RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587324.1

UBXN6-204, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN6, Length 712 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-204ENST00000587324 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.67■■□□□ 1.7
UBXN6-204ENST00000587324 LGR6Q9HBX8 967 aa25.67■■□□□ 1.7
UBXN6-204ENST00000587324 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.66■■□□□ 1.7
UBXN6-204ENST00000587324 SLC52A2Q9HAB3 445 aa25.65■■□□□ 1.7
UBXN6-204ENST00000587324 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa25.65■■□□□ 1.7
UBXN6-204ENST00000587324 PRELPP51888 382 aa25.64■■□□□ 1.7
UBXN6-204ENST00000587324 RASSF7Q02833 373 aa25.64■■□□□ 1.7
UBXN6-204ENST00000587324 SLC39A6Q13433 755 aa25.64■■□□□ 1.7
UBXN6-204ENST00000587324 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
UBXN6-204ENST00000587324 AKAP4Q5JQC9 854 aa25.63■■□□□ 1.69
UBXN6-204ENST00000587324 BCL2L12Q9HB09 334 aa25.63■■□□□ 1.69
UBXN6-204ENST00000587324 COL15A1P39059 1388 aa25.63■■□□□ 1.69
UBXN6-204ENST00000587324 CARMIL3Q8ND23 1372 aa25.62■■□□□ 1.69
UBXN6-204ENST00000587324 NFIXQ14938 502 aa25.62■■□□□ 1.69
UBXN6-204ENST00000587324 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa25.62■■□□□ 1.69
UBXN6-204ENST00000587324 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
UBXN6-204ENST00000587324 RRAGCQ9HB90 399 aa25.61■■□□□ 1.69
UBXN6-204ENST00000587324 KDM2BQ8NHM5 1336 aa25.61■■□□□ 1.69
UBXN6-204ENST00000587324 RNMTO43148 476 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
UBXN6-204ENST00000587324 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
UBXN6-204ENST00000587324 KLRG1Q96E93 195 aa25.6■■□□□ 1.69
UBXN6-204ENST00000587324 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
UBXN6-204ENST00000587324 SCN7AQ01118 1682 aa25.59■■□□□ 1.69
UBXN6-204ENST00000587324 ZPR1O75312 459 aa25.59■■□□□ 1.69
UBXN6-204ENST00000587324 FSTL1Q12841 308 aa25.59■■□□□ 1.69
UBXN6-204ENST00000587324 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
UBXN6-204ENST00000587324 HMOX1P09601 288 aa25.58■■□□□ 1.69
UBXN6-204ENST00000587324 NARFQ9UHQ1 456 aa25.58■■□□□ 1.69
UBXN6-204ENST00000587324 JMYQ8N9B5 988 aa25.57■■□□□ 1.68
UBXN6-204ENST00000587324 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
UBXN6-204ENST00000587324 KNSTRNQ9Y448 316 aa25.56■■□□□ 1.68
UBXN6-204ENST00000587324 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
UBXN6-204ENST00000587324 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa25.55■■□□□ 1.68
UBXN6-204ENST00000587324 CACNA1SQ13698 1873 aa25.54■■□□□ 1.68
UBXN6-204ENST00000587324 SERPINB2P05120 415 aa25.53■■□□□ 1.68
UBXN6-204ENST00000587324 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
UBXN6-204ENST00000587324 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
UBXN6-204ENST00000587324 NFKBIEO00221 500 aa25.51■■□□□ 1.67
UBXN6-204ENST00000587324 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
UBXN6-204ENST00000587324 LMNB1P20700 586 aa25.5■■□□□ 1.67
UBXN6-204ENST00000587324 VSIG10Q8N0Z9 540 aa25.49■■□□□ 1.67
UBXN6-204ENST00000587324 SMC1BQ8NDV3 1235 aa25.49■■□□□ 1.67
UBXN6-204ENST00000587324 BCORQ6W2J9 1755 aa25.49■■□□□ 1.67
UBXN6-204ENST00000587324 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.48■■□□□ 1.67
UBXN6-204ENST00000587324 CANXP27824 592 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
UBXN6-204ENST00000587324 C2CD5Q86YS7 1000 aa25.48■■□□□ 1.67
UBXN6-204ENST00000587324 TTLL6Q8N841 843 aa25.48■■□□□ 1.67
UBXN6-204ENST00000587324 GLTPD2A6NH11 291 aa25.47■■□□□ 1.67
UBXN6-204ENST00000587324 EIF5P55010 431 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
