RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534143.5

CMTM1-220, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CMTM1, Length 781 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-220ENST00000534143 NINLQ9Y2I6 1382 aa8.41□□□□□ -1.06
CMTM1-220ENST00000534143 HSPA1LP34931 641 aa8.41□□□□□ -1.06
CMTM1-220ENST00000534143 PLA2G2CQ5R387 149 aa8.41□□□□□ -1.06
CMTM1-220ENST00000534143 LIAT1Q6ZQX7 453 aa8.41□□□□□ -1.06
CMTM1-220ENST00000534143 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CMTM1-220ENST00000534143 PRDM9Q9NQV7 894 aa8.41□□□□□ -1.06
CMTM1-220ENST00000534143 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa8.4□□□□□ -1.06
CMTM1-220ENST00000534143 CD163L1Q9NR16 1453 aa8.4□□□□□ -1.06
CMTM1-220ENST00000534143 ANKARQ7Z5J8 1434 aa8.4□□□□□ -1.06
CMTM1-220ENST00000534143 TOM1O60784 492 aa8.4□□□□□ -1.06
CMTM1-220ENST00000534143 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
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CMTM1-220ENST00000534143 C19orf44Q9H6X5 657 aa8.4□□□□□ -1.06
CMTM1-220ENST00000534143 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa8.39□□□□□ -1.07
CMTM1-220ENST00000534143 PLEKHG3A1L390 1219 aa8.39□□□□□ -1.07
CMTM1-220ENST00000534143 FDX1P10109 184 aa8.39□□□□□ -1.07
CMTM1-220ENST00000534143 MMP16P51512 607 aa8.39□□□□□ -1.07
CMTM1-220ENST00000534143 LAPTM4AQ15012 233 aa8.39□□□□□ -1.07
CMTM1-220ENST00000534143 TMC1Q8TDI8 760 aa8.39□□□□□ -1.07
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CMTM1-220ENST00000534143 AKAP12Q02952 1782 aa8.38□□□□□ -1.07
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CMTM1-220ENST00000534143 MOXD2PA6NHM9 499 aa8.38□□□□□ -1.07
CMTM1-220ENST00000534143 GFRA3O60609 400 aa8.38□□□□□ -1.07
CMTM1-220ENST00000534143 NDUFV2P19404 249 aa8.38□□□□□ -1.07
CMTM1-220ENST00000534143 DIXDC1Q155Q3 683 aa8.38□□□□□ -1.07
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CMTM1-220ENST00000534143 C14orf37Q86TY3 774 aa8.37□□□□□ -1.07
CMTM1-220ENST00000534143 TBC1D2Q9BYX2 928 aa8.37□□□□□ -1.07
CMTM1-220ENST00000534143 TERF2IPQ9NYB0 399 aa8.37□□□□□ -1.07
CMTM1-220ENST00000534143 A0A1W2PP64 1363 aa8.36□□□□□ -1.07
CMTM1-220ENST00000534143 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa8.36□□□□□ -1.07
CMTM1-220ENST00000534143 ANP32CO43423 234 aa8.36□□□□□ -1.07
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CMTM1-220ENST00000534143 GJA5P36382 358 aa8.36□□□□□ -1.07
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CMTM1-220ENST00000534143 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CMTM1-220ENST00000534143 RETREG3Q86VR2 466 aa8.36□□□□□ -1.07
CMTM1-220ENST00000534143 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CMTM1-220ENST00000534143 KNSTRNQ9Y448 316 aa8.36□□□□□ -1.07
CMTM1-220ENST00000534143 MON2Q7Z3U7 1717 aa8.36□□□□□ -1.07
CMTM1-220ENST00000534143 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa8.36□□□□□ -1.07
CMTM1-220ENST00000534143 MST1RQ04912 1400 aa8.36□□□□□ -1.07
CMTM1-220ENST00000534143 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CMTM1-220ENST00000534143 MSH6P52701 1360 aa8.35□□□□□ -1.07
CMTM1-220ENST00000534143 ACEP12821 1306 aa8.35□□□□□ -1.07
CMTM1-220ENST00000534143 C1orf167Q5SNV9 1468 aa8.35□□□□□ -1.07
CMTM1-220ENST00000534143 ATF3P18847 181 aa8.35□□□□□ -1.07
CMTM1-220ENST00000534143 NSD3Q9BZ95 1437 aa8.35□□□□□ -1.07
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CMTM1-220ENST00000534143 ZNF697Q5TEC3 545 aa8.34□□□□□ -1.07
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CMTM1-220ENST00000534143 SSH2Q76I76 1423 aa8.34□□□□□ -1.07
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CMTM1-220ENST00000534143 USP6P35125 1406 aa8.33□□□□□ -1.08
CMTM1-220ENST00000534143 RALBP1Q15311 655 aa8.33□□□□□ -1.08
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CMTM1-220ENST00000534143 NRKQ7Z2Y5 1582 aa8.33□□□□□ -1.08
CMTM1-220ENST00000534143 ORAI2Q96SN7 254 aa8.33□□□□□ -1.08
CMTM1-220ENST00000534143 PARD3Q8TEW0 1356 aa8.33□□□□□ -1.08
CMTM1-220ENST00000534143 CGNL1Q0VF96 1302 aa8.32□□□□□ -1.08
CMTM1-220ENST00000534143 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa8.32□□□□□ -1.08
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CMTM1-220ENST00000534143 FYB1O15117 783 aa8.32□□□□□ -1.08
CMTM1-220ENST00000534143 SPTLC1O15269 473 aa8.32□□□□□ -1.08
CMTM1-220ENST00000534143 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
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CMTM1-220ENST00000534143 PHLPP1O60346 1717 aa8.32□□□□□ -1.08
CMTM1-220ENST00000534143 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa8.31□□□□□ -1.08
CMTM1-220ENST00000534143 CCER2I3L3R5 266 aa8.31□□□□□ -1.08
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CMTM1-220ENST00000534143 PRR20CP86479 221 aa8.31□□□□□ -1.08
CMTM1-220ENST00000534143 PRR20DP86480 221 aa8.31□□□□□ -1.08
CMTM1-220ENST00000534143 PRR20BP86481 221 aa8.31□□□□□ -1.08
CMTM1-220ENST00000534143 PRR20AP86496 221 aa8.31□□□□□ -1.08
CMTM1-220ENST00000534143 MTMR2Q13614 643 aa8.31□□□□□ -1.08
CMTM1-220ENST00000534143 RIC3Q7Z5B4 369 aa8.31□□□□□ -1.08
CMTM1-220ENST00000534143 SLAIN2Q9P270 581 aa8.31□□□□□ -1.08
CMTM1-220ENST00000534143 NSD2O96028 1365 aa8.31□□□□□ -1.08
CMTM1-220ENST00000534143 SPDYE5A6NIY4 337 aa8.3□□□□□ -1.08
CMTM1-220ENST00000534143 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa8.3□□□□□ -1.08
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