RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP37.23■■■■□ 3.55
CAPNS1-217ENST00000629983 COL15A1P39059 1388 aa37.22■■■■□ 3.55
CAPNS1-217ENST00000629983 NFIXQ14938 502 aa37.22■■■■□ 3.55
CAPNS1-217ENST00000629983 RNMTO43148 476 aaKnown RBP37.21■■■■□ 3.55
CAPNS1-217ENST00000629983 SMC1BQ8NDV3 1235 aa37.21■■■■□ 3.55
CAPNS1-217ENST00000629983 NARFQ9UHQ1 456 aa37.21■■■■□ 3.55
CAPNS1-217ENST00000629983 HMOX1P09601 288 aa37.2■■■■□ 3.55
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa37.2■■■■□ 3.55
CAPNS1-217ENST00000629983 SCN11AQ9UI33 1791 aa37.19■■■■□ 3.54
CAPNS1-217ENST00000629983 SERPINB2P05120 415 aa37.17■■■■□ 3.54
CAPNS1-217ENST00000629983 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa37.17■■■■□ 3.54
CAPNS1-217ENST00000629983 LMNB1P20700 586 aa37.16■■■■□ 3.54
CAPNS1-217ENST00000629983 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP37.15■■■■□ 3.54
CAPNS1-217ENST00000629983 TTLL6Q8N841 843 aa37.15■■■■□ 3.54
CAPNS1-217ENST00000629983 JMYQ8N9B5 988 aa37.15■■■■□ 3.54
CAPNS1-217ENST00000629983 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP37.15■■■■□ 3.54
CAPNS1-217ENST00000629983 CANXP27824 592 aaKnown RBP37.14■■■■□ 3.54
CAPNS1-217ENST00000629983 C2CD5Q86YS7 1000 aa37.14■■■■□ 3.54
CAPNS1-217ENST00000629983 MRC1P22897 1456 aa37.13■■■■□ 3.54
CAPNS1-217ENST00000629983 BICDL1Q6ZP65 573 aa37.13■■■■□ 3.53
CAPNS1-217ENST00000629983 BCL2L12Q9HB09 334 aa37.12■■■■□ 3.53
CAPNS1-217ENST00000629983 H0YIN7 160 aa37.1■■■■□ 3.53
CAPNS1-217ENST00000629983 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP37.1■■■■□ 3.53
CAPNS1-217ENST00000629983 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP37.1■■■■□ 3.53
CAPNS1-217ENST00000629983 TTC5Q8N0Z6 440 aa37.1■■■■□ 3.53
CAPNS1-217ENST00000629983 GLTPD2A6NH11 291 aa37.09■■■■□ 3.53
CAPNS1-217ENST00000629983 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP37.09■■■■□ 3.53
CAPNS1-217ENST00000629983 VSIG10Q8N0Z9 540 aa37.09■■■■□ 3.53
CAPNS1-217ENST00000629983 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP37.08■■■■□ 3.53
CAPNS1-217ENST00000629983 CARMIL3Q8ND23 1372 aa37.06■■■■□ 3.52
CAPNS1-217ENST00000629983 STARD3NLO95772 234 aa37.06■■■■□ 3.52
CAPNS1-217ENST00000629983 PRELPP51888 382 aa37.06■■■■□ 3.52
CAPNS1-217ENST00000629983 SBF1O95248 1867 aa37.05■■■■□ 3.52
CAPNS1-217ENST00000629983 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP37.04■■■■□ 3.52
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP37.04■■■■□ 3.52
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A087WZG4 1122 aa37.03■■■■□ 3.52
CAPNS1-217ENST00000629983 CAPN15O75808 1086 aa37.03■■■■□ 3.52
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP37.03■■■■□ 3.52
CAPNS1-217ENST00000629983 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP37.03■■■■□ 3.52
CAPNS1-217ENST00000629983 NFKBIEO00221 500 aa37.02■■■■□ 3.52
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP37.02■■■■□ 3.52
CAPNS1-217ENST00000629983 NRXN2Q9P2S2 1712 aa37.02■■■■□ 3.52
CAPNS1-217ENST00000629983 TNS4Q8IZW8 715 aa37■■■■□ 3.51
CAPNS1-217ENST00000629983 EIF5P55010 431 aaKnown RBP36.98■■■■□ 3.51
CAPNS1-217ENST00000629983 TEFQ10587 303 aa36.98■■■■□ 3.51
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D9BQ66K14 1250 aa36.98■■■■□ 3.51
CAPNS1-217ENST00000629983 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP36.97■■■■□ 3.51
CAPNS1-217ENST00000629983 DPY19L2Q6NUT2 758 aa36.97■■■■□ 3.51
CAPNS1-217ENST00000629983 NPHP1O15259 732 aa36.96■■■■□ 3.51
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC24Q8N4L8 307 aa36.96■■■■□ 3.51
CAPNS1-217ENST00000629983 C21orf2O43822 256 aa36.95■■■■□ 3.51
