RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578348.5

GGA3-205, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 2 BASIC

Gene GGA3, Length 2,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-205	ENST00000578348	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		14.03	□□□□□ -0.16
GGA3-205	ENST00000578348	USP26	Q9BXU7	913 aa		14.02	□□□□□ -0.16
GGA3-205	ENST00000578348	CPD	O75976	1380 aa		14.02	□□□□□ -0.16
GGA3-205	ENST00000578348	SDS	P20132	328 aa		14.02	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		14.02	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	14.01	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	KCNQ3	O43525	872 aa		14.01	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	AK9	Q5TCS8	1911 aa		14.01	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	CASC1	Q6TDU7	716 aa		14.01	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		14.01	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		14.01	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	14.01	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		14	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	14	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		14	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	14	□□□□□ -0.17	2e-6	■□□□□ 11
GGA3-205	ENST00000578348	ESPN	B1AK53	854 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	BRINP3	Q76B58	766 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	ERBB4	Q15303	1308 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	SPG7	Q9UQ90	795 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	MEGF6	O75095	1541 aa		13.99	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	MCTP1	Q6DN14	999 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	PKP1	Q13835	747 aa		13.98	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	NUCB2	P80303	420 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	ATP8B2	P98198	1209 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	MRC1	P22897	1456 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	ST18	O60284	1047 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		13.97	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	PHKG2	P15735	406 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	USP44	Q9H0E7	712 aa		13.96	□□□□□ -0.17
GGA3-205	ENST00000578348	REC8	O95072	547 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	CHRNA2	Q15822	529 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	ABCA3	Q99758	1704 aa		13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	ERC2	O15083	957 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	BEND3	Q5T5X7	828 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	SLAIN2	Q9P270	581 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	ADCY9	O60503	1353 aa		13.94	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	C5	P01031	1676 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	PDE1A	P54750	535 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	HYPK	Q9NX55	129 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	DCAF5	Q96JK2	942 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	ZNF790	Q6PG37	636 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	SSH3	Q8TE77	659 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	ALDH1L1	O75891	902 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	ANXA1	P04083	346 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	POLA2	Q14181	598 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	KSR2	Q6VAB6	950 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	ZNF445	P59923	1031 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-205	ENST00000578348	CYP27B1	O15528	508 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-205	ENST00000578348	RAB11FIP3	O75154	756 aa		13.89	□□□□□ -0.19

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