RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 TANGO6Q9C0B7 1094 aa7.48□□□□□ -1.21
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PDE4D-226ENST00000546160 SLFN5Q08AF3 891 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-226ENST00000546160 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-226ENST00000546160 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-226ENST00000546160 IL16Q14005 1332 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-226ENST00000546160 WDR62O43379 1518 aa7.48□□□□□ -1.21
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PDE4D-226ENST00000546160 ATP2B1P20020 1258 aa7.48□□□□□ -1.21
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PDE4D-226ENST00000546160 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
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PDE4D-226ENST00000546160 TOM1O60784 492 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-226ENST00000546160 KIF5BP33176 963 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-226ENST00000546160 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-226ENST00000546160 PIK3R4Q99570 1358 aa7.48□□□□□ -1.21
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PDE4D-226ENST00000546160 NPHP3Q7Z494 1330 aa7.47□□□□□ -1.21
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PDE4D-226ENST00000546160 FIBPO43427 364 aa7.47□□□□□ -1.21
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PDE4D-226ENST00000546160 CDCA7LQ96GN5 454 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-226ENST00000546160 MYD88Q99836 296 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-226ENST00000546160 SHANK2Q9UPX8 1470 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-226ENST00000546160 CHD1O14646 1710 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF213O14771 459 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-226ENST00000546160 NBPF8Q3BBV2 869 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-226ENST00000546160 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-226ENST00000546160 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-226ENST00000546160 NYXQ9GZU5 481 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-226ENST00000546160 RFC4P35249 363 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-226ENST00000546160 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.21
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PDE4D-226ENST00000546160 STK3Q13188 491 aa7.46□□□□□ -1.21
PDE4D-226ENST00000546160 VPS36Q86VN1 386 aa7.46□□□□□ -1.21
PDE4D-226ENST00000546160 EVI5LQ96CN4 794 aa7.46□□□□□ -1.21
PDE4D-226ENST00000546160 NEBLO76041 1014 aa7.46□□□□□ -1.22
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PDE4D-226ENST00000546160 TMEM57Q8N5G2 664 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-226ENST00000546160 NUP62CLQ9H1M0 184 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-226ENST00000546160 AK9Q5TCS8 1911 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-226ENST00000546160 ZFYVE9O95405 1425 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-226ENST00000546160 ERLIN1O75477 346 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-226ENST00000546160 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-226ENST00000546160 MX1P20591 662 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-226ENST00000546160 SLC12A7Q9Y666 1083 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-226ENST00000546160 EZRP15311 586 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-226ENST00000546160 TTLL5Q6EMB2 1281 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-226ENST00000546160 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-226ENST00000546160 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
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PDE4D-226ENST00000546160 ATP10BO94823 1461 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-226ENST00000546160 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
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PDE4D-226ENST00000546160 CETN1Q12798 172 aa7.45□□□□□ -1.22
PDE4D-226ENST00000546160 FKBP15Q5T1M5 1219 aa7.45□□□□□ -1.22
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PDE4D-226ENST00000546160 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC148Q8NFR7 591 aa7.44□□□□□ -1.22
PDE4D-226ENST00000546160 RIMS2Q9UQ26 1411 aa7.44□□□□□ -1.22
PDE4D-226ENST00000546160 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa7.44□□□□□ -1.22
PDE4D-226ENST00000546160 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa7.44□□□□□ -1.22
PDE4D-226ENST00000546160 LEKR1Q6ZMV7 388 aa7.44□□□□□ -1.22
PDE4D-226ENST00000546160 STK11IPQ8N1F8 1099 aa7.44□□□□□ -1.22
PDE4D-226ENST00000546160 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PDE4D-226ENST00000546160 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa7.44□□□□□ -1.22
PDE4D-226ENST00000546160 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa7.44□□□□□ -1.22
PDE4D-226ENST00000546160 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
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