RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559586.5

RABGGTA-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-210ENST00000559586 KIF3CO14782 793 aa26.64■■□□□ 1.86
RABGGTA-210ENST00000559586 FKBP8Q14318 412 aa26.64■■□□□ 1.86
RABGGTA-210ENST00000559586 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
RABGGTA-210ENST00000559586 IL17REQ8NFR9 667 aa26.63■■□□□ 1.85
RABGGTA-210ENST00000559586 GNAT3A8MTJ3 354 aa26.62■■□□□ 1.85
RABGGTA-210ENST00000559586 KCNA3P22001 575 aa26.61■■□□□ 1.85
RABGGTA-210ENST00000559586 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
RABGGTA-210ENST00000559586 DNAJC10Q8IXB1 793 aa26.61■■□□□ 1.85
RABGGTA-210ENST00000559586 TJP1Q07157 1748 aa26.61■■□□□ 1.85
RABGGTA-210ENST00000559586 VSIG10Q8N0Z9 540 aa26.6■■□□□ 1.85
RABGGTA-210ENST00000559586 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
RABGGTA-210ENST00000559586 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa26.59■■□□□ 1.85
RABGGTA-210ENST00000559586 TM4SF1P30408 202 aa26.59■■□□□ 1.85
RABGGTA-210ENST00000559586 DDR1Q08345 913 aa26.59■■□□□ 1.85
RABGGTA-210ENST00000559586 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
RABGGTA-210ENST00000559586 TOMM70O94826 608 aa26.58■■□□□ 1.85
RABGGTA-210ENST00000559586 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
RABGGTA-210ENST00000559586 DLG5Q8TDM6 1919 aa26.58■■□□□ 1.85
RABGGTA-210ENST00000559586 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
RABGGTA-210ENST00000559586 NARFQ9UHQ1 456 aa26.57■■□□□ 1.84
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RABGGTA-210ENST00000559586 SLC39A6Q13433 755 aa26.56■■□□□ 1.84
RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC184Q52MB2 194 aa26.56■■□□□ 1.84
RABGGTA-210ENST00000559586 USPL1Q5W0Q7 1092 aa26.56■■□□□ 1.84
RABGGTA-210ENST00000559586 C9orf131Q5VYM1 1079 aa26.55■■□□□ 1.84
RABGGTA-210ENST00000559586 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa26.55■■□□□ 1.84
RABGGTA-210ENST00000559586 APLP1P51693 650 aa26.54■■□□□ 1.84
RABGGTA-210ENST00000559586 TTC5Q8N0Z6 440 aa26.53■■□□□ 1.84
RABGGTA-210ENST00000559586 COL15A1P39059 1388 aa26.53■■□□□ 1.84
RABGGTA-210ENST00000559586 STARD3NLO95772 234 aa26.52■■□□□ 1.84
RABGGTA-210ENST00000559586 KCPQ6ZWJ8 1503 aa26.52■■□□□ 1.84
RABGGTA-210ENST00000559586 UBR2Q8IWV8 1755 aa26.52■■□□□ 1.84
RABGGTA-210ENST00000559586 ADAMTS8Q9UP79 889 aa26.52■■□□□ 1.84
RABGGTA-210ENST00000559586 NFE2L2Q16236 605 aa26.51■■□□□ 1.83
RABGGTA-210ENST00000559586 MCM10Q7L590 875 aa26.51■■□□□ 1.83
RABGGTA-210ENST00000559586 KDM2BQ8NHM5 1336 aa26.5■■□□□ 1.83
RABGGTA-210ENST00000559586 A0A087WZG4 1122 aa26.5■■□□□ 1.83
RABGGTA-210ENST00000559586 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
RABGGTA-210ENST00000559586 CHRNA5P30532 468 aa26.5■■□□□ 1.83
RABGGTA-210ENST00000559586 DCTN1Q14203 1278 aa26.5■■□□□ 1.83
RABGGTA-210ENST00000559586 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
RABGGTA-210ENST00000559586 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
RABGGTA-210ENST00000559586 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
RABGGTA-210ENST00000559586 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa26.5■■□□□ 1.83
RABGGTA-210ENST00000559586 TEFQ10587 303 aa26.49■■□□□ 1.83
RABGGTA-210ENST00000559586 NFIXQ14938 502 aa26.49■■□□□ 1.83
RABGGTA-210ENST00000559586 IFFO2Q5TF58 517 aa26.49■■□□□ 1.83
RABGGTA-210ENST00000559586 ANP32CO43423 234 aa26.48■■□□□ 1.83
RABGGTA-210ENST00000559586 NMRK2Q9NPI5 230 aa26.48■■□□□ 1.83
RABGGTA-210ENST00000559586 RNF181Q9P0P0 153 aa26.48■■□□□ 1.83
