RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589550.1

PIK3C3-211, Transcript of phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

TSL 3

Gene PIK3C3, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3-211ENST00000589550 SORBS3O60504 671 aa8.18□□□□□ -1.1
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PIK3C3-211ENST00000589550 SKOR1P84550 965 aa8.18□□□□□ -1.1
PIK3C3-211ENST00000589550 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
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PIK3C3-211ENST00000589550 EHBP1Q8NDI1 1231 aa8.18□□□□□ -1.1
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PIK3C3-211ENST00000589550 USP5P45974 858 aa8.16□□□□□ -1.1
PIK3C3-211ENST00000589550 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PIK3C3-211ENST00000589550 ALG1LQ6GMV1 187 aa8.16□□□□□ -1.1
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PIK3C3-211ENST00000589550 CDK2AP1O14519 115 aa8.15□□□□□ -1.1
PIK3C3-211ENST00000589550 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
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PIK3C3-211ENST00000589550 LDLRAD1Q5T700 205 aa8.15□□□□□ -1.1
PIK3C3-211ENST00000589550 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PIK3C3-211ENST00000589550 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PIK3C3-211ENST00000589550 PIK3R5Q8WYR1 880 aa8.15□□□□□ -1.1
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PIK3C3-211ENST00000589550 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.15□□□□□ -1.1
PIK3C3-211ENST00000589550 RNF223E7ERA6 249 aa8.14□□□□□ -1.11
PIK3C3-211ENST00000589550 ADH1CP00326 375 aa8.14□□□□□ -1.11
PIK3C3-211ENST00000589550 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
PIK3C3-211ENST00000589550 TBCELQ5QJ74 424 aa8.14□□□□□ -1.11
PIK3C3-211ENST00000589550 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
PIK3C3-211ENST00000589550 GJD3Q8N144 294 aa8.14□□□□□ -1.11
PIK3C3-211ENST00000589550 VTI1BQ9UEU0 232 aa8.14□□□□□ -1.11
PIK3C3-211ENST00000589550 LRFN2Q9ULH4 789 aa8.14□□□□□ -1.11
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PIK3C3-211ENST00000589550 FBF1Q8TES7 1133 aa8.13□□□□□ -1.11
PIK3C3-211ENST00000589550 RNF34Q969K3 372 aa8.13□□□□□ -1.11
PIK3C3-211ENST00000589550 TGIF2Q9GZN2 237 aa8.13□□□□□ -1.11
PIK3C3-211ENST00000589550 SERTM1A2A2V5 107 aa8.12□□□□□ -1.11
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PIK3C3-211ENST00000589550 FRMD6Q96NE9 622 aa8.12□□□□□ -1.11
PIK3C3-211ENST00000589550 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa8.12□□□□□ -1.11
PIK3C3-211ENST00000589550 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PIK3C3-211ENST00000589550 POLIQ9UNA4 740 aa8.12□□□□□ -1.11
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PIK3C3-211ENST00000589550 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa8.12□□□□□ -1.11
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PIK3C3-211ENST00000589550 GNA15P30679 374 aa8.11□□□□□ -1.11
PIK3C3-211ENST00000589550 RTN1Q16799 776 aa8.11□□□□□ -1.11
PIK3C3-211ENST00000589550 C11orf91Q3C1V1 193 aa8.11□□□□□ -1.11
PIK3C3-211ENST00000589550 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa8.11□□□□□ -1.11
PIK3C3-211ENST00000589550 NIF3L1Q9GZT8 377 aa8.11□□□□□ -1.11
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PIK3C3-211ENST00000589550 EML1O00423 815 aa8.1□□□□□ -1.11
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PIK3C3-211ENST00000589550 PCSK2P16519 638 aa8.1□□□□□ -1.11
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF76P36508 570 aa8.1□□□□□ -1.11
PIK3C3-211ENST00000589550 C9orf131Q5VYM1 1079 aa8.1□□□□□ -1.11
PIK3C3-211ENST00000589550 SLC43A3Q8NBI5 491 aa8.1□□□□□ -1.11
PIK3C3-211ENST00000589550 CNKSR1Q969H4 720 aa8.1□□□□□ -1.11
PIK3C3-211ENST00000589550 CCSER2Q9H7U1 834 aa8.1□□□□□ -1.11
PIK3C3-211ENST00000589550 HRH3Q9Y5N1 445 aa8.1□□□□□ -1.11
PIK3C3-211ENST00000589550 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PIK3C3-211ENST00000589550 ZBTB39O15060 712 aa8.09□□□□□ -1.11
PIK3C3-211ENST00000589550 SIAH2O43255 324 aa8.09□□□□□ -1.11
PIK3C3-211ENST00000589550 NOS2P35228 1153 aa8.09□□□□□ -1.11
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PIK3C3-211ENST00000589550 ATCAYQ86WG3 371 aa8.09□□□□□ -1.11
PIK3C3-211ENST00000589550 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa8.09□□□□□ -1.11
PIK3C3-211ENST00000589550 NGLY1Q96IV0 654 aa8.09□□□□□ -1.11
PIK3C3-211ENST00000589550 WWC3Q9ULE0 1092 aa8.09□□□□□ -1.11
PIK3C3-211ENST00000589550 PDGFAP04085 211 aa8.08□□□□□ -1.12
PIK3C3-211ENST00000589550 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
PIK3C3-211ENST00000589550 ADH1AP07327 375 aa8.08□□□□□ -1.12
PIK3C3-211ENST00000589550 ZAP70P43403 619 aa8.08□□□□□ -1.12
PIK3C3-211ENST00000589550 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
PIK3C3-211ENST00000589550 CLN3Q13286 438 aa8.08□□□□□ -1.12
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