RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590509.5

PTPRS-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRS, Length 893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-208ENST00000590509 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRS-208ENST00000590509 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRS-208ENST00000590509 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRS-208ENST00000590509 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PTPRS-208ENST00000590509 LGR6Q9HBX8 967 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRS-208ENST00000590509 SLC39A6Q13433 755 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRS-208ENST00000590509 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRS-208ENST00000590509 GLTPD2A6NH11 291 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRS-208ENST00000590509 NFKBIEO00221 500 aa22.08■■□□□ 1.13
PTPRS-208ENST00000590509 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
PTPRS-208ENST00000590509 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PTPRS-208ENST00000590509 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRS-208ENST00000590509 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.07■■□□□ 1.12
PTPRS-208ENST00000590509 LMNB1P20700 586 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRS-208ENST00000590509 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.06■■□□□ 1.12
PTPRS-208ENST00000590509 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRS-208ENST00000590509 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PTPRS-208ENST00000590509 PANK3Q9H999 370 aa22.05■■□□□ 1.12
PTPRS-208ENST00000590509 COL15A1P39059 1388 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRS-208ENST00000590509 ZPR1O75312 459 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRS-208ENST00000590509 SERPINB2P05120 415 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRS-208ENST00000590509 NARFQ9UHQ1 456 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRS-208ENST00000590509 IL13P35225 146 aa22.03■■□□□ 1.12
PTPRS-208ENST00000590509 POTEIP0CG38 1075 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRS-208ENST00000590509 POTEJP0CG39 1038 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRS-208ENST00000590509 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRS-208ENST00000590509 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRS-208ENST00000590509 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRS-208ENST00000590509 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PTPRS-208ENST00000590509 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
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PTPRS-208ENST00000590509 MRC1P22897 1456 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
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PTPRS-208ENST00000590509 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRS-208ENST00000590509 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PTPRS-208ENST00000590509 AKAP4Q5JQC9 854 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRS-208ENST00000590509 UBR2Q8IWV8 1755 aa21.97■■□□□ 1.11
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PTPRS-208ENST00000590509 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRS-208ENST00000590509 MORC1Q86VD1 984 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRS-208ENST00000590509 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PTPRS-208ENST00000590509 C21orf2O43822 256 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRS-208ENST00000590509 HMOX1P09601 288 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRS-208ENST00000590509 CACNA1SQ13698 1873 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRS-208ENST00000590509 H0YIN7 160 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRS-208ENST00000590509 SLX4Q8IY92 1834 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRS-208ENST00000590509 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRS-208ENST00000590509 DDNO94850 711 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
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PTPRS-208ENST00000590509 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP21.92■■□□□ 1.1
PTPRS-208ENST00000590509 SCN7AQ01118 1682 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRS-208ENST00000590509 FOXN1O15353 648 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRS-208ENST00000590509 ERFEQ4G0M1 354 aa21.91■■□□□ 1.1
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PTPRS-208ENST00000590509 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.89■■□□□ 1.09
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PTPRS-208ENST00000590509 DPY19L2Q6NUT2 758 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRS-208ENST00000590509 VSIG10Q8N0Z9 540 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PTPRS-208ENST00000590509 BRIP1Q9BX63 1249 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRS-208ENST00000590509 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PTPRS-208ENST00000590509 CNTNAP1P78357 1384 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRS-208ENST00000590509 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PTPRS-208ENST00000590509 PASKQ96RG2 1323 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRS-208ENST00000590509 A1BGP04217 495 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRS-208ENST00000590509 TAOK3Q9H2K8 898 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PTPRS-208ENST00000590509 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRS-208ENST00000590509 LTBP3Q9NS15 1303 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRS-208ENST00000590509 KCNQ3O43525 872 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRS-208ENST00000590509 CAMTA2O94983 1202 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRS-208ENST00000590509 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PTPRS-208ENST00000590509 OLFM4Q6UX06 510 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRS-208ENST00000590509 IL17REQ8NFR9 667 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRS-208ENST00000590509 HEG1Q9ULI3 1381 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRS-208ENST00000590509 PDE6BP35913 854 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRS-208ENST00000590509 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
PTPRS-208ENST00000590509 VEGFBP49765 207 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRS-208ENST00000590509 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.81■■□□□ 1.08
PTPRS-208ENST00000590509 BCORQ6W2J9 1755 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRS-208ENST00000590509 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PTPRS-208ENST00000590509 SRGNP10124 158 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRS-208ENST00000590509 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF541Q9H0D2 1346 aa21.8■■□□□ 1.08
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PTPRS-208ENST00000590509 C7orf43Q8WVR3 580 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRS-208ENST00000590509 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRS-208ENST00000590509 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRS-208ENST00000590509 A0A087WZG4 1122 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF790Q6PG37 636 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRS-208ENST00000590509 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRS-208ENST00000590509 SCN4AP35499 1836 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRS-208ENST00000590509 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRS-208ENST00000590509 TTC5Q8N0Z6 440 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRS-208ENST00000590509 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
PTPRS-208ENST00000590509 STYK1Q6J9G0 422 aa21.76■■□□□ 1.07
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