RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591598.5

CTDP1-207, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTDP1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-207ENST00000591598 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
CTDP1-207ENST00000591598 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CTDP1-207ENST00000591598 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CTDP1-207ENST00000591598 ANKARQ7Z5J8 1434 aa20.41■□□□□ 0.86
CTDP1-207ENST00000591598 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa20.4■□□□□ 0.86
CTDP1-207ENST00000591598 ANKRD24Q8TF21 1146 aa20.4■□□□□ 0.86
CTDP1-207ENST00000591598 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa20.4■□□□□ 0.86
CTDP1-207ENST00000591598 SALL3Q9BXA9 1300 aa20.4■□□□□ 0.86
CTDP1-207ENST00000591598 SSH3Q8TE77 659 aa20.4■□□□□ 0.86
CTDP1-207ENST00000591598 KCNH5Q8NCM2 988 aa20.39■□□□□ 0.85
CTDP1-207ENST00000591598 SPG7Q9UQ90 795 aa20.39■□□□□ 0.85
CTDP1-207ENST00000591598 SLC39A6Q13433 755 aa20.39■□□□□ 0.85
CTDP1-207ENST00000591598 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CTDP1-207ENST00000591598 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CTDP1-207ENST00000591598 AXIN2Q9Y2T1 843 aa20.38■□□□□ 0.85
CTDP1-207ENST00000591598 ZDHHC9Q9Y397 364 aa20.38■□□□□ 0.85
CTDP1-207ENST00000591598 BEND3Q5T5X7 828 aa20.38■□□□□ 0.85
CTDP1-207ENST00000591598 NWD1Q149M9 1564 aa20.38■□□□□ 0.85
CTDP1-207ENST00000591598 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CTDP1-207ENST00000591598 KLHL40Q2TBA0 621 aa20.38■□□□□ 0.85
CTDP1-207ENST00000591598 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CTDP1-207ENST00000591598 AKAP4Q5JQC9 854 aa20.37■□□□□ 0.85
CTDP1-207ENST00000591598 MYL6BP14649 208 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDP1-207ENST00000591598 PTMSP20962 102 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDP1-207ENST00000591598 KIF1BPQ96EK5 621 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDP1-207ENST00000591598 SIL1Q9H173 461 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDP1-207ENST00000591598 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDP1-207ENST00000591598 LMBRD1Q9NUN5 540 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDP1-207ENST00000591598 NLRP2Q9NX02 1062 aa20.36■□□□□ 0.85
CTDP1-207ENST00000591598 RNMTO43148 476 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CTDP1-207ENST00000591598 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CTDP1-207ENST00000591598 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CTDP1-207ENST00000591598 CPA1P15085 419 aa20.35■□□□□ 0.85
CTDP1-207ENST00000591598 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CTDP1-207ENST00000591598 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CTDP1-207ENST00000591598 STAP2Q9UGK3 403 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDP1-207ENST00000591598 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDP1-207ENST00000591598 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa20.34■□□□□ 0.85
CTDP1-207ENST00000591598 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CTDP1-207ENST00000591598 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CTDP1-207ENST00000591598 BABAM1Q9NWV8 329 aa20.33■□□□□ 0.85
CTDP1-207ENST00000591598 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa20.33■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 RAB11FIP3O75154 756 aa20.32■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa20.32■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 KRT28Q7Z3Y7 464 aa20.32■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 ARHGEF25Q86VW2 580 aa20.32■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 PI4K2BQ8TCG2 481 aa20.32■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 CNTROBQ8N137 903 aa20.32■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 CABLES1Q8TDN4 633 aa20.32■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 KLHDC4Q8TBB5 520 aa20.32■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 GPT2Q8TD30 523 aa20.32■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa20.32■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 ADCY9O60503 1353 aa20.31■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 POLA2Q14181 598 aa20.31■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 AMOTQ4VCS5 1084 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 AACSQ86V21 672 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 SYCE3A1L190 88 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 RNF214Q8ND24 703 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 PXDNQ92626 1479 aa20.3■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 RIC3Q7Z5B4 369 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 RASEFQ8IZ41 740 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 ERBB4Q15303 1308 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 LTN1O94822 1766 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 CHRNA2Q15822 529 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa20.29■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 ESPNB1AK53 854 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 KCNJ4P48050 445 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 CLEC17AQ6ZS10 378 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 KSR2Q6VAB6 950 aa20.28■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 SGSM2O43147 1006 aa20.27■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 MCM2P49736 904 aa20.27■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa20.27■□□□□ 0.84
CTDP1-207ENST00000591598 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 RGPD2P0DJD1 1756 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 CASTP20810 708 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 HSPA4P34932 840 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 SUCLG2Q96I99 432 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 TMEM63CQ9P1W3 806 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 ANAPC15P60006 121 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 SNX14Q9Y5W7 946 aa20.26■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 RBSNQ9H1K0 784 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 HOXB7P09629 217 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa20.25■□□□□ 0.83
CTDP1-207ENST00000591598 BOLA2Q9H3K6 86 aa20.25■□□□□ 0.83
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