RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CHRNA2Q15822 529 aa26.3■■□□□ 1.8
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KSR2Q6VAB6 950 aa26.3■■□□□ 1.8
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 STRCQ7RTU9 1775 aa26.3■■□□□ 1.8
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DDX58O95786 925 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 POLA2Q14181 598 aa26.3■■□□□ 1.8
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PKD1L3Q7Z443 1732 aa26.29■■□□□ 1.8
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF790Q6PG37 636 aa26.29■■□□□ 1.8
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DCAF5Q96JK2 942 aa26.29■■□□□ 1.8
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP26.29■■□□□ 1.8
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SALL3Q9BXA9 1300 aa26.29■■□□□ 1.8
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MRC1P22897 1456 aa26.28■■□□□ 1.8
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ANXA1P04083 346 aa26.28■■□□□ 1.8
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MX1P20591 662 aa26.28■■□□□ 1.8
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.28■■□□□ 1.8
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KIF2CQ99661 725 aa26.28■■□□□ 1.8
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AOX1Q06278 1338 aa26.27■■□□□ 1.8
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 STAP2Q9UGK3 403 aa26.27■■□□□ 1.8
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa26.27■■□□□ 1.8
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 REC8O95072 547 aa26.26■■□□□ 1.79
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa26.26■■□□□ 1.79
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLAIN2Q9P270 581 aa26.26■■□□□ 1.79
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CHMP5Q9NZZ3 219 aa26.25■■□□□ 1.79
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SRGAP3O43295 1099 aa26.24■■□□□ 1.79
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PROSER3Q2NL68 480 aa26.24■■□□□ 1.79
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 USP26Q9BXU7 913 aa26.24■■□□□ 1.79
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa26.23■■□□□ 1.79
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SURF6O75683 361 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PRDM11Q9NQV5 511 aa26.23■■□□□ 1.79
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa26.22■■□□□ 1.79
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ERC2O15083 957 aa26.22■■□□□ 1.79
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MTX1Q13505 466 aa26.22■■□□□ 1.79
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RABEP1Q15276 862 aa26.22■■□□□ 1.79
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TTC5Q8N0Z6 440 aa26.22■■□□□ 1.79
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LINS1Q8NG48 757 aa26.22■■□□□ 1.79
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KIF1BPQ96EK5 621 aa26.22■■□□□ 1.79
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CYP27B1O15528 508 aa26.21■■□□□ 1.79
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 WDR17Q8IZU2 1322 aa26.21■■□□□ 1.79
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC39A6Q13433 755 aa26.2■■□□□ 1.79
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa26.2■■□□□ 1.78
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PDIA6Q15084 440 aa26.19■■□□□ 1.78
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RHPN1Q8TCX5 695 aa26.19■■□□□ 1.78
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C5P01031 1676 aa26.19■■□□□ 1.78
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CABP4P57796 275 aa26.18■■□□□ 1.78
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FMNL2Q96PY5 1086 aa26.18■■□□□ 1.78
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa26.18■■□□□ 1.78
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 UTYO14607 1347 aa26.17■■□□□ 1.78
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa26.16■■□□□ 1.78
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa26.16■■□□□ 1.78
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NEXNQ0ZGT2 675 aa26.15■■□□□ 1.78
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa26.15■■□□□ 1.78
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RIC3Q7Z5B4 369 aa26.15■■□□□ 1.78
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GRM8O00222 908 aa26.15■■□□□ 1.78
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GSE1Q14687 1217 aa26.15■■□□□ 1.78
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa26.15■■□□□ 1.78
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ERC1Q8IUD2 1116 aa26.14■■□□□ 1.78
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa26.13■■□□□ 1.77
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ABCA3Q99758 1704 aa26.13■■□□□ 1.77
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DDIT3P35638 169 aa26.12■■□□□ 1.77
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TSHZ3Q63HK5 1081 aa26.12■■□□□ 1.77
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa26.12■■□□□ 1.77
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 XAGE3Q8WTP9 111 aa26.11■■□□□ 1.77
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RILPL2Q969X0 211 aa26.11■■□□□ 1.77
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CARD10Q9BWT7 1032 aa26.11■■□□□ 1.77
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CHMLP26374 656 aa26.1■■□□□ 1.77
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.1■■□□□ 1.77
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MYL6BP14649 208 aa26.1■■□□□ 1.77
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NUTM1Q86Y26 1132 aa26.1■■□□□ 1.77
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NHSL1Q5SYE7 1610 aa26.09■■□□□ 1.77
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MCCP23508 829 aa26.09■■□□□ 1.77
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 COPS6Q7L5N1 327 aa26.09■■□□□ 1.77
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ERBB4Q15303 1308 aa26.09■■□□□ 1.77
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LAMB4A4D0S4 1761 aa26.08■■□□□ 1.77
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IL2RBP14784 551 aa26.08■■□□□ 1.77
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TTC41PQ6P2S7 1318 aa26.08■■□□□ 1.77
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ST18O60284 1047 aa26.07■■□□□ 1.76
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IGKV5-2P06315 115 aa26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms