RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557439.5

XRCC3-218, Transcript of X-ray repair cross complementing 3, humanhuman

TSL 5

Gene XRCC3, Length 2,599 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC3-218ENST00000557439 ANKARQ7Z5J8 1434 aa21.6■■□□□ 1.05
XRCC3-218ENST00000557439 STAP2Q9UGK3 403 aa21.6■■□□□ 1.05
XRCC3-218ENST00000557439 RGPD2P0DJD1 1756 aa21.6■■□□□ 1.05
XRCC3-218ENST00000557439 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa21.59■■□□□ 1.05
XRCC3-218ENST00000557439 ESPNB1AK53 854 aa21.59■■□□□ 1.05
XRCC3-218ENST00000557439 IP6K1Q92551 441 aa21.59■■□□□ 1.05
XRCC3-218ENST00000557439 RHPN1Q8TCX5 695 aa21.59■■□□□ 1.05
XRCC3-218ENST00000557439 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
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XRCC3-218ENST00000557439 PSME1Q06323 249 aa21.58■■□□□ 1.05
XRCC3-218ENST00000557439 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.58■■□□□ 1.05
XRCC3-218ENST00000557439 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
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XRCC3-218ENST00000557439 PROSER3Q2NL68 480 aa21.57■■□□□ 1.04
XRCC3-218ENST00000557439 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
XRCC3-218ENST00000557439 MCCP23508 829 aa21.56■■□□□ 1.04
XRCC3-218ENST00000557439 BEND3Q5T5X7 828 aa21.56■■□□□ 1.04
XRCC3-218ENST00000557439 PI4K2BQ8TCG2 481 aa21.56■■□□□ 1.04
XRCC3-218ENST00000557439 DNAAF4Q8WXU2 420 aa21.56■■□□□ 1.04
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XRCC3-218ENST00000557439 BTBD11A6QL63 1104 aa21.56■■□□□ 1.04
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XRCC3-218ENST00000557439 POLA2Q14181 598 aa21.55■■□□□ 1.04
XRCC3-218ENST00000557439 TPRNQ4KMQ1 711 aa21.55■■□□□ 1.04
XRCC3-218ENST00000557439 TMEM63CQ9P1W3 806 aa21.55■■□□□ 1.04
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XRCC3-218ENST00000557439 ORAI2Q96SN7 254 aa21.54■■□□□ 1.04
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XRCC3-218ENST00000557439 SPG7Q9UQ90 795 aa21.53■■□□□ 1.04
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XRCC3-218ENST00000557439 ZNF445P59923 1031 aa21.52■■□□□ 1.04
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XRCC3-218ENST00000557439 BRD1O95696 1058 aa21.51■■□□□ 1.03
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XRCC3-218ENST00000557439 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
XRCC3-218ENST00000557439 RAB11FIP3O75154 756 aa21.49■■□□□ 1.03
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XRCC3-218ENST00000557439 RAD50Q92878 1312 aa21.46■■□□□ 1.03
XRCC3-218ENST00000557439 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.45■■□□□ 1.02
XRCC3-218ENST00000557439 CNTROBQ8N137 903 aa21.45■■□□□ 1.02
XRCC3-218ENST00000557439 ANKRD24Q8TF21 1146 aa21.45■■□□□ 1.02
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XRCC3-218ENST00000557439 AK2P54819 239 aa21.43■■□□□ 1.02
XRCC3-218ENST00000557439 SLC39A6Q13433 755 aa21.43■■□□□ 1.02
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XRCC3-218ENST00000557439 KLHDC4Q8TBB5 520 aa21.42■■□□□ 1.02
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XRCC3-218ENST00000557439 ADCK5Q3MIX3 580 aa21.42■■□□□ 1.02
XRCC3-218ENST00000557439 RUFY3Q7L099 469 aa21.42■■□□□ 1.02
XRCC3-218ENST00000557439 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
XRCC3-218ENST00000557439 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
XRCC3-218ENST00000557439 LRSAM1Q6UWE0 723 aa21.41■■□□□ 1.02
XRCC3-218ENST00000557439 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
XRCC3-218ENST00000557439 SIL1Q9H173 461 aa21.41■■□□□ 1.02
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