RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561256.5

USP3-AS1-210, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 562 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-210ENST00000561256 MRC1P22897 1456 aa23.48■■□□□ 1.35
USP3-AS1-210ENST00000561256 HMOX1P09601 288 aa23.47■■□□□ 1.35
USP3-AS1-210ENST00000561256 FSTL1Q12841 308 aa23.47■■□□□ 1.35
USP3-AS1-210ENST00000561256 RRAGCQ9HB90 399 aa23.47■■□□□ 1.35
USP3-AS1-210ENST00000561256 NARFQ9UHQ1 456 aa23.47■■□□□ 1.35
USP3-AS1-210ENST00000561256 COL15A1P39059 1388 aa23.47■■□□□ 1.35
USP3-AS1-210ENST00000561256 NFIXQ14938 502 aa23.46■■□□□ 1.35
USP3-AS1-210ENST00000561256 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa23.45■■□□□ 1.34
USP3-AS1-210ENST00000561256 SBF1O95248 1867 aa23.44■■□□□ 1.34
USP3-AS1-210ENST00000561256 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
USP3-AS1-210ENST00000561256 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
USP3-AS1-210ENST00000561256 HTRA3P83110 453 aa23.43■■□□□ 1.34
USP3-AS1-210ENST00000561256 RASSF7Q02833 373 aa23.43■■□□□ 1.34
USP3-AS1-210ENST00000561256 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
USP3-AS1-210ENST00000561256 SERPINB2P05120 415 aa23.42■■□□□ 1.34
USP3-AS1-210ENST00000561256 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
USP3-AS1-210ENST00000561256 KLRG1Q96E93 195 aa23.42■■□□□ 1.34
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
USP3-AS1-210ENST00000561256 VSIG10Q8N0Z9 540 aa23.41■■□□□ 1.34
USP3-AS1-210ENST00000561256 NRXN2Q9P2S2 1712 aa23.41■■□□□ 1.34
USP3-AS1-210ENST00000561256 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
USP3-AS1-210ENST00000561256 SMC1BQ8NDV3 1235 aa23.4■■□□□ 1.34
USP3-AS1-210ENST00000561256 BCL2L12Q9HB09 334 aa23.4■■□□□ 1.34
USP3-AS1-210ENST00000561256 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 LMNB1P20700 586 aa23.39■■□□□ 1.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 TTLL6Q8N841 843 aa23.39■■□□□ 1.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 DLEC1Q9Y238 1755 aa23.38■■□□□ 1.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 C2CD5Q86YS7 1000 aa23.38■■□□□ 1.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 TTC5Q8N0Z6 440 aa23.38■■□□□ 1.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 H0YIN7 160 aa23.37■■□□□ 1.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 BICDL1Q6ZP65 573 aa23.37■■□□□ 1.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.36■■□□□ 1.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 STARD3NLO95772 234 aa23.36■■□□□ 1.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 JMYQ8N9B5 988 aa23.36■■□□□ 1.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 UBR2Q8IWV8 1755 aa23.36■■□□□ 1.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 A0A087WZG4 1122 aa23.35■■□□□ 1.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 CARMIL3Q8ND23 1372 aa23.35■■□□□ 1.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 GLTPD2A6NH11 291 aa23.34■■□□□ 1.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 PRELPP51888 382 aa23.34■■□□□ 1.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 EIF5P55010 431 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
USP3-AS1-210ENST00000561256 TEFQ10587 303 aa23.32■■□□□ 1.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 TIAM2Q8IVF5 1701 aa23.32■■□□□ 1.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 NFKBIEO00221 500 aa23.3■■□□□ 1.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 TBC1D9BQ66K14 1250 aa23.3■■□□□ 1.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP23.3■■□□□ 1.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 HEG1Q9ULI3 1381 aa23.29■■□□□ 1.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 GNAT3A8MTJ3 354 aa23.29■■□□□ 1.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa23.29■■□□□ 1.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF790Q6PG37 636 aa23.29■■□□□ 1.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.29■■□□□ 1.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.29■■□□□ 1.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 PDE6BP35913 854 aa23.28■■□□□ 1.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 BRIP1Q9BX63 1249 aa23.28■■□□□ 1.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa23.28■■□□□ 1.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 SCN7AQ01118 1682 aa23.28■■□□□ 1.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 DPY19L2Q6NUT2 758 aa23.27■■□□□ 1.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 IL17REQ8NFR9 667 aa23.27■■□□□ 1.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
USP3-AS1-210ENST00000561256 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa23.26■■□□□ 1.31
USP3-AS1-210ENST00000561256 C21orf2O43822 256 aa23.26■■□□□ 1.31
USP3-AS1-210ENST00000561256 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
USP3-AS1-210ENST00000561256 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
USP3-AS1-210ENST00000561256 PRR5LQ6MZQ0 368 aa23.26■■□□□ 1.31
USP3-AS1-210ENST00000561256 CCDC24Q8N4L8 307 aa23.26■■□□□ 1.31
USP3-AS1-210ENST00000561256 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
USP3-AS1-210ENST00000561256 NPHP1O15259 732 aa23.25■■□□□ 1.31
USP3-AS1-210ENST00000561256 FMNL2Q96PY5 1086 aa23.25■■□□□ 1.31
USP3-AS1-210ENST00000561256 ERFEQ4G0M1 354 aa23.24■■□□□ 1.31
USP3-AS1-210ENST00000561256 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
USP3-AS1-210ENST00000561256 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
USP3-AS1-210ENST00000561256 SETDB2Q96T68 719 aa23.23■■□□□ 1.31
USP3-AS1-210ENST00000561256 A1BGP04217 495 aa23.22■■□□□ 1.31
USP3-AS1-210ENST00000561256 CNBD1Q8NA66 436 aa23.22■■□□□ 1.31
USP3-AS1-210ENST00000561256 POTECB2RU33 542 aa23.21■■□□□ 1.31
USP3-AS1-210ENST00000561256 TAOK3Q9H2K8 898 aa23.21■■□□□ 1.31
USP3-AS1-210ENST00000561256 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa23.2■■□□□ 1.3
USP3-AS1-210ENST00000561256 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa23.2■■□□□ 1.3
USP3-AS1-210ENST00000561256 ST5P78524 1137 aa23.2■■□□□ 1.3
USP3-AS1-210ENST00000561256 TNS4Q8IZW8 715 aa23.2■■□□□ 1.3
USP3-AS1-210ENST00000561256 CNKSR1Q969H4 720 aa23.2■■□□□ 1.3
USP3-AS1-210ENST00000561256 BTBD11A6QL63 1104 aa23.19■■□□□ 1.3
USP3-AS1-210ENST00000561256 CAMTA2O94983 1202 aa23.19■■□□□ 1.3
USP3-AS1-210ENST00000561256 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
USP3-AS1-210ENST00000561256 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa23.18■■□□□ 1.3
USP3-AS1-210ENST00000561256 LTBP3Q9NS15 1303 aa23.18■■□□□ 1.3
USP3-AS1-210ENST00000561256 STYK1Q6J9G0 422 aa23.18■■□□□ 1.3
USP3-AS1-210ENST00000561256 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
USP3-AS1-210ENST00000561256 KCNQ3O43525 872 aa23.17■■□□□ 1.3
USP3-AS1-210ENST00000561256 CAPN15O75808 1086 aa23.17■■□□□ 1.3
USP3-AS1-210ENST00000561256 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
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