RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557092.5

NEDD1-209, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-209ENST00000557092 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.41■■□□□ 1.5
NEDD1-209ENST00000557092 KCNQ3O43525 872 aa24.41■■□□□ 1.5
NEDD1-209ENST00000557092 GRIN3BO60391 1043 aa24.41■■□□□ 1.5
NEDD1-209ENST00000557092 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
NEDD1-209ENST00000557092 FKBP8Q14318 412 aa24.41■■□□□ 1.5
NEDD1-209ENST00000557092 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
NEDD1-209ENST00000557092 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
NEDD1-209ENST00000557092 WWC3Q9ULE0 1092 aa24.41■■□□□ 1.5
NEDD1-209ENST00000557092 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.4■■□□□ 1.5
NEDD1-209ENST00000557092 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.4■■□□□ 1.5
NEDD1-209ENST00000557092 UTRNP46939 3433 aa24.39■■□□□ 1.5
NEDD1-209ENST00000557092 C10orf71Q711Q0 1435 aa24.39■■□□□ 1.5
NEDD1-209ENST00000557092 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.38■■□□□ 1.49
NEDD1-209ENST00000557092 KIF13BQ9NQT8 1826 aa24.38■■□□□ 1.49
NEDD1-209ENST00000557092 NFE2L2Q16236 605 aa24.37■■□□□ 1.49
NEDD1-209ENST00000557092 NARFQ9UHQ1 456 aa24.37■■□□□ 1.49
NEDD1-209ENST00000557092 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
NEDD1-209ENST00000557092 PXDNLA1KZ92 1463 aa24.35■■□□□ 1.49
NEDD1-209ENST00000557092 DDR1Q08345 913 aa24.35■■□□□ 1.49
NEDD1-209ENST00000557092 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
NEDD1-209ENST00000557092 A0A087WZG4 1122 aa24.34■■□□□ 1.49
NEDD1-209ENST00000557092 EIF5P55010 431 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
NEDD1-209ENST00000557092 TGFB2P61812 414 aa24.34■■□□□ 1.49
NEDD1-209ENST00000557092 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
NEDD1-209ENST00000557092 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
NEDD1-209ENST00000557092 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
NEDD1-209ENST00000557092 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa24.32■■□□□ 1.48
NEDD1-209ENST00000557092 A1BGP04217 495 aa24.32■■□□□ 1.48
NEDD1-209ENST00000557092 TM4SF1P30408 202 aa24.32■■□□□ 1.48
NEDD1-209ENST00000557092 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
NEDD1-209ENST00000557092 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.32■■□□□ 1.48
NEDD1-209ENST00000557092 A0A0G2JLW4 131 aa24.31■■□□□ 1.48
NEDD1-209ENST00000557092 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
NEDD1-209ENST00000557092 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
NEDD1-209ENST00000557092 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
NEDD1-209ENST00000557092 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.3■■□□□ 1.48
NEDD1-209ENST00000557092 NFIXQ14938 502 aa24.3■■□□□ 1.48
NEDD1-209ENST00000557092 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
NEDD1-209ENST00000557092 BCL2L12Q9HB09 334 aa24.3■■□□□ 1.48
NEDD1-209ENST00000557092 USP16Q9Y5T5 823 aa24.3■■□□□ 1.48
NEDD1-209ENST00000557092 DPEP1P16444 411 aa24.29■■□□□ 1.48
NEDD1-209ENST00000557092 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.29■■□□□ 1.48
NEDD1-209ENST00000557092 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
NEDD1-209ENST00000557092 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
NEDD1-209ENST00000557092 SCN7AQ01118 1682 aa24.28■■□□□ 1.48
NEDD1-209ENST00000557092 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.28■■□□□ 1.48
NEDD1-209ENST00000557092 BCS1LQ9Y276 419 aa24.28■■□□□ 1.48
NEDD1-209ENST00000557092 KDM3BQ7LBC6 1761 aa24.27■■□□□ 1.48
NEDD1-209ENST00000557092 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
