RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519846.5

CLVS1-205, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLVS1, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-205ENST00000519846 EP400Q96L91 3159 aa6.49□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 PALLDQ8WX93 1383 aa6.49□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 FAM177BA6PVY3 158 aa6.49□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 BTBD11A6QL63 1104 aa6.49□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 APBB1O00213 710 aa6.49□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 FCHSD2O94868 740 aa6.49□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 BICDL1Q6ZP65 573 aa6.49□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 CCDC82Q8N4S0 544 aa6.49□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 STK24Q9Y6E0 443 aa6.49□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 KIF20BQ96Q89 1820 aa6.49□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 NWD2Q9ULI1 1742 aa6.49□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 DNAJC10Q8IXB1 793 aa6.49□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 FAM117AQ9C073 453 aa6.48□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 LRRC4BQ9NT99 713 aa6.48□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 TSPYL4Q9UJ04 414 aa6.48□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 SLC15A2Q16348 729 aa6.48□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 DCAF8L1A6NGE4 600 aa6.48□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 KCNQ3O43525 872 aa6.48□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 KCTD17Q8N5Z5 321 aa6.48□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 SPON1Q9HCB6 807 aa6.48□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 ATG3Q9NT62 314 aa6.48□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 BRWD3Q6RI45 1802 aa6.47□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 PLSCR1O15162 318 aa6.47□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 NFE2L2Q16236 605 aa6.47□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 IL17REQ8NFR9 667 aa6.47□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 CREBZFQ9NS37 354 aa6.47□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 WDR70Q9NW82 654 aa6.47□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 LMO7Q8WWI1 1683 aa6.47□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa6.47□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 DISP2A7MBM2 1401 aa6.47□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa6.47□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 ERVV-2B6SEH9 535 aa6.47□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 POLD1P28340 1107 aa6.47□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 RFC4P35249 363 aa6.47□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 ZNF827Q17R98 1081 aa6.47□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 RNF39Q9H2S5 420 aa6.47□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 SLC52A2Q9HAB3 445 aa6.47□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 NRAPQ86VF7 1730 aa6.47□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 PPP1R37O75864 691 aa6.46□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 RUNDC1Q96C34 613 aa6.46□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 PARD3Q8TEW0 1356 aa6.46□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 MAP3K5Q99683 1374 aa6.46□□□□□ -1.37
CLVS1-205ENST00000519846 MYL6BP14649 208 aa6.46□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 IGSF5Q9NSI5 407 aa6.46□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 PEAK1Q9H792 1746 aa6.46□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 RGPD2P0DJD1 1756 aa6.46□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 TMPOP42166 694 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 AMHR2Q16671 573 aa6.46□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 ZPR1O75312 459 aa6.45□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 STARD3NLO95772 234 aa6.45□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 LMOD3Q0VAK6 560 aa6.45□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 ITPK1Q13572 414 aa6.45□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa6.45□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 COL18A1P39060 1754 aa6.45□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 ANXA1P04083 346 aa6.45□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 TRAPPC3LQ5T215 181 aa6.45□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 RASEFQ8IZ41 740 aa6.45□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 FMNL2Q96PY5 1086 aa6.45□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa6.45□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 A1BGP04217 495 aa6.45□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 SLC27A3Q5K4L6 730 aa6.45□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 CCDC24Q8N4L8 307 aa6.45□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 LINC00116Q8NCU8 138 aa6.45□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 BCL11AQ9H165 835 aa6.44□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 CRKLP46109 303 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 ZNF790Q6PG37 636 aa6.44□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa6.44□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 KRT24Q2M2I5 525 aa6.44□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa6.44□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP6.43□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 GPR162Q16538 588 aa6.43□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa6.43□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 OXER1Q8TDS5 423 aa6.43□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 CCDC87Q9NVE4 849 aa6.43□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 USP16Q9Y5T5 823 aa6.43□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 IRF5Q13568 498 aa6.42□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 ZBTB3Q9H5J0 574 aa6.42□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 LRRC37A3O60309 1634 aa6.42□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 MMP10P09238 476 aa6.42□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 GPTP24298 496 aa6.42□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 SMYD5Q6GMV2 418 aa6.42□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 SLC4A9Q96Q91 983 aa6.42□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 ARID3AQ99856 593 aa6.42□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 KDRP35968 1356 aa6.42□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
CLVS1-205ENST00000519846 USPL1Q5W0Q7 1092 aa6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms