RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555806.5

NEDD1-208, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 565 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-208ENST00000555806 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.41■■□□□ 1.5
NEDD1-208ENST00000555806 KCNQ3O43525 872 aa24.41■■□□□ 1.5
NEDD1-208ENST00000555806 GRIN3BO60391 1043 aa24.41■■□□□ 1.5
NEDD1-208ENST00000555806 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
NEDD1-208ENST00000555806 FKBP8Q14318 412 aa24.41■■□□□ 1.5
NEDD1-208ENST00000555806 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
NEDD1-208ENST00000555806 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
NEDD1-208ENST00000555806 WWC3Q9ULE0 1092 aa24.41■■□□□ 1.5
NEDD1-208ENST00000555806 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.4■■□□□ 1.5
NEDD1-208ENST00000555806 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.4■■□□□ 1.5
NEDD1-208ENST00000555806 UTRNP46939 3433 aa24.39■■□□□ 1.5
NEDD1-208ENST00000555806 C10orf71Q711Q0 1435 aa24.39■■□□□ 1.5
NEDD1-208ENST00000555806 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.38■■□□□ 1.49
NEDD1-208ENST00000555806 KIF13BQ9NQT8 1826 aa24.38■■□□□ 1.49
NEDD1-208ENST00000555806 NFE2L2Q16236 605 aa24.37■■□□□ 1.49
NEDD1-208ENST00000555806 NARFQ9UHQ1 456 aa24.37■■□□□ 1.49
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
NEDD1-208ENST00000555806 PXDNLA1KZ92 1463 aa24.35■■□□□ 1.49
NEDD1-208ENST00000555806 DDR1Q08345 913 aa24.35■■□□□ 1.49
NEDD1-208ENST00000555806 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
NEDD1-208ENST00000555806 A0A087WZG4 1122 aa24.34■■□□□ 1.49
NEDD1-208ENST00000555806 EIF5P55010 431 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
NEDD1-208ENST00000555806 TGFB2P61812 414 aa24.34■■□□□ 1.49
NEDD1-208ENST00000555806 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
NEDD1-208ENST00000555806 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
NEDD1-208ENST00000555806 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
NEDD1-208ENST00000555806 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa24.32■■□□□ 1.48
NEDD1-208ENST00000555806 A1BGP04217 495 aa24.32■■□□□ 1.48
NEDD1-208ENST00000555806 TM4SF1P30408 202 aa24.32■■□□□ 1.48
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
NEDD1-208ENST00000555806 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.32■■□□□ 1.48
NEDD1-208ENST00000555806 A0A0G2JLW4 131 aa24.31■■□□□ 1.48
NEDD1-208ENST00000555806 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
NEDD1-208ENST00000555806 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
NEDD1-208ENST00000555806 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
NEDD1-208ENST00000555806 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.3■■□□□ 1.48
NEDD1-208ENST00000555806 NFIXQ14938 502 aa24.3■■□□□ 1.48
NEDD1-208ENST00000555806 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
NEDD1-208ENST00000555806 BCL2L12Q9HB09 334 aa24.3■■□□□ 1.48
NEDD1-208ENST00000555806 USP16Q9Y5T5 823 aa24.3■■□□□ 1.48
NEDD1-208ENST00000555806 DPEP1P16444 411 aa24.29■■□□□ 1.48
NEDD1-208ENST00000555806 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.29■■□□□ 1.48
NEDD1-208ENST00000555806 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
NEDD1-208ENST00000555806 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
NEDD1-208ENST00000555806 SCN7AQ01118 1682 aa24.28■■□□□ 1.48
NEDD1-208ENST00000555806 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.28■■□□□ 1.48
NEDD1-208ENST00000555806 BCS1LQ9Y276 419 aa24.28■■□□□ 1.48
NEDD1-208ENST00000555806 KDM3BQ7LBC6 1761 aa24.27■■□□□ 1.48
