RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588918.5

MFSD12-208, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 12, human

TSL 5

Gene MFSD12, Length 2,040 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD12-208	ENST00000588918	C5	P01031	1676 aa		32.54	■■■□□ 2.8
MFSD12-208	ENST00000588918	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		32.54	■■■□□ 2.8
MFSD12-208	ENST00000588918	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		32.53	■■■□□ 2.8
MFSD12-208	ENST00000588918	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	32.53	■■■□□ 2.8
MFSD12-208	ENST00000588918	MS4A1	P11836	297 aa		32.53	■■■□□ 2.8
MFSD12-208	ENST00000588918	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		32.52	■■■□□ 2.8
MFSD12-208	ENST00000588918	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
MFSD12-208	ENST00000588918	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		32.52	■■■□□ 2.8
MFSD12-208	ENST00000588918	FLII	Q13045	1269 aa		32.51	■■■□□ 2.8
MFSD12-208	ENST00000588918	PROSER3	Q2NL68	480 aa		32.51	■■■□□ 2.8
MFSD12-208	ENST00000588918	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		32.51	■■■□□ 2.8
MFSD12-208	ENST00000588918	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.79
MFSD12-208	ENST00000588918	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	32.5	■■■□□ 2.79
MFSD12-208	ENST00000588918	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
MFSD12-208	ENST00000588918	PTPRC	P08575	1304 aa		32.49	■■■□□ 2.79
MFSD12-208	ENST00000588918	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
MFSD12-208	ENST00000588918	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		32.48	■■■□□ 2.79
MFSD12-208	ENST00000588918	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		32.48	■■■□□ 2.79
MFSD12-208	ENST00000588918	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		32.48	■■■□□ 2.79
MFSD12-208	ENST00000588918	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
MFSD12-208	ENST00000588918	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
MFSD12-208	ENST00000588918	PDIA6	Q15084	440 aa		32.47	■■■□□ 2.79
MFSD12-208	ENST00000588918	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
MFSD12-208	ENST00000588918	CACNA1F	O60840	1977 aa		32.46	■■■□□ 2.79
MFSD12-208	ENST00000588918		F6X3S4	739 aa		32.46	■■■□□ 2.79
MFSD12-208	ENST00000588918	RGS12	O14924	1447 aa		32.46	■■■□□ 2.79
MFSD12-208	ENST00000588918	ABCC4	O15439	1325 aa		32.45	■■■□□ 2.79
MFSD12-208	ENST00000588918	MYL6B	P14649	208 aa		32.44	■■■□□ 2.78
MFSD12-208	ENST00000588918	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		32.44	■■■□□ 2.78
MFSD12-208	ENST00000588918	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	32.44	■■■□□ 2.78
MFSD12-208	ENST00000588918	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		32.42	■■■□□ 2.78
MFSD12-208	ENST00000588918	RXRB	P28702	533 aa		32.41	■■■□□ 2.78
MFSD12-208	ENST00000588918	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		32.41	■■■□□ 2.78
MFSD12-208	ENST00000588918	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		32.41	■■■□□ 2.78
MFSD12-208	ENST00000588918	HYPK	Q9NX55	129 aa		32.41	■■■□□ 2.78
MFSD12-208	ENST00000588918	A1BG	P04217	495 aa		32.4	■■■□□ 2.78
MFSD12-208	ENST00000588918	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		32.4	■■■□□ 2.78
MFSD12-208	ENST00000588918	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		32.4	■■■□□ 2.78
MFSD12-208	ENST00000588918	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		32.39	■■■□□ 2.78
MFSD12-208	ENST00000588918	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
MFSD12-208	ENST00000588918	POTEA	Q6S8J7	498 aa		32.39	■■■□□ 2.78
MFSD12-208	ENST00000588918	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		32.38	■■■□□ 2.77
MFSD12-208	ENST00000588918	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		32.37	■■■□□ 2.77
MFSD12-208	ENST00000588918	NBPF26	B4DH59	902 aa		32.37	■■■□□ 2.77
MFSD12-208	ENST00000588918	NBPF14	Q5TI25	921 aa		32.37	■■■□□ 2.77
MFSD12-208	ENST00000588918	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
MFSD12-208	ENST00000588918	NBPF15	Q8N660	670 aa		32.37	■■■□□ 2.77
MFSD12-208	ENST00000588918	EP400	Q96L91	3159 aa		32.36	■■■□□ 2.77
MFSD12-208	ENST00000588918	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