RABGGTA-210ENST00000559586 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.47■■□□□ 1.83
RABGGTA-210ENST00000559586 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
RABGGTA-210ENST00000559586 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.46■■□□□ 1.83
RABGGTA-210ENST00000559586 SERPINB2P05120 415 aa26.46■■□□□ 1.83
RABGGTA-210ENST00000559586 NEFMP07197 916 aa26.46■■□□□ 1.83
RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC146Q8IYE0 955 aa26.46■■□□□ 1.83
RABGGTA-210ENST00000559586 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
RABGGTA-210ENST00000559586 CANXP27824 592 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
RABGGTA-210ENST00000559586 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
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RABGGTA-210ENST00000559586 KCNQ3O43525 872 aa26.43■■□□□ 1.82
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RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF790Q6PG37 636 aa26.43■■□□□ 1.82
RABGGTA-210ENST00000559586 RUNDC1Q96C34 613 aa26.43■■□□□ 1.82
RABGGTA-210ENST00000559586 BCL2L12Q9HB09 334 aa26.43■■□□□ 1.82
RABGGTA-210ENST00000559586 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa26.43■■□□□ 1.82
RABGGTA-210ENST00000559586 H0YIN7 160 aa26.42■■□□□ 1.82
RABGGTA-210ENST00000559586 FSTL1Q12841 308 aa26.42■■□□□ 1.82
RABGGTA-210ENST00000559586 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
RABGGTA-210ENST00000559586 TTLL6Q8N841 843 aa26.42■■□□□ 1.82
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
RABGGTA-210ENST00000559586 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
RABGGTA-210ENST00000559586 HEG1Q9ULI3 1381 aa26.41■■□□□ 1.82
RABGGTA-210ENST00000559586 NRXN2Q9P2S2 1712 aa26.4■■□□□ 1.82
RABGGTA-210ENST00000559586 BTBD11A6QL63 1104 aa26.39■■□□□ 1.82
RABGGTA-210ENST00000559586 RIPK4P57078 832 aa26.39■■□□□ 1.82
RABGGTA-210ENST00000559586 C2CD5Q86YS7 1000 aa26.39■■□□□ 1.82
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RABGGTA-210ENST00000559586 FMNL2Q96PY5 1086 aa26.39■■□□□ 1.82
RABGGTA-210ENST00000559586 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
RABGGTA-210ENST00000559586 LMNB1P20700 586 aa26.38■■□□□ 1.81
RABGGTA-210ENST00000559586 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
RABGGTA-210ENST00000559586 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
RABGGTA-210ENST00000559586 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
RABGGTA-210ENST00000559586 PDE6BP35913 854 aa26.36■■□□□ 1.81
RABGGTA-210ENST00000559586 BICDL1Q6ZP65 573 aa26.36■■□□□ 1.81
RABGGTA-210ENST00000559586 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa26.36■■□□□ 1.81
RABGGTA-210ENST00000559586 RRAGCQ9HB90 399 aa26.36■■□□□ 1.81
RABGGTA-210ENST00000559586 MRS2Q9HD23 443 aa26.36■■□□□ 1.81
RABGGTA-210ENST00000559586 KDM3BQ7LBC6 1761 aa26.35■■□□□ 1.81
RABGGTA-210ENST00000559586 SBF1O95248 1867 aa26.35■■□□□ 1.81
RABGGTA-210ENST00000559586 BRIP1Q9BX63 1249 aa26.35■■□□□ 1.81
RABGGTA-210ENST00000559586 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.35■■□□□ 1.81
RABGGTA-210ENST00000559586 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.34■■□□□ 1.81
RABGGTA-210ENST00000559586 RASSF7Q02833 373 aa26.33■■□□□ 1.81
RABGGTA-210ENST00000559586 TBC1D9BQ66K14 1250 aa26.33■■□□□ 1.81
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
RABGGTA-210ENST00000559586 DLEC1Q9Y238 1755 aa26.33■■□□□ 1.8
RABGGTA-210ENST00000559586 CARMIL3Q8ND23 1372 aa26.33■■□□□ 1.8
RABGGTA-210ENST00000559586 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
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