RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578334.5

TSPOAP1-AS1-202, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 956 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP37.87■■■■□ 3.65
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP37.85■■■■□ 3.65
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TM4SF1P30408 202 aa37.84■■■■□ 3.65
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PRKAR2BP31323 418 aa37.84■■■■□ 3.65
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NARFQ9UHQ1 456 aa37.84■■■■□ 3.65
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KCNA3P22001 575 aa37.83■■■■□ 3.65
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa37.83■■■■□ 3.65
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NUDCQ9Y266 331 aa37.83■■■■□ 3.65
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CANXP27824 592 aaKnown RBP37.82■■■■□ 3.64
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RSPH6AQ9H0K4 717 aa37.82■■■■□ 3.64
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP37.81■■■■□ 3.64
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 STARD3NLO95772 234 aa37.81■■■■□ 3.64
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PPP2R1AP30153 589 aa37.81■■■■□ 3.64
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZNF790Q6PG37 636 aa37.81■■■■□ 3.64
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PHACTR3Q96KR7 559 aa37.81■■■■□ 3.64
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PIM2Q9P1W9 311 aa37.81■■■■□ 3.64
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP37.8■■■■□ 3.64
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HEG1Q9ULI3 1381 aa37.78■■■■□ 3.64
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP37.77■■■■□ 3.64
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NFIXQ14938 502 aa37.77■■■■□ 3.64
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa37.77■■■■□ 3.64
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CHRNA5P30532 468 aa37.76■■■■□ 3.64
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP37.75■■■■□ 3.63
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa37.75■■■■□ 3.63
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP37.75■■■■□ 3.63
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP37.74■■■■□ 3.63
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BCL2L12Q9HB09 334 aa37.74■■■■□ 3.63
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FMNL2Q96PY5 1086 aa37.73■■■■□ 3.63
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 EIF5P55010 431 aaKnown RBP37.72■■■■□ 3.63
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP37.71■■■■□ 3.63
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 A0A087WZG4 1122 aa37.7■■■■□ 3.63
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BTBD11A6QL63 1104 aa37.7■■■■□ 3.63
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SERPINB2P05120 415 aa37.69■■■■□ 3.62
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NRXN2Q9P2S2 1712 aa37.69■■■■□ 3.62
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP37.68■■■■□ 3.62
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CEP350Q5VT06 3117 aa37.68■■■■□ 3.62
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BICDL1Q6ZP65 573 aa37.67■■■■□ 3.62
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KCNQ3O43525 872 aa37.66■■■■□ 3.62
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KIF3CO14782 793 aa37.64■■■■□ 3.62
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 C9orf131Q5VYM1 1079 aa37.64■■■■□ 3.62
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MCM10Q7L590 875 aa37.64■■■■□ 3.62
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP37.63■■■■□ 3.61
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP37.63■■■■□ 3.61
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa37.63■■■■□ 3.61
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 A1BGP04217 495 aa37.62■■■■□ 3.61
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SCN7AQ01118 1682 aa37.62■■■■□ 3.61
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TBC1D9BQ66K14 1250 aa37.6■■■■□ 3.61
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CARMIL3Q8ND23 1372 aa37.58■■■■□ 3.61
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DCTN1Q14203 1278 aa37.58■■■■□ 3.61
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DLEC1Q9Y238 1755 aa37.57■■■■□ 3.61
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RNF181Q9P0P0 153 aa37.57■■■■□ 3.6
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HSPA6P17066 643 aa37.56■■■■□ 3.6
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 C2CD5Q86YS7 1000 aa37.56■■■■□ 3.6
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 USP16Q9Y5T5 823 aa37.55■■■■□ 3.6
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP37.54■■■■□ 3.6
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NMRK2Q9NPI5 230 aa37.53■■■■□ 3.6
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa37.52■■■■□ 3.6
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NEFMP07197 916 aa37.52■■■■□ 3.6
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP37.52■■■■□ 3.6
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP37.52■■■■□ 3.6
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SBF1O95248 1867 aa37.52■■■■□ 3.6
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CAMTA2O94983 1202 aa37.51■■■■□ 3.6
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa37.49■■■■□ 3.59
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BCORQ6W2J9 1755 aa37.48■■■■□ 3.59
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PRR5LQ6MZQ0 368 aa37.48■■■■□ 3.59
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CCDC24Q8N4L8 307 aa37.48■■■■□ 3.59
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SETDB2Q96T68 719 aa37.48■■■■□ 3.59
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NPHP1O15259 732 aa37.47■■■■□ 3.59
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TOMM70O94826 608 aa37.47■■■■□ 3.59
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BRIP1Q9BX63 1249 aa37.47■■■■□ 3.59
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP37.46■■■■□ 3.59
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DLG5Q8TDM6 1919 aa37.44■■■■□ 3.58
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP37.44■■■■□ 3.58
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa37.43■■■■□ 3.58
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MIS18AQ9NYP9 233 aa37.42■■■■□ 3.58
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP37.41■■■■□ 3.58
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP37.41■■■■□ 3.58
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LMNB1P20700 586 aa37.4■■■■□ 3.58
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ST5P78524 1137 aa37.4■■■■□ 3.58
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PLEKHF1Q96S99 279 aa37.39■■■■□ 3.58
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZNF652Q9Y2D9 606 aa37.39■■■■□ 3.58
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NBPF26B4DH59 902 aa37.37■■■■□ 3.57
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CLEC4GQ6UXB4 293 aa37.37■■■■□ 3.57
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NBPF15Q8N660 670 aa37.37■■■■□ 3.57
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NFE2L2Q16236 605 aa37.36■■■■□ 3.57
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP37.36■■■■□ 3.57
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP37.36■■■■□ 3.57
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa37.36■■■■□ 3.57
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP37.36■■■■□ 3.57
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NFKBIEO00221 500 aa37.35■■■■□ 3.57
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PRELPP51888 382 aa37.35■■■■□ 3.57
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