MFSD12-208	ENST00000588918	PALLD	Q8WX93	1383 aa		32.36	■■■□□ 2.77
MFSD12-208	ENST00000588918	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		32.35	■■■□□ 2.77
MFSD12-208	ENST00000588918	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
MFSD12-208	ENST00000588918	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		32.35	■■■□□ 2.77
MFSD12-208	ENST00000588918	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		32.35	■■■□□ 2.77
MFSD12-208	ENST00000588918	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
MFSD12-208	ENST00000588918	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		32.34	■■■□□ 2.77
MFSD12-208	ENST00000588918	SIK1	P57059	783 aa		32.34	■■■□□ 2.77
MFSD12-208	ENST00000588918	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		32.34	■■■□□ 2.77
MFSD12-208	ENST00000588918	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	32.34	■■■□□ 2.77
MFSD12-208	ENST00000588918	COPS6	Q7L5N1	327 aa		32.33	■■■□□ 2.77
MFSD12-208	ENST00000588918	STARD3NL	O95772	234 aa		32.33	■■■□□ 2.77
MFSD12-208	ENST00000588918	ATP6V1A	P38606	617 aa		32.33	■■■□□ 2.77
MFSD12-208	ENST00000588918	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	32.31	■■■□□ 2.76
MFSD12-208	ENST00000588918	ADCY9	O60503	1353 aa		32.3	■■■□□ 2.76
MFSD12-208	ENST00000588918	SBF2	Q86WG5	1849 aa		32.3	■■■□□ 2.76
MFSD12-208	ENST00000588918	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	32.3	■■■□□ 2.76
MFSD12-208	ENST00000588918	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		32.3	■■■□□ 2.76
MFSD12-208	ENST00000588918	ERBB4	Q15303	1308 aa		32.3	■■■□□ 2.76
MFSD12-208	ENST00000588918	NHS	Q6T4R5	1651 aa		32.3	■■■□□ 2.76
MFSD12-208	ENST00000588918	KSR2	Q6VAB6	950 aa		32.29	■■■□□ 2.76
MFSD12-208	ENST00000588918	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		32.29	■■■□□ 2.76
MFSD12-208	ENST00000588918	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		32.29	■■■□□ 2.76
MFSD12-208	ENST00000588918	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		32.29	■■■□□ 2.76
MFSD12-208	ENST00000588918	BTAF1	O14981	1849 aa		32.28	■■■□□ 2.76
MFSD12-208	ENST00000588918	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
MFSD12-208	ENST00000588918	KCNQ4	P56696	695 aa		32.27	■■■□□ 2.76
MFSD12-208	ENST00000588918	ITPK1	Q13572	414 aa		32.27	■■■□□ 2.76
MFSD12-208	ENST00000588918	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
MFSD12-208	ENST00000588918	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		32.27	■■■□□ 2.76
MFSD12-208	ENST00000588918	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.76
MFSD12-208	ENST00000588918	TJP1	Q07157	1748 aa		32.26	■■■□□ 2.75
MFSD12-208	ENST00000588918	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
MFSD12-208	ENST00000588918	AAMP	Q13685	434 aa		32.24	■■■□□ 2.75
MFSD12-208	ENST00000588918	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		32.24	■■■□□ 2.75
MFSD12-208	ENST00000588918	TRIM37	O94972	964 aa		32.24	■■■□□ 2.75
MFSD12-208	ENST00000588918	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		32.24	■■■□□ 2.75
MFSD12-208	ENST00000588918	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		32.24	■■■□□ 2.75
MFSD12-208	ENST00000588918	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		32.23	■■■□□ 2.75
MFSD12-208	ENST00000588918	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		32.23	■■■□□ 2.75
MFSD12-208	ENST00000588918	BEND3	Q5T5X7	828 aa		32.22	■■■□□ 2.75
MFSD12-208	ENST00000588918	MEIS3	Q99687	375 aa		32.22	■■■□□ 2.75
MFSD12-208	ENST00000588918	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		32.21	■■■□□ 2.75
MFSD12-208	ENST00000588918	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.75
MFSD12-208	ENST00000588918	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	32.19	■■■□□ 2.74
MFSD12-208	ENST00000588918	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		32.19	■■■□□ 2.74
MFSD12-208	ENST00000588918	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	32.19	■■■□□ 2.74
MFSD12-208	ENST00000588918	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
MFSD12-208	ENST00000588918	ARX	Q96QS3	562 aa		32.18	■■■□□ 2.74
MFSD12-208	ENST00000588918	IGHD	P01880	384 aa		32.17	■■■□□ 2.74
MFSD12-208	ENST00000588918	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74

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