RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		15.26	■□□□□ 0.03
CS-223	ENST00000551137	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		15.26	■□□□□ 0.03
CS-223	ENST00000551137	NEFM	P07197	916 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CS-223	ENST00000551137	TM4SF1	P30408	202 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CS-223	ENST00000551137	FKBP8	Q14318	412 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CS-223	ENST00000551137	MCM10	Q7L590	875 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CS-223	ENST00000551137	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	15.25	■□□□□ 0.03
CS-223	ENST00000551137	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		15.25	■□□□□ 0.03
CS-223	ENST00000551137	COL15A1	P39059	1388 aa		15.24	■□□□□ 0.03
CS-223	ENST00000551137	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
CS-223	ENST00000551137	ZPR1	O75312	459 aa		15.24	■□□□□ 0.03
CS-223	ENST00000551137	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
CS-223	ENST00000551137	KCNQ3	O43525	872 aa		15.23	■□□□□ 0.03
CS-223	ENST00000551137	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
CS-223	ENST00000551137	NFE2L2	Q16236	605 aa		15.23	■□□□□ 0.03
CS-223	ENST00000551137	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		15.22	■□□□□ 0.03
CS-223	ENST00000551137		A0A087WZG4	1122 aa		15.22	■□□□□ 0.03
CS-223	ENST00000551137	DDR1	Q08345	913 aa		15.22	■□□□□ 0.03
CS-223	ENST00000551137	DCTN1	Q14203	1278 aa		15.22	■□□□□ 0.03
CS-223	ENST00000551137	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		15.22	■□□□□ 0.03
CS-223	ENST00000551137	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
CS-223	ENST00000551137	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		15.21	■□□□□ 0.03
CS-223	ENST00000551137	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
CS-223	ENST00000551137	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
CS-223	ENST00000551137	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
CS-223	ENST00000551137	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		15.21	■□□□□ 0.03
CS-223	ENST00000551137	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		15.21	■□□□□ 0.02
CS-223	ENST00000551137	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
CS-223	ENST00000551137	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
CS-223	ENST00000551137	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
CS-223	ENST00000551137	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CS-223	ENST00000551137	KCNA3	P22001	575 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CS-223	ENST00000551137	NFIX	Q14938	502 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CS-223	ENST00000551137	USP16	Q9Y5T5	823 aa		15.19	■□□□□ 0.02
CS-223	ENST00000551137	A1BG	P04217	495 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CS-223	ENST00000551137	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CS-223	ENST00000551137		A0A0G2JLW4	131 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CS-223	ENST00000551137	RGL2	O15211	777 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CS-223	ENST00000551137	DPEP1	P16444	411 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CS-223	ENST00000551137	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		15.16	■□□□□ 0.02
CS-223	ENST00000551137	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
CS-223	ENST00000551137	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		15.15	■□□□□ 0.02
CS-223	ENST00000551137	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
CS-223	ENST00000551137	CAMTA2	O94983	1202 aa		15.15	■□□□□ 0.02
CS-223	ENST00000551137	SERPINB2	P05120	415 aa		15.15	■□□□□ 0.02
CS-223	ENST00000551137	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
CS-223	ENST00000551137	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
CS-223	ENST00000551137	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		15.15	■□□□□ 0.02
CS-223	ENST00000551137	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
CS-223	ENST00000551137	NBPF26	B4DH59	902 aa		15.14	■□□□□ 0.01
CS-223	ENST00000551137	RIPK4	P57078	832 aa		15.14	■□□□□ 0.01
CS-223	ENST00000551137	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		15.14	■□□□□ 0.01
CS-223	ENST00000551137	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
CS-223	ENST00000551137	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		15.14	■□□□□ 0.01
CS-223	ENST00000551137	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
CS-223	ENST00000551137	NBPF15	Q8N660	670 aa		15.14	■□□□□ 0.01
CS-223	ENST00000551137	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		15.14	■□□□□ 0.01
CS-223	ENST00000551137	PIM2	Q9P1W9	311 aa		15.14	■□□□□ 0.01
CS-223	ENST00000551137	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		15.14	■□□□□ 0.01
CS-223	ENST00000551137	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
CS-223	ENST00000551137	SCN7A	Q01118	1682 aa		15.13	■□□□□ 0.01
CS-223	ENST00000551137	RUNDC1	Q96C34	613 aa		15.13	■□□□□ 0.01
CS-223	ENST00000551137	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	15.13	■□□□□ 0.01
CS-223	ENST00000551137	ADCY9	O60503	1353 aa		15.12	■□□□□ 0.01
CS-223	ENST00000551137	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		15.12	■□□□□ 0.01
CS-223	ENST00000551137	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	15.12	■□□□□ 0.01
CS-223	ENST00000551137	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		15.12	■□□□□ 0.01
CS-223	ENST00000551137	BCS1L	Q9Y276	419 aa		15.12	■□□□□ 0.01
CS-223	ENST00000551137	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		15.11	■□□□□ 0.01
CS-223	ENST00000551137	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	15.11	■□□□□ 0.01
CS-223	ENST00000551137	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		15.11	■□□□□ 0.01
CS-223	ENST00000551137	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		15.11	■□□□□ 0.01
CS-223	ENST00000551137	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	15.1	■□□□□ 0.01
CS-223	ENST00000551137	SETDB2	Q96T68	719 aa		15.1	■□□□□ 0.01
CS-223	ENST00000551137	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		15.1	■□□□□ 0.01
CS-223	ENST00000551137	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	15.1	■□□□□ 0.01
CS-223	ENST00000551137	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		15.1	■□□□□ 0.01
CS-223	ENST00000551137	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		15.09	■□□□□ 0.01
CS-223	ENST00000551137	CHRNA5	P30532	468 aa		15.09	■□□□□ 0.01
CS-223	ENST00000551137	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		15.09	■□□□□ 0.01
CS-223	ENST00000551137	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		15.09	■□□□□ 0.01
CS-223	ENST00000551137	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		15.09	■□□□□ 0.01
CS-223	ENST00000551137	ERBB4	Q15303	1308 aa		15.09	■□□□□ 0.01
CS-223	ENST00000551137	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	15.08	■□□□□ 0
CS-223	ENST00000551137	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		15.08	■□□□□ 0
CS-223	ENST00000551137	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		15.08	■□□□□ 0
CS-223	ENST00000551137	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		15.08	■□□□□ 0
CS-223	ENST00000551137	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		15.08	■□□□□ 0
CS-223	ENST00000551137	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		15.07	■□□□□ 0
CS-223	ENST00000551137		H0YIN7	160 aa		15.07	■□□□□ 0
CS-223	ENST00000551137	CHL1	O00533	1208 aa		15.07	■□□□□ 0
CS-223	ENST00000551137	ATP10D	Q9P241	1426 aa		15.07	■□□□□ 0
CS-223	ENST00000551137	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		15.06	■□□□□ 0
CS-223	ENST00000551137	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	15.06	■□□□□ 0
CS-223	ENST00000551137	PDE6B	P35913	854 aa		15.06	■□□□□ 0
CS-223	ENST00000551137	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		15.06	■□□□□ 0
CS-223	ENST00000551137	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	15.06	■□□□□ 0
CS-223	ENST00000551137	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	15.05	■□□□□ -0
CS-223	ENST00000551137	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		15.05	■□□□□ -0
CS-223	ENST00000551137	TTLL6	Q8N841	843 aa		15.05	■□□□□ -0

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