NEDD1-209ENST00000557092 BICDL1Q6ZP65 573 aa24.27■■□□□ 1.48
NEDD1-209ENST00000557092 RIPK4P57078 832 aa24.26■■□□□ 1.47
NEDD1-209ENST00000557092 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.26■■□□□ 1.47
NEDD1-209ENST00000557092 SERPINB2P05120 415 aa24.25■■□□□ 1.47
NEDD1-209ENST00000557092 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
NEDD1-209ENST00000557092 LAMB4A4D0S4 1761 aa24.24■■□□□ 1.47
NEDD1-209ENST00000557092 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
NEDD1-209ENST00000557092 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.23■■□□□ 1.47
NEDD1-209ENST00000557092 TBC1D9BQ66K14 1250 aa24.23■■□□□ 1.47
NEDD1-209ENST00000557092 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
NEDD1-209ENST00000557092 NRXN2Q9P2S2 1712 aa24.23■■□□□ 1.47
NEDD1-209ENST00000557092 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
NEDD1-209ENST00000557092 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
NEDD1-209ENST00000557092 CAMTA2O94983 1202 aa24.21■■□□□ 1.47
NEDD1-209ENST00000557092 KCNA3P22001 575 aa24.21■■□□□ 1.47
NEDD1-209ENST00000557092 CHRNA5P30532 468 aa24.21■■□□□ 1.47
NEDD1-209ENST00000557092 NEUROD2Q15784 382 aa24.21■■□□□ 1.47
NEDD1-209ENST00000557092 PIM2Q9P1W9 311 aa24.21■■□□□ 1.47
NEDD1-209ENST00000557092 BCORQ6W2J9 1755 aa24.21■■□□□ 1.47
NEDD1-209ENST00000557092 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
NEDD1-209ENST00000557092 RUNDC1Q96C34 613 aa24.2■■□□□ 1.46
NEDD1-209ENST00000557092 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.2■■□□□ 1.46
NEDD1-209ENST00000557092 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.2■■□□□ 1.46
NEDD1-209ENST00000557092 NBPF26B4DH59 902 aa24.19■■□□□ 1.46
NEDD1-209ENST00000557092 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
NEDD1-209ENST00000557092 NBPF15Q8N660 670 aa24.19■■□□□ 1.46
NEDD1-209ENST00000557092 CARMIL3Q8ND23 1372 aa24.18■■□□□ 1.46
NEDD1-209ENST00000557092 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
NEDD1-209ENST00000557092 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
NEDD1-209ENST00000557092 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa24.17■■□□□ 1.46
NEDD1-209ENST00000557092 SETDB2Q96T68 719 aa24.17■■□□□ 1.46
NEDD1-209ENST00000557092 NPHP1O15259 732 aa24.16■■□□□ 1.46
NEDD1-209ENST00000557092 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.16■■□□□ 1.46
NEDD1-209ENST00000557092 ATP10DQ9P241 1426 aa24.16■■□□□ 1.46
NEDD1-209ENST00000557092 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa24.15■■□□□ 1.46
NEDD1-209ENST00000557092 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
NEDD1-209ENST00000557092 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.13■■□□□ 1.45
NEDD1-209ENST00000557092 C2CD5Q86YS7 1000 aa24.13■■□□□ 1.45
NEDD1-209ENST00000557092 CCDC24Q8N4L8 307 aa24.13■■□□□ 1.45
NEDD1-209ENST00000557092 NGEFQ8N5V2 710 aa24.13■■□□□ 1.45
NEDD1-209ENST00000557092 CNBD1Q8NA66 436 aa24.13■■□□□ 1.45
NEDD1-209ENST00000557092 ADCY9O60503 1353 aa24.13■■□□□ 1.45
NEDD1-209ENST00000557092 PRR5LQ6MZQ0 368 aa24.12■■□□□ 1.45
NEDD1-209ENST00000557092 BABAM1Q9NWV8 329 aa24.12■■□□□ 1.45
NEDD1-209ENST00000557092 DLEC1Q9Y238 1755 aa24.11■■□□□ 1.45
NEDD1-209ENST00000557092 H0YIN7 160 aa24.11■■□□□ 1.45
NEDD1-209ENST00000557092 MYL6BP14649 208 aa24.1■■□□□ 1.45
NEDD1-209ENST00000557092 ST5P78524 1137 aa24.1■■□□□ 1.45
NEDD1-209ENST00000557092 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.1■■□□□ 1.45
NEDD1-209ENST00000557092 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
NEDD1-209ENST00000557092 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa24.1■■□□□ 1.45
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