RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532316.1

PKNOX2-AS1-201, Transcript of PKNOX2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene PKNOX2-AS1, Length 586 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 BTBD11A6QL63 1104 aa31.55■■■□□ 2.64
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa31.55■■■□□ 2.64
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 KIF13BQ9NQT8 1826 aa31.54■■■□□ 2.64
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 FKBP8Q14318 412 aa31.54■■■□□ 2.64
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NARFQ9UHQ1 456 aa31.53■■■□□ 2.64
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PXDNLA1KZ92 1463 aa31.52■■■□□ 2.64
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 A0A087WZG4 1122 aa31.51■■■□□ 2.63
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 USPL1Q5W0Q7 1092 aa31.51■■■□□ 2.63
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CANXP27824 592 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MCM10Q7L590 875 aa31.49■■■□□ 2.63
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TM4SF1P30408 202 aa31.48■■■□□ 2.63
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 EIF5P55010 431 aaKnown RBP31.47■■■□□ 2.63
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP31.47■■■□□ 2.63
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 DDR1Q08345 913 aa31.46■■■□□ 2.63
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP31.46■■■□□ 2.63
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP31.45■■■□□ 2.63
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 A0A0G2JLW4 131 aa31.44■■■□□ 2.62
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP31.44■■■□□ 2.62
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PLEKHF1Q96S99 279 aa31.44■■■□□ 2.62
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa31.44■■■□□ 2.62
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 WWC3Q9ULE0 1092 aa31.43■■■□□ 2.62
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa31.43■■■□□ 2.62
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 KCNQ3O43525 872 aa31.41■■■□□ 2.62
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 DPEP1P16444 411 aa31.41■■■□□ 2.62
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 DCTN1Q14203 1278 aa31.41■■■□□ 2.62
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NFIXQ14938 502 aa31.4■■■□□ 2.62
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NFE2L2Q16236 605 aa31.4■■■□□ 2.62
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 BCS1LQ9Y276 419 aa31.4■■■□□ 2.62
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 BCL2L12Q9HB09 334 aa31.39■■■□□ 2.62
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PIM2Q9P1W9 311 aa31.38■■■□□ 2.61
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 A1BGP04217 495 aa31.36■■■□□ 2.61
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SERPINB2P05120 415 aa31.34■■■□□ 2.61
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 KCNA3P22001 575 aa31.34■■■□□ 2.61
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 USP16Q9Y5T5 823 aa31.34■■■□□ 2.61
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ADCY9O60503 1353 aa31.32■■■□□ 2.6
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SCN7AQ01118 1682 aa31.32■■■□□ 2.6
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa31.32■■■□□ 2.6
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NRXN2Q9P2S2 1712 aa31.32■■■□□ 2.6
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ATP10DQ9P241 1426 aa31.32■■■□□ 2.6
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP31.3■■■□□ 2.6
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP31.3■■■□□ 2.6
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 DLG5Q8TDM6 1919 aa31.3■■■□□ 2.6
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP31.29■■■□□ 2.6
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP31.29■■■□□ 2.6
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CARMIL3Q8ND23 1372 aa31.29■■■□□ 2.6
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 LMOD3Q0VAK6 560 aa31.28■■■□□ 2.6
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 BICDL1Q6ZP65 573 aa31.28■■■□□ 2.6
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa31.28■■■□□ 2.6
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa31.27■■■□□ 2.6
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CAMTA2O94983 1202 aa31.27■■■□□ 2.6
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TBC1D9BQ66K14 1250 aa31.27■■■□□ 2.6
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP31.26■■■□□ 2.6
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RGL2O15211 777 aa31.26■■■□□ 2.59
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CHRNA5P30532 468 aa31.26■■■□□ 2.59
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CLEC4GQ6UXB4 293 aa31.26■■■□□ 2.59
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 MIS18AQ9NYP9 233 aa31.26■■■□□ 2.59
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa31.26■■■□□ 2.59
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ZNF652Q9Y2D9 606 aa31.26■■■□□ 2.59
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP31.25■■■□□ 2.59
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 SETDB2Q96T68 719 aa31.25■■■□□ 2.59
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa31.24■■■□□ 2.59
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RIPK4P57078 832 aa31.24■■■□□ 2.59
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 KDM3BQ7LBC6 1761 aa31.23■■■□□ 2.59
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 C1QTNF8P60827 252 aa31.23■■■□□ 2.59
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP31.22■■■□□ 2.59
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 H0YIN7 160 aa31.21■■■□□ 2.59
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 BRIP1Q9BX63 1249 aa31.21■■■□□ 2.59
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 BABAM1Q9NWV8 329 aa31.21■■■□□ 2.59
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 LAMB4A4D0S4 1761 aa31.2■■■□□ 2.59
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 BCORQ6W2J9 1755 aa31.2■■■□□ 2.59
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PDE6BP35913 854 aa31.2■■■□□ 2.59
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TMPOP42166 694 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.59
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.59
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NBPF26B4DH59 902 aa31.19■■■□□ 2.58
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NPHP1O15259 732 aa31.19■■■□□ 2.58
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 C2CD5Q86YS7 1000 aa31.19■■■□□ 2.58
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NBPF15Q8N660 670 aa31.19■■■□□ 2.58
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 PRR5LQ6MZQ0 368 aa31.18■■■□□ 2.58
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TTLL6Q8N841 843 aa31.18■■■□□ 2.58
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CNBD1Q8NA66 436 aa31.18■■■□□ 2.58
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ST5P78524 1137 aa31.17■■■□□ 2.58
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 RUNDC1Q96C34 613 aa31.17■■■□□ 2.58
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 TSPYL4Q9UJ04 414 aa31.17■■■□□ 2.58
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 DLEC1Q9Y238 1755 aa31.15■■■□□ 2.58
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 ERBB4Q15303 1308 aa31.14■■■□□ 2.58
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 CCDC146Q8IYE0 955 aa31.12■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.7 ms