NEDD1-208ENST00000555806 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
NEDD1-208ENST00000555806 BICDL1Q6ZP65 573 aa24.27■■□□□ 1.48
NEDD1-208ENST00000555806 RIPK4P57078 832 aa24.26■■□□□ 1.47
NEDD1-208ENST00000555806 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.26■■□□□ 1.47
NEDD1-208ENST00000555806 SERPINB2P05120 415 aa24.25■■□□□ 1.47
NEDD1-208ENST00000555806 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
NEDD1-208ENST00000555806 LAMB4A4D0S4 1761 aa24.24■■□□□ 1.47
NEDD1-208ENST00000555806 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
NEDD1-208ENST00000555806 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.23■■□□□ 1.47
NEDD1-208ENST00000555806 TBC1D9BQ66K14 1250 aa24.23■■□□□ 1.47
NEDD1-208ENST00000555806 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
NEDD1-208ENST00000555806 NRXN2Q9P2S2 1712 aa24.23■■□□□ 1.47
NEDD1-208ENST00000555806 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
NEDD1-208ENST00000555806 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
NEDD1-208ENST00000555806 CAMTA2O94983 1202 aa24.21■■□□□ 1.47
NEDD1-208ENST00000555806 KCNA3P22001 575 aa24.21■■□□□ 1.47
NEDD1-208ENST00000555806 CHRNA5P30532 468 aa24.21■■□□□ 1.47
NEDD1-208ENST00000555806 NEUROD2Q15784 382 aa24.21■■□□□ 1.47
NEDD1-208ENST00000555806 PIM2Q9P1W9 311 aa24.21■■□□□ 1.47
NEDD1-208ENST00000555806 BCORQ6W2J9 1755 aa24.21■■□□□ 1.47
NEDD1-208ENST00000555806 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
NEDD1-208ENST00000555806 RUNDC1Q96C34 613 aa24.2■■□□□ 1.46
NEDD1-208ENST00000555806 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.2■■□□□ 1.46
NEDD1-208ENST00000555806 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.2■■□□□ 1.46
NEDD1-208ENST00000555806 NBPF26B4DH59 902 aa24.19■■□□□ 1.46
NEDD1-208ENST00000555806 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
NEDD1-208ENST00000555806 NBPF15Q8N660 670 aa24.19■■□□□ 1.46
NEDD1-208ENST00000555806 CARMIL3Q8ND23 1372 aa24.18■■□□□ 1.46
NEDD1-208ENST00000555806 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
NEDD1-208ENST00000555806 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
NEDD1-208ENST00000555806 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa24.17■■□□□ 1.46
NEDD1-208ENST00000555806 SETDB2Q96T68 719 aa24.17■■□□□ 1.46
NEDD1-208ENST00000555806 NPHP1O15259 732 aa24.16■■□□□ 1.46
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.16■■□□□ 1.46
NEDD1-208ENST00000555806 ATP10DQ9P241 1426 aa24.16■■□□□ 1.46
NEDD1-208ENST00000555806 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa24.15■■□□□ 1.46
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
NEDD1-208ENST00000555806 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.13■■□□□ 1.45
NEDD1-208ENST00000555806 C2CD5Q86YS7 1000 aa24.13■■□□□ 1.45
NEDD1-208ENST00000555806 CCDC24Q8N4L8 307 aa24.13■■□□□ 1.45
NEDD1-208ENST00000555806 NGEFQ8N5V2 710 aa24.13■■□□□ 1.45
NEDD1-208ENST00000555806 CNBD1Q8NA66 436 aa24.13■■□□□ 1.45
NEDD1-208ENST00000555806 ADCY9O60503 1353 aa24.13■■□□□ 1.45
NEDD1-208ENST00000555806 PRR5LQ6MZQ0 368 aa24.12■■□□□ 1.45
NEDD1-208ENST00000555806 BABAM1Q9NWV8 329 aa24.12■■□□□ 1.45
NEDD1-208ENST00000555806 DLEC1Q9Y238 1755 aa24.11■■□□□ 1.45
NEDD1-208ENST00000555806 H0YIN7 160 aa24.11■■□□□ 1.45
NEDD1-208ENST00000555806 MYL6BP14649 208 aa24.1■■□□□ 1.45
NEDD1-208ENST00000555806 ST5P78524 1137 aa24.1■■□□□ 1.45
NEDD1-208ENST00000555806 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.1■■□□□ 1.45
NEDD1-208ENST00000555806 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
NEDD1-208ENST00000555806 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms