RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558086.1

TMC3-AS1-201, TMC3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TMC3-AS1, Length 658 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3-AS1-201ENST00000558086 KDM2BQ8NHM5 1336 aa18.35■□□□□ 0.53
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CHRNA5P30532 468 aa18.35■□□□□ 0.53
TMC3-AS1-201ENST00000558086 VSIG10Q8N0Z9 540 aa18.35■□□□□ 0.53
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NARFQ9UHQ1 456 aa18.35■□□□□ 0.53
TMC3-AS1-201ENST00000558086 KNSTRNQ9Y448 316 aa18.35■□□□□ 0.53
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RNMTO43148 476 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
TMC3-AS1-201ENST00000558086 LGR6Q9HBX8 967 aa18.34■□□□□ 0.53
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ZPR1O75312 459 aa18.33■□□□□ 0.52
TMC3-AS1-201ENST00000558086 USPL1Q5W0Q7 1092 aa18.33■□□□□ 0.52
TMC3-AS1-201ENST00000558086 JMYQ8N9B5 988 aa18.33■□□□□ 0.52
TMC3-AS1-201ENST00000558086 BCL2L12Q9HB09 334 aa18.33■□□□□ 0.52
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RNF181Q9P0P0 153 aa18.33■□□□□ 0.52
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NFIXQ14938 502 aa18.32■□□□□ 0.52
TMC3-AS1-201ENST00000558086 KLRG1Q96E93 195 aa18.31■□□□□ 0.52
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa18.31■□□□□ 0.52
TMC3-AS1-201ENST00000558086 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SCN7AQ01118 1682 aa18.3■□□□□ 0.52
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SLC39A6Q13433 755 aa18.29■□□□□ 0.52
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TIAM2Q8IVF5 1701 aa18.29■□□□□ 0.52
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PRELPP51888 382 aa18.28■□□□□ 0.52
TMC3-AS1-201ENST00000558086 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa18.27■□□□□ 0.52
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SERPINB2P05120 415 aa18.27■□□□□ 0.52
TMC3-AS1-201ENST00000558086 LMNB1P20700 586 aa18.27■□□□□ 0.52
TMC3-AS1-201ENST00000558086 EIF5P55010 431 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RRAGCQ9HB90 399 aa18.27■□□□□ 0.52
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CARMIL3Q8ND23 1372 aa18.27■□□□□ 0.51
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa18.27■□□□□ 0.51
TMC3-AS1-201ENST00000558086 KIF7Q2M1P5 1343 aa18.26■□□□□ 0.51
TMC3-AS1-201ENST00000558086 HMOX1P09601 288 aa18.26■□□□□ 0.51
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RASSF7Q02833 373 aa18.26■□□□□ 0.51
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SMC1BQ8NDV3 1235 aa18.26■□□□□ 0.51
TMC3-AS1-201ENST00000558086 GLTPD2A6NH11 291 aa18.25■□□□□ 0.51
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TTLL6Q8N841 843 aa18.25■□□□□ 0.51
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PCGF6Q9BYE7 350 aa18.25■□□□□ 0.51
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NFKBIEO00221 500 aa18.24■□□□□ 0.51
TMC3-AS1-201ENST00000558086 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
TMC3-AS1-201ENST00000558086 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa18.23■□□□□ 0.51
TMC3-AS1-201ENST00000558086 HEG1Q9ULI3 1381 aa18.23■□□□□ 0.51
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
TMC3-AS1-201ENST00000558086 HTRA3P83110 453 aa18.23■□□□□ 0.51
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa18.23■□□□□ 0.51
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa18.22■□□□□ 0.51
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa18.22■□□□□ 0.51
TMC3-AS1-201ENST00000558086 A0A087WZG4 1122 aa18.22■□□□□ 0.51
TMC3-AS1-201ENST00000558086 STARD3NLO95772 234 aa18.22■□□□□ 0.51
TMC3-AS1-201ENST00000558086 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
TMC3-AS1-201ENST00000558086 C2CD5Q86YS7 1000 aa18.21■□□□□ 0.51
TMC3-AS1-201ENST00000558086 BCORQ6W2J9 1755 aa18.21■□□□□ 0.51
TMC3-AS1-201ENST00000558086 H0YIN7 160 aa18.2■□□□□ 0.5
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CANXP27824 592 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ZNF790Q6PG37 636 aa18.2■□□□□ 0.5
TMC3-AS1-201ENST00000558086 IL17REQ8NFR9 667 aa18.2■□□□□ 0.5
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
TMC3-AS1-201ENST00000558086 LTBP3Q9NS15 1303 aa18.2■□□□□ 0.5
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa18.19■□□□□ 0.5
TMC3-AS1-201ENST00000558086 POTECB2RU33 542 aa18.19■□□□□ 0.5
TMC3-AS1-201ENST00000558086 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TBC1D9BQ66K14 1250 aa18.19■□□□□ 0.5
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TTC5Q8N0Z6 440 aa18.19■□□□□ 0.5
TMC3-AS1-201ENST00000558086 BRIP1Q9BX63 1249 aa18.19■□□□□ 0.5
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PRR5LQ6MZQ0 368 aa18.18■□□□□ 0.5
TMC3-AS1-201ENST00000558086 GAS2L2Q8NHY3 880 aa18.18■□□□□ 0.5
TMC3-AS1-201ENST00000558086 GNAT3A8MTJ3 354 aa18.17■□□□□ 0.5
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PDE6BP35913 854 aa18.17■□□□□ 0.5
TMC3-AS1-201ENST00000558086 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CAMTA2O94983 1202 aa18.15■□□□□ 0.5
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TEFQ10587 303 aa18.15■□□□□ 0.5
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
TMC3-AS1-201ENST00000558086 BICDL1Q6ZP65 573 aa18.14■□□□□ 0.49
TMC3-AS1-201ENST00000558086 FMNL2Q96PY5 1086 aa18.14■□□□□ 0.49
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SLX4Q8IY92 1834 aa18.13■□□□□ 0.49
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RGL2O15211 777 aa18.12■□□□□ 0.49
TMC3-AS1-201ENST00000558086 STYK1Q6J9G0 422 aa18.12■□□□□ 0.49
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DPY19L2Q6NUT2 758 aa18.12■□□□□ 0.49
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa18.12■□□□□ 0.49
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PCNTO95613 3336 aa18.12■□□□□ 0.49
TMC3-AS1-201ENST00000558086 C21orf2O43822 256 aa18.11■□□□□ 0.49
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SRGNP10124 158 aa18.11■□□□□ 0.49
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CNBD1Q8NA66 436 aa18.11■□□□□ 0.49
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
TMC3-AS1-201ENST00000558086 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
TMC3-AS1-201ENST00000558086 A1BGP04217 495 aa18.1■□□□□ 0.49
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ERFEQ4G0M1 354 aa18.1■□□□□ 0.49
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SOGA3Q5TF21 947 aa18.1■□□□□ 0.49
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CLEC4GQ6UXB4 293 aa18.1■□□□□ 0.49
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CNKSR1Q969H4 720 aa18.1■□□□□ 0.49
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP18.1■□□□□ 0.49
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RSPH6AQ9H0K4 717 aa18.1■□□□□ 0.49
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TAOK3Q9H2K8 898 aa18.1■□□□□ 0.49
TMC3-AS1-201ENST00000558086 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
TMC3-AS1-201ENST00000558086 C7orf43Q8WVR3 580 aa18.09■□□□□ 0.49
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PHACTR3Q96KR7 559 aa18.09■□□□□ 0.49
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SETDB2Q96T68 719 aa18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms