RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551483.5

CNOT2-231, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, human

TSL 2 BASIC

Gene CNOT2, Length 4,753 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT2-231	ENST00000551483	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	SLC26A4	O43511	780 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	MRGBP	Q9NV56	204 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	TPPP	O94811	219 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM163B	P0C2L3	166 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	IL4R	P24394	825 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	CLCN1	P35523	988 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	ADD2	P35612	726 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	POU5F1B	Q06416	359 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	C17orf50	Q8WW18	174 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	SOGA3	Q5TF21	947 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	CHPF	Q8IZ52	775 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	PROM2	Q8N271	834 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	CENPT	Q96BT3	561 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	TBC1D12	O60347	775 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	CAPN2	P17655	700 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	TRAPPC10	P48553	1259 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	UBE4A	Q14139	1066 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	PPP2R5A	Q15172	486 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	FXN	Q16595	210 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	CAPN10	Q9HC96	672 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	CA8	P35219	290 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	COL19A1	Q14993	1142 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	TEKT1	Q969V4	418 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	RUNDC1	Q96C34	613 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	MKS1	Q9NXB0	559 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	PRSS47	A8MTI9	375 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	SESN3	P58005	492 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	PPP2R5B	Q15173	497 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	JMY	Q8N9B5	988 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	CERK	Q8TCT0	537 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	TIGD1	Q96MW7	591 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	SUFU	Q9UMX1	484 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	PIK3CA	P42336	1068 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	SPECC1	Q5M775	1068 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF132	P52740	706 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	PPM1E	Q8WY54	764 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	CDHR1	Q96JP9	859 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	UIMC1	Q96RL1	719 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	FEZ1	Q99689	392 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	ATG7	O95352	703 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	KIF3A	Q9Y496	699 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	IL16	Q14005	1332 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	SMTNL1	A8MU46	457 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	FIBP	O43427	364 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	SNX16	P57768	344 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	E2F4	Q16254	413 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	MORC1	Q86VD1	984 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	EPAS1	Q99814	870 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	MAFF	Q9ULX9	164 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	ESPN	B1AK53	854 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNOT2-231	ENST00000551483	DDB1	Q16531	1140 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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