RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 NLRP3Q96P20 1036 aa9.64□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 NDUFB5O43674 189 aa9.63□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 CBLBQ13191 982 aa9.63□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 COL19A1Q14993 1142 aa9.63□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 ALKBH2Q6NS38 261 aa9.63□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 RGL4Q8IZJ4 473 aa9.63□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 SERTM1A2A2V5 107 aa9.62□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 MPSTP25325 297 aa9.62□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 WDR4P57081 412 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 TEAD4Q15561 434 aa9.62□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 CYP4X1Q8N118 509 aa9.62□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 ABTB2Q8N961 1025 aa9.62□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 MEN1O00255 615 aa9.61□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 EML1O00423 815 aa9.61□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 CENPCQ03188 943 aa9.61□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 COX20Q5RI15 118 aa9.61□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 GIPC2Q8TF65 315 aa9.61□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 RBCK1Q9BYM8 510 aa9.61□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 PRKD2Q9BZL6 878 aa9.61□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 SAP130Q9H0E3 1048 aa9.61□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 STIM2Q9P246 746 aa9.61□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 UNCXA6NJT0 531 aa9.6□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 TNFRSF10BO14763 440 aa9.6□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 TIMP2P16035 220 aa9.6□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 CITED4Q96RK1 184 aa9.6□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa9.6□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 USP3Q9Y6I4 520 aa9.6□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 MEIOBQ8N635 442 aa9.59□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 BCL11AQ9H165 835 aa9.59□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 ZFAND3Q9H8U3 227 aa9.59□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 BRPF3Q9ULD4 1205 aa9.59□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF232Q9UNY5 417 aa9.59□□□□□ -0.87
TMOD3-208ENST00000560725 GDF9O60383 454 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 GPC1P35052 558 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 NOS2P35228 1153 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 RELBQ01201 579 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 RTN1Q16799 776 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 AGBL1Q96MI9 1066 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 TOR4AQ9NXH8 423 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 CABP1Q9NZU7 370 aa9.58□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 J3QL48 77 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 BRD2P25440 801 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 FBXO33Q7Z6M2 555 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 RHBDD1Q8TEB9 315 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa9.57□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 PRR20EP86478 221 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 PRR20CP86479 221 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 PRR20DP86480 221 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 PRR20BP86481 221 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 PRR20AP86496 221 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 L3MBTL2Q969R5 705 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 NGLY1Q96IV0 654 aa9.56□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 SMPD1P17405 629 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 AAMPQ13685 434 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 GNASQ5JWF2 1037 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 DMRTB1Q96MA1 342 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 LRFN2Q9ULH4 789 aa9.55□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 TNFRSF10AO00220 468 aa9.54□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 FZD6O60353 706 aa9.54□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 PDE3BQ13370 1112 aa9.54□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 C1orf53Q5VUE5 145 aa9.54□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 TMC7Q7Z402 723 aa9.54□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 PHACTR1Q9C0D0 580 aa9.54□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 FGD1P98174 961 aa9.53□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 C11orf91Q3C1V1 193 aa9.53□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 SLC27A3Q5K4L6 730 aa9.53□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa9.53□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
TMOD3-208ENST00000560725 TREHO43280 583 aa9.52□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 VAMP1P23763 118 aa9.52□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 DGKZQ13574 1117 aa9.52□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 HIF1AQ16665 826 aa9.52□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 GRIP2Q9C0E4 1043 aa9.52□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa9.52□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 UPP2O95045 317 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 USP5P45974 858 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 NBPF1Q3BBV0 1214 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 TMC1Q8TDI8 760 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-208ENST00000560725 FAM129BQ96TA1 746 aa9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms