947 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	KLRG1	Q96E93	195 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	ERFE	Q4G0M1	354 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	CNKSR1	Q969H4	720 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	C21orf2	O43822	256 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	HTRA3	P83110	453 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	10.11	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	PRKAR2B	P31323	418 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	A1BG	P04217	495 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-208	ENST00000631199	MASTL	Q96GX5	879 aa		10.09	□□□□□ -0.79

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