RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580809.5

SEPT4-215, Transcript of septin 4, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene SEPT4, Length 952 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEPT4-215	ENST00000580809	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
SEPT4-215	ENST00000580809	COL15A1	P39059	1388 aa		27.99	■■■□□ 2.07
SEPT4-215	ENST00000580809		A0A087WZG4	1122 aa		27.98	■■■□□ 2.07
SEPT4-215	ENST00000580809	BTBD11	A6QL63	1104 aa		27.98	■■■□□ 2.07
SEPT4-215	ENST00000580809	FKBP8	Q14318	412 aa		27.98	■■■□□ 2.07
SEPT4-215	ENST00000580809	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		27.98	■■■□□ 2.07
SEPT4-215	ENST00000580809	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		27.97	■■■□□ 2.07
SEPT4-215	ENST00000580809	RALBP1	Q15311	655 aa		27.97	■■■□□ 2.07
SEPT4-215	ENST00000580809	TM4SF1	P30408	202 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SEPT4-215	ENST00000580809	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SEPT4-215	ENST00000580809	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
SEPT4-215	ENST00000580809	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
SEPT4-215	ENST00000580809	DDR1	Q08345	913 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SEPT4-215	ENST00000580809	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
SEPT4-215	ENST00000580809	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SEPT4-215	ENST00000580809		A0A0G2JLW4	131 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SEPT4-215	ENST00000580809	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
SEPT4-215	ENST00000580809	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
SEPT4-215	ENST00000580809	DPEP1	P16444	411 aa		27.89	■■■□□ 2.06
SEPT4-215	ENST00000580809	MCM10	Q7L590	875 aa		27.89	■■■□□ 2.06
SEPT4-215	ENST00000580809	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
SEPT4-215	ENST00000580809	NFIX	Q14938	502 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SEPT4-215	ENST00000580809	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
SEPT4-215	ENST00000580809	PIM2	Q9P1W9	311 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SEPT4-215	ENST00000580809	BCS1L	Q9Y276	419 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SEPT4-215	ENST00000580809	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
SEPT4-215	ENST00000580809	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
SEPT4-215	ENST00000580809	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SEPT4-215	ENST00000580809	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SEPT4-215	ENST00000580809	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SEPT4-215	ENST00000580809	KCNQ3	O43525	872 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SEPT4-215	ENST00000580809	KCNA3	P22001	575 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SEPT4-215	ENST00000580809	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SEPT4-215	ENST00000580809	ADCY9	O60503	1353 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SEPT4-215	ENST00000580809	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
SEPT4-215	ENST00000580809	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
SEPT4-215	ENST00000580809	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
SEPT4-215	ENST00000580809	NFE2L2	Q16236	605 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SEPT4-215	ENST00000580809	SERPINB2	P05120	415 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SEPT4-215	ENST00000580809	DCTN1	Q14203	1278 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SEPT4-215	ENST00000580809	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
SEPT4-215	ENST00000580809	ATP10D	Q9P241	1426 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SEPT4-215	ENST00000580809	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SEPT4-215	ENST00000580809	A1BG	P04217	495 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SEPT4-215	ENST00000580809	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
SEPT4-215	ENST00000580809	C1QTNF8	P60827	252 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SEPT4-215	ENST00000580809	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SEPT4-215	ENST00000580809	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
SEPT4-215	ENST00000580809	USP16	Q9Y5T5	823 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SEPT4-215	ENST00000580809	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
SEPT4-215	ENST00000580809	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SEPT4-215	ENST00000580809	SCN7A	Q01118	1682 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SEPT4-215	ENST00000580809	RGL2	O15211	777 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SEPT4-215	ENST00000580809	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SEPT4-215	ENST00000580809	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SEPT4-215	ENST00000580809	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SEPT4-215	ENST00000580809	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
SEPT4-215	ENST00000580809	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SEPT4-215	ENST00000580809	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SEPT4-215	ENST00000580809	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
SEPT4-215	ENST00000580809	CAMTA2	O94983	1202 aa		27.74	■■■□□ 2.03
SEPT4-215	ENST00000580809	CHRNA5	P30532	468 aa		27.74	■■■□□ 2.03
SEPT4-215	ENST00000580809	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		27.74	■■■□□ 2.03
SEPT4-215	ENST00000580809	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		27.74	■■■□□ 2.03
SEPT4-215	ENST00000580809	SETDB2	Q96T68	719 aa		27.74	■■■□□ 2.03
SEPT4-215	ENST00000580809	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		27.74	■■■□□ 2.03
SEPT4-215	ENST00000580809	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SEPT4-215	ENST00000580809		H0YIN7	160 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SEPT4-215	ENST00000580809	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SEPT4-215	ENST00000580809	PDE6B	P35913	854 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SEPT4-215	ENST00000580809	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SEPT4-215	ENST00000580809	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SEPT4-215	ENST00000580809	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SEPT4-215	ENST00000580809	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SEPT4-215	ENST00000580809	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		27.69	■■■□□ 2.02
SEPT4-215	ENST00000580809	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		27.69	■■■□□ 2.02
SEPT4-215	ENST00000580809	TTLL6	Q8N841	843 aa		27.69	■■■□□ 2.02
SEPT4-215	ENST00000580809	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		27.68	■■■□□ 2.02
SEPT4-215	ENST00000580809	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		27.68	■■■□□ 2.02
SEPT4-215	ENST00000580809	RIPK4	P57078	832 aa		27.68	■■■□□ 2.02
SEPT4-215	ENST00000580809	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
SEPT4-215	ENST00000580809	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
SEPT4-215	ENST00000580809	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		27.67	■■■□□ 2.02
SEPT4-215	ENST00000580809	CNBD1	Q8NA66	436 aa		27.67	■■■□□ 2.02
SEPT4-215	ENST00000580809	NBPF26	B4DH59	902 aa		27.66	■■■□□ 2.02
SEPT4-215	ENST00000580809	NPHP1	O15259	732 aa		27.66	■■■□□ 2.02
SEPT4-215	ENST00000580809	ST5	P78524	1137 aa		27.66	■■■□□ 2.02
SEPT4-215	ENST00000580809	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	27.66	■■■□□ 2.02
SEPT4-215	ENST00000580809	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
SEPT4-215	ENST00000580809	NBPF15	Q8N660	670 aa		27.66	■■■□□ 2.02
SEPT4-215	ENST00000580809	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
SEPT4-215	ENST00000580809	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	27.64	■■■□□ 2.02
SEPT4-215	ENST00000580809	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	27.64	■■■□□ 2.02
SEPT4-215	ENST00000580809	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.02
SEPT4-215	ENST00000580809	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SEPT4-215	ENST00000580809	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
SEPT4-215	ENST00000580809	ERBB4	Q15303	1308 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SEPT4-215	ENST00000580809	RUNDC1	Q96C34	613 aa		27.62	■■■□□ 2.01
SEPT4-215	ENST00000580809	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		27.62	■■■□□ 2.01
SEPT4-215	ENST00000580809	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01

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