RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617958.4

CPEB1-215, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CPEB1, Length 2,776 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CPEB1-215	ENST00000617958	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	SOX12	O15370	315 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	TNNT1	P13805	278 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	MPND	Q8N594	471 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	MMP14	P50281	582 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	SSH2	Q76I76	1423 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	ERO1A	Q96HE7	468 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	RAD50	Q92878	1312 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	SDS	P20132	328 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	AP5Z1	O43299	807 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	NEK4	P51957	841 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	CCDC192	P0DO97	292 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	MCC	P23508	829 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	NME9	Q86XW9	330 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	TECPR2	O15040	1411 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	NEMF	O60524	1076 aa		12.77	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	PTGS1	P23219	599 aa		12.77	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	KCND1	Q9NSA2	647 aa		12.77	□□□□□ -0.36
CPEB1-215	ENST00000617958	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	CEP135	Q66GS9	1140 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	ORAI2	Q96SN7	254 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	CPS1	P31327	1500 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	CDC25B	P30305	580 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	IFT57	Q9NWB7	429 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	ERICH4	A6NGS2	130 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	TCHH	Q07283	1943 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	FYB1	O15117	783 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	DLC1	Q96QB1	1528 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	ACE	P12821	1306 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	TEX35	Q5T0J7	233 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	SPC24	Q8NBT2	197 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	ATP10D	Q9P241	1426 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		12.75	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	ATP7B	P35670	1465 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	VAMP4	O75379	141 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		12.74	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	STRC	Q7RTU9	1775 aa		12.73	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	ATP8B1	O43520	1251 aa		12.73	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	ELP1	O95163	1332 aa		12.73	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	TPM4	P67936	248 aa		12.73	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	PLCB2	Q00722	1185 aa		12.73	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		12.73	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	PTPRC	P08575	1304 aa		12.72	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	CAVIN2	O95810	425 aa		12.72	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	12.72	□□□□□ -0.37
CPEB1-215	ENST00000617958	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		12.72	□□□□□ -0.37

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