UBXN6-204ENST00000587324 SLX4Q8IY92 1834 aa25.47■■□□□ 1.67
UBXN6-204ENST00000587324 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa25.46■■□□□ 1.67
UBXN6-204ENST00000587324 BICDL1Q6ZP65 573 aa25.46■■□□□ 1.67
UBXN6-204ENST00000587324 POTECB2RU33 542 aa25.45■■□□□ 1.66
UBXN6-204ENST00000587324 TBC1D9BQ66K14 1250 aa25.44■■□□□ 1.66
UBXN6-204ENST00000587324 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
UBXN6-204ENST00000587324 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
UBXN6-204ENST00000587324 CCDC24Q8N4L8 307 aa25.43■■□□□ 1.66
UBXN6-204ENST00000587324 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
UBXN6-204ENST00000587324 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
UBXN6-204ENST00000587324 HEG1Q9ULI3 1381 aa25.42■■□□□ 1.66
UBXN6-204ENST00000587324 H0YIN7 160 aa25.41■■□□□ 1.66
UBXN6-204ENST00000587324 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
UBXN6-204ENST00000587324 IL17REQ8NFR9 667 aa25.41■■□□□ 1.66
UBXN6-204ENST00000587324 PRR5LQ6MZQ0 368 aa25.4■■□□□ 1.66
UBXN6-204ENST00000587324 STARD3NLO95772 234 aa25.38■■□□□ 1.65
UBXN6-204ENST00000587324 ZNF790Q6PG37 636 aa25.38■■□□□ 1.65
UBXN6-204ENST00000587324 TTC5Q8N0Z6 440 aa25.38■■□□□ 1.65
UBXN6-204ENST00000587324 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
UBXN6-204ENST00000587324 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa25.38■■□□□ 1.65
UBXN6-204ENST00000587324 C21orf2O43822 256 aa25.37■■□□□ 1.65
UBXN6-204ENST00000587324 A0A087WZG4 1122 aa25.36■■□□□ 1.65
UBXN6-204ENST00000587324 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP25.36■■□□□ 1.65
UBXN6-204ENST00000587324 BRIP1Q9BX63 1249 aa25.36■■□□□ 1.65
UBXN6-204ENST00000587324 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
UBXN6-204ENST00000587324 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa25.34■■□□□ 1.65
UBXN6-204ENST00000587324 KCNQ3O43525 872 aa25.34■■□□□ 1.65
UBXN6-204ENST00000587324 CAMTA2O94983 1202 aa25.34■■□□□ 1.65
UBXN6-204ENST00000587324 A1BGP04217 495 aa25.34■■□□□ 1.65
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UBXN6-204ENST00000587324 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
UBXN6-204ENST00000587324 CAPN15O75808 1086 aa25.33■■□□□ 1.65
UBXN6-204ENST00000587324 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
UBXN6-204ENST00000587324 TEFQ10587 303 aa25.33■■□□□ 1.65
UBXN6-204ENST00000587324 GNAT3A8MTJ3 354 aa25.32■■□□□ 1.64
UBXN6-204ENST00000587324 POTEIP0CG38 1075 aa25.32■■□□□ 1.64
UBXN6-204ENST00000587324 POTEJP0CG39 1038 aa25.32■■□□□ 1.64
UBXN6-204ENST00000587324 TNS4Q8IZW8 715 aa25.32■■□□□ 1.64
UBXN6-204ENST00000587324 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
UBXN6-204ENST00000587324 PDE6BP35913 854 aa25.31■■□□□ 1.64
UBXN6-204ENST00000587324 ERFEQ4G0M1 354 aa25.31■■□□□ 1.64
UBXN6-204ENST00000587324 LTBP3Q9NS15 1303 aa25.31■■□□□ 1.64
UBXN6-204ENST00000587324 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
UBXN6-204ENST00000587324 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.3■■□□□ 1.64
UBXN6-204ENST00000587324 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.3■■□□□ 1.64
UBXN6-204ENST00000587324 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa25.29■■□□□ 1.64
UBXN6-204ENST00000587324 SCN4AP35499 1836 aa25.28■■□□□ 1.64
UBXN6-204ENST00000587324 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa25.28■■□□□ 1.64
UBXN6-204ENST00000587324 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
UBXN6-204ENST00000587324 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
UBXN6-204ENST00000587324 CNBD1Q8NA66 436 aa25.28■■□□□ 1.64
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