CAPNS1-217ENST00000629983 PDE6BP35913 854 aa36.95■■■■□ 3.51
CAPNS1-217ENST00000629983 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP36.95■■■■□ 3.51
CAPNS1-217ENST00000629983 DLEC1Q9Y238 1755 aa36.95■■■■□ 3.51
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP36.94■■■■□ 3.5
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa36.94■■■■□ 3.5
CAPNS1-217ENST00000629983 TIAM2Q8IVF5 1701 aa36.93■■■■□ 3.5
CAPNS1-217ENST00000629983 KIF7Q2M1P5 1343 aa36.93■■■■□ 3.5
CAPNS1-217ENST00000629983 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP36.93■■■■□ 3.5
CAPNS1-217ENST00000629983 BRIP1Q9BX63 1249 aa36.93■■■■□ 3.5
CAPNS1-217ENST00000629983 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa36.93■■■■□ 3.5
CAPNS1-217ENST00000629983 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP36.92■■■■□ 3.5
CAPNS1-217ENST00000629983 ERFEQ4G0M1 354 aa36.92■■■■□ 3.5
CAPNS1-217ENST00000629983 HEG1Q9ULI3 1381 aa36.91■■■■□ 3.5
CAPNS1-217ENST00000629983 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP36.91■■■■□ 3.5
CAPNS1-217ENST00000629983 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP36.91■■■■□ 3.5
CAPNS1-217ENST00000629983 PRR5LQ6MZQ0 368 aa36.91■■■■□ 3.5
CAPNS1-217ENST00000629983 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP36.91■■■■□ 3.5
CAPNS1-217ENST00000629983 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP36.91■■■■□ 3.5
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF790Q6PG37 636 aa36.9■■■■□ 3.5
CAPNS1-217ENST00000629983 GAS2L2Q8NHY3 880 aa36.89■■■■□ 3.5
CAPNS1-217ENST00000629983 GNAT3A8MTJ3 354 aa36.88■■■■□ 3.49
CAPNS1-217ENST00000629983 UBR2Q8IWV8 1755 aa36.88■■■■□ 3.49
CAPNS1-217ENST00000629983 CNBD1Q8NA66 436 aa36.87■■■■□ 3.49
CAPNS1-217ENST00000629983 POTECB2RU33 542 aa36.86■■■■□ 3.49
CAPNS1-217ENST00000629983 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP36.86■■■■□ 3.49
CAPNS1-217ENST00000629983 IL17REQ8NFR9 667 aa36.86■■■■□ 3.49
CAPNS1-217ENST00000629983 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP36.86■■■■□ 3.49
CAPNS1-217ENST00000629983 FMNL2Q96PY5 1086 aa36.85■■■■□ 3.49
CAPNS1-217ENST00000629983 SETDB2Q96T68 719 aa36.85■■■■□ 3.49
CAPNS1-217ENST00000629983 TAOK3Q9H2K8 898 aa36.85■■■■□ 3.49
CAPNS1-217ENST00000629983 ST5P78524 1137 aa36.84■■■■□ 3.49
CAPNS1-217ENST00000629983 A1BGP04217 495 aa36.83■■■■□ 3.49
CAPNS1-217ENST00000629983 SCN7AQ01118 1682 aa36.83■■■■□ 3.49
CAPNS1-217ENST00000629983 CNKSR1Q969H4 720 aa36.82■■■■□ 3.48
CAPNS1-217ENST00000629983 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP36.79■■■■□ 3.48
CAPNS1-217ENST00000629983 CAMTA2O94983 1202 aa36.79■■■■□ 3.48
CAPNS1-217ENST00000629983 CHADLQ6NUI6 762 aa36.79■■■■□ 3.48
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa36.79■■■■□ 3.48
CAPNS1-217ENST00000629983 STYK1Q6J9G0 422 aa36.78■■■■□ 3.48
CAPNS1-217ENST00000629983 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
CAPNS1-217ENST00000629983 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
CAPNS1-217ENST00000629983 LTBP3Q9NS15 1303 aa36.78■■■■□ 3.48
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa36.77■■■■□ 3.48
CAPNS1-217ENST00000629983 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP36.77■■■■□ 3.48
CAPNS1-217ENST00000629983 DDNO94850 711 aaPredicted RBP36.77■■■■□ 3.48
CAPNS1-217ENST00000629983 SOGA3Q5TF21 947 aa36.76■■■■□ 3.48
CAPNS1-217ENST00000629983 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP36.75■■■■□ 3.47
CAPNS1-217ENST00000629983 BTBD11A6QL63 1104 aa36.75■■■■□ 3.47
CAPNS1-217ENST00000629983 MASTLQ96GX5 879 aa36.75■■■■□ 3.47
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