RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609232.5

CTCFL-222, Transcript of CCCTC-binding factor like, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 3,668 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTCFL-222	ENST00000609232	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	12.12	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	FLII	Q13045	1269 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	SMIM5	Q71RC9	77 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	MPND	Q8N594	471 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		12.12	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	PLCB2	Q00722	1185 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	PTPRC	P08575	1304 aa		12.11	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	STRC	Q7RTU9	1775 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	CABP4	P57796	275 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		12.1	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	BTG4	Q9NY30	223 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	ABCC4	O15439	1325 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	SLIT3	O75094	1523 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	C8orf34	Q49A92	452 aa		12.09	□□□□□ -0.47
CTCFL-222	ENST00000609232	SRGAP3	O43295	1099 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	PHKG2	P15735	406 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	GPT	P24298	496 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	BECN1	Q14457	450 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	PXDN	Q92626	1479 aa		12.08	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	ARID3A	Q99856	593 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	FBXO3	Q9UK99	471 aa		12.07	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	CYP27B1	O15528	508 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	HSCB	Q8IWL3	235 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	IL2RB	P14784	551 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	PROSER3	Q2NL68	480 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		12.06	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF790	Q6PG37	636 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	DCAF5	Q96JK2	942 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	HMMR	O75330	724 aa		12.05	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	PCNT	O95613	3336 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	TOM1	O60784	492 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	GNAI2	P04899	355 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	SMC5	Q8IY18	1101 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	12.04	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	CPD	O75976	1380 aa		12.04	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	MEGF6	O75095	1541 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	GNAI3	P08754	354 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	GCC1	Q96CN9	775 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	CPA1	P15085	419 aa		12.03	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		12.02	□□□□□ -0.48
CTCFL-222	ENST00000609232	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	ALS2	Q96Q42	1657 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	MYD88	Q99836	296 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	RGPD5	Q99666	1765 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	USP54	Q70EL1	1684 aa		12.02	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		12.01	□□□□□ -0.49
CTCFL-222	ENST00000609232	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49

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