RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	6.41	□□□□□ -1.38
AKAP13-223	ENST00000560957	RFC5	P40937	340 aa		6.41	□□□□□ -1.38
AKAP13-223	ENST00000560957	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		6.41	□□□□□ -1.38
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	6.41	□□□□□ -1.38
AKAP13-223	ENST00000560957	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		6.41	□□□□□ -1.38
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		6.41	□□□□□ -1.38
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	6.41	□□□□□ -1.38
AKAP13-223	ENST00000560957	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	6.4	□□□□□ -1.38
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP4A	P20648	1035 aa		6.4	□□□□□ -1.38
AKAP13-223	ENST00000560957	TNP2	Q05952	138 aa		6.4	□□□□□ -1.38
AKAP13-223	ENST00000560957	NR1H3	Q13133	447 aa		6.4	□□□□□ -1.38
AKAP13-223	ENST00000560957	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		6.4	□□□□□ -1.38
AKAP13-223	ENST00000560957	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		6.39	□□□□□ -1.39
AKAP13-223	ENST00000560957	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		6.39	□□□□□ -1.39
AKAP13-223	ENST00000560957	CD33	P20138	364 aa		6.39	□□□□□ -1.39
AKAP13-223	ENST00000560957	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	6.39	□□□□□ -1.39
AKAP13-223	ENST00000560957	NACC1	Q96RE7	527 aa		6.39	□□□□□ -1.39
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	6.39	□□□□□ -1.39
AKAP13-223	ENST00000560957	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	6.38	□□□□□ -1.39
AKAP13-223	ENST00000560957	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	6.38	□□□□□ -1.39
AKAP13-223	ENST00000560957	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		6.38	□□□□□ -1.39
AKAP13-223	ENST00000560957	ELOA3	Q8NG57	546 aa		6.38	□□□□□ -1.39
AKAP13-223	ENST00000560957	MDFI	Q99750	246 aa		6.38	□□□□□ -1.39
AKAP13-223	ENST00000560957	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		6.37	□□□□□ -1.39
AKAP13-223	ENST00000560957	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	6.37	□□□□□ -1.39
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC24A1	O60721	1099 aa		6.37	□□□□□ -1.39
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM157B	P0CG42	384 aa		6.37	□□□□□ -1.39
AKAP13-223	ENST00000560957	PLA2G4A	P47712	749 aa		6.37	□□□□□ -1.39
AKAP13-223	ENST00000560957	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	6.37	□□□□□ -1.39
AKAP13-223	ENST00000560957	TLR1	Q15399	786 aa		6.37	□□□□□ -1.39
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		6.36	□□□□□ -1.39
AKAP13-223	ENST00000560957	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	6.36	□□□□□ -1.39
AKAP13-223	ENST00000560957	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		6.36	□□□□□ -1.39
AKAP13-223	ENST00000560957	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		6.36	□□□□□ -1.39
AKAP13-223	ENST00000560957	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		6.36	□□□□□ -1.39
AKAP13-223	ENST00000560957	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	6.35	□□□□□ -1.39
AKAP13-223	ENST00000560957	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	6.35	□□□□□ -1.39
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	6.35	□□□□□ -1.39
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM117A	Q9C073	453 aa		6.35	□□□□□ -1.39
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1W2PNR3	127 aa		6.34	□□□□□ -1.39
AKAP13-223	ENST00000560957	ALAS2	P22557	587 aa		6.34	□□□□□ -1.39
AKAP13-223	ENST00000560957	LAMC2	Q13753	1193 aa		6.34	□□□□□ -1.39
AKAP13-223	ENST00000560957	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		6.34	□□□□□ -1.39
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM229A	H3BQW9	127 aa		6.33	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	6.33	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		6.32	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957	EFS	O43281	561 aa		6.32	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957	MCTP1	Q6DN14	999 aa		6.32	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		6.32	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957	MARK1	Q9P0L2	795 aa		6.32	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		6.32	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957	C9orf172	C9J069	976 aa		6.31	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957		M0R082	166 aa		6.31	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR37L1	O60883	481 aa		6.31	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957	SIN3B	O75182	1162 aa		6.31	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957	USP4	Q13107	963 aa		6.31	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957	ADGRE1	Q14246	886 aa		6.31	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		6.31	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	6.31	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		6.31	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	6.31	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		6.31	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957	NID1	P14543	1247 aa		6.3	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957	MBTPS1	Q14703	1052 aa		6.3	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957	GRIK4	Q16099	956 aa		6.3	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957	SYT9	Q86SS6	491 aa		6.3	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		6.3	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957	AIDA	Q96BJ3	306 aa		6.3	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957	ZIC5	Q96T25	663 aa		6.3	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957	STRN4	Q9NRL3	753 aa		6.3	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		6.3	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957	SOCS7	O14512	581 aa		6.29	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		6.29	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957	TNFRSF25	Q93038	417 aa		6.29	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		6.29	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	6.29	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957	INHA	P05111	366 aa		6.28	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957	SCNN1D	P51172	638 aa		6.28	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		6.28	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	6.28	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957	GOPC	Q9HD26	462 aa		6.28	□□□□□ -1.4
AKAP13-223	ENST00000560957	ALB	P02768	609 aa		6.27	□□□□□ -1.41
AKAP13-223	ENST00000560957	SELP	P16109	830 aa		6.27	□□□□□ -1.41
AKAP13-223	ENST00000560957	SMTN	P53814	917 aa		6.27	□□□□□ -1.41
AKAP13-223	ENST00000560957	GDF10	P55107	478 aa		6.27	□□□□□ -1.41
AKAP13-223	ENST00000560957	LCE1D	Q5T752	114 aa		6.27	□□□□□ -1.41
AKAP13-223	ENST00000560957	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		6.27	□□□□□ -1.41
AKAP13-223	ENST00000560957	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		6.27	□□□□□ -1.41
AKAP13-223	ENST00000560957	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
AKAP13-223	ENST00000560957	PAX4	O43316	350 aa		6.26	□□□□□ -1.41
AKAP13-223	ENST00000560957	ELN	P15502	786 aa		6.26	□□□□□ -1.41
AKAP13-223	ENST00000560957	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
AKAP13-223	ENST00000560957	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		6.26	□□□□□ -1.41
AKAP13-223	ENST00000560957	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
AKAP13-223	ENST00000560957	SIRT1	Q96EB6	747 aa		6.26	□□□□□ -1.41
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF112	Q9ULX5	631 aa		6.26	□□□□□ -1.41
AKAP13-223	ENST00000560957	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41

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