RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525861.5

ACER3-204, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 2,058 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-204ENST00000525861 PDIA6Q15084 440 aa29.13■■■□□ 2.25
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ACER3-204ENST00000525861 SLIT2O94813 1529 aa29.11■■■□□ 2.25
ACER3-204ENST00000525861 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa29.11■■■□□ 2.25
ACER3-204ENST00000525861 GNAI2P04899 355 aa29.1■■■□□ 2.25
ACER3-204ENST00000525861 LAMB4A4D0S4 1761 aa29.1■■■□□ 2.25
ACER3-204ENST00000525861 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa29.1■■■□□ 2.25
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ACER3-204ENST00000525861 CHD1LQ86WJ1 897 aa29.08■■■□□ 2.25
ACER3-204ENST00000525861 USP16Q9Y5T5 823 aa29.08■■■□□ 2.25
ACER3-204ENST00000525861 TNS2Q63HR2 1409 aa29.08■■■□□ 2.25
ACER3-204ENST00000525861 KCPQ6ZWJ8 1503 aa29.08■■■□□ 2.25
ACER3-204ENST00000525861 USP44Q9H0E7 712 aa29.08■■■□□ 2.25
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ACER3-204ENST00000525861 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa29.05■■■□□ 2.24
ACER3-204ENST00000525861 HMMRO75330 724 aa29.05■■■□□ 2.24
ACER3-204ENST00000525861 ANKRD45Q5TZF3 282 aa29.05■■■□□ 2.24
ACER3-204ENST00000525861 LNPKQ9C0E8 428 aa29.05■■■□□ 2.24
ACER3-204ENST00000525861 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa29.04■■■□□ 2.24
ACER3-204ENST00000525861 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa29.04■■■□□ 2.24
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ACER3-204ENST00000525861 LRP10Q7Z4F1 713 aa29.02■■■□□ 2.24
ACER3-204ENST00000525861 ERBB4Q15303 1308 aa29.01■■■□□ 2.24
ACER3-204ENST00000525861 ITGB4P16144 1822 aa29.01■■■□□ 2.23
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ACER3-204ENST00000525861 PIGBQ92521 554 aa28.99■■■□□ 2.23
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ACER3-204ENST00000525861 COPS6Q7L5N1 327 aa28.98■■■□□ 2.23
ACER3-204ENST00000525861 ATP8B2P98198 1209 aa28.97■■■□□ 2.23
ACER3-204ENST00000525861 DDB1Q16531 1140 aa28.97■■■□□ 2.23
ACER3-204ENST00000525861 BARGINQ6ZT62 677 aa28.97■■■□□ 2.23
ACER3-204ENST00000525861 UNC5CLQ8IV45 518 aa28.97■■■□□ 2.23
ACER3-204ENST00000525861 LINS1Q8NG48 757 aa28.97■■■□□ 2.23
ACER3-204ENST00000525861 BCL9O00512 1426 aa28.96■■■□□ 2.23
ACER3-204ENST00000525861 RIC3Q7Z5B4 369 aa28.96■■■□□ 2.23
ACER3-204ENST00000525861 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa28.95■■■□□ 2.23
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ACER3-204ENST00000525861 ATG3Q9NT62 314 aa28.93■■■□□ 2.22
ACER3-204ENST00000525861 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa28.93■■■□□ 2.22
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ACER3-204ENST00000525861 NEXNQ0ZGT2 675 aa28.91■■■□□ 2.22
ACER3-204ENST00000525861 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
ACER3-204ENST00000525861 DOT1LQ8TEK3 1739 aa28.91■■■□□ 2.22
ACER3-204ENST00000525861 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
ACER3-204ENST00000525861 KAT6BQ8WYB5 2073 aa28.9■■■□□ 2.22
ACER3-204ENST00000525861 VPS72Q15906 364 aa28.9■■■□□ 2.22
ACER3-204ENST00000525861 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
ACER3-204ENST00000525861 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
ACER3-204ENST00000525861 HDAC5Q9UQL6 1122 aa28.89■■■□□ 2.22
ACER3-204ENST00000525861 IGKV5-2P06315 115 aa28.89■■■□□ 2.21
ACER3-204ENST00000525861 SSH3Q8TE77 659 aa28.89■■■□□ 2.21
ACER3-204ENST00000525861 UTYO14607 1347 aa28.88■■■□□ 2.21
ACER3-204ENST00000525861 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa28.88■■■□□ 2.21
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ACER3-204ENST00000525861 GRM8O00222 908 aa28.87■■■□□ 2.21
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ACER3-204ENST00000525861 NEURL1BA8MQ27 555 aa28.86■■■□□ 2.21
ACER3-204ENST00000525861 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa28.86■■■□□ 2.21
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ACER3-204ENST00000525861 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
ACER3-204ENST00000525861 BMP2KLQ5H9B9 411 aa28.85■■■□□ 2.21
ACER3-204ENST00000525861 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa28.85■■■□□ 2.21
ACER3-204ENST00000525861 APBB1O00213 710 aa28.84■■■□□ 2.21
ACER3-204ENST00000525861 MTX1Q13505 466 aa28.84■■■□□ 2.21
ACER3-204ENST00000525861 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa28.84■■■□□ 2.21
ACER3-204ENST00000525861 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
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