RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 RUNDC1Q96C34 613 aa8.47□□□□□ -1.05
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC52A2Q9HAB3 445 aa8.47□□□□□ -1.05
RRN3P1-201ENST00000514813 ATG3Q9NT62 314 aa8.47□□□□□ -1.05
RRN3P1-201ENST00000514813 MTMR7Q9Y216 660 aa8.47□□□□□ -1.05
RRN3P1-201ENST00000514813 A1BGP04217 495 aa8.47□□□□□ -1.05
RRN3P1-201ENST00000514813 RBM25P49756 843 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
RRN3P1-201ENST00000514813 GLI3P10071 1580 aa8.47□□□□□ -1.05
RRN3P1-201ENST00000514813 ERVV-2B6SEH9 535 aa8.47□□□□□ -1.05
RRN3P1-201ENST00000514813 PLSCR1O15162 318 aa8.47□□□□□ -1.05
RRN3P1-201ENST00000514813 LMOD3Q0VAK6 560 aa8.47□□□□□ -1.05
RRN3P1-201ENST00000514813 NFE2L2Q16236 605 aa8.47□□□□□ -1.05
RRN3P1-201ENST00000514813 FMNL2Q96PY5 1086 aa8.47□□□□□ -1.05
RRN3P1-201ENST00000514813 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.05
RRN3P1-201ENST00000514813 TMPOP42166 694 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
RRN3P1-201ENST00000514813 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
RRN3P1-201ENST00000514813 NRKQ7Z2Y5 1582 aa8.46□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF827Q17R98 1081 aa8.46□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF790Q6PG37 636 aa8.45□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 KIF24Q5T7B8 1368 aa8.45□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 ALS2Q96Q42 1657 aa8.45□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM117AQ9C073 453 aa8.45□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 TNS2Q63HR2 1409 aa8.45□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 NFAT5O94916 1531 aa8.45□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa8.44□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 GPTP24298 496 aa8.44□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 CRKLP46109 303 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 KRT24Q2M2I5 525 aa8.44□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 ZBTB3Q9H5J0 574 aa8.44□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 ITPK1Q13572 414 aa8.44□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC27A3Q5K4L6 730 aa8.44□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 MAP3K5Q99683 1374 aa8.44□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 SLIT3O75094 1523 aa8.44□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 USP16Q9Y5T5 823 aa8.44□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 E2F4Q16254 413 aa8.43□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa8.43□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 LINC00116Q8NCU8 138 aa8.43□□□□□ -1.06
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RRN3P1-201ENST00000514813 PARP3Q9Y6F1 533 aa8.43□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa8.43□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 NUBP1P53384 320 aa8.42□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 USPL1Q5W0Q7 1092 aa8.42□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 CCDC87Q9NVE4 849 aa8.42□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa8.42□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP8.42□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 PLCH1Q4KWH8 1693 aa8.42□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 BCL2L13Q9BXK5 485 aa8.42□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 STK31Q9BXU1 1019 aa8.42□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 BCS1LQ9Y276 419 aa8.42□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 PYGBP11216 843 aa8.41□□□□□ -1.06
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RRN3P1-201ENST00000514813 KIF6Q6ZMV9 814 aa8.41□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 PARD3Q8TEW0 1356 aa8.41□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC4A10Q6U841 1118 aa8.41□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 RGPD5Q99666 1765 aa8.41□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 MTFR1LQ9H019 292 aa8.4□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 FLAD1Q8NFF5 587 aa8.4□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RRN3P1-201ENST00000514813 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa8.4□□□□□ -1.07
RRN3P1-201ENST00000514813 PDE4DQ08499 809 aa8.4□□□□□ -1.07
RRN3P1-201ENST00000514813 RIC3Q7Z5B4 369 aa8.4□□□□□ -1.07
RRN3P1-201ENST00000514813 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
RRN3P1-201ENST00000514813 SETDB2Q96T68 719 aa8.4□□□□□ -1.07
RRN3P1-201ENST00000514813 MON2Q7Z3U7 1717 aa8.39□□□□□ -1.07
RRN3P1-201ENST00000514813 AKAP12Q02952 1782 aa8.39□□□□□ -1.07
RRN3P1-201ENST00000514813 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RRN3P1-201ENST00000514813 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
RRN3P1-201ENST00000514813 SSUH2Q9Y2M2 353 aa8.39□□□□□ -1.07
RRN3P1-201ENST00000514813 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RRN3P1-201ENST00000514813 GNAI1P63096 354 aa8.39□□□□□ -1.07
RRN3P1-201ENST00000514813 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RRN3P1-201ENST00000514813 CHMP3Q9Y3E7 222 aa8.39□□□□□ -1.07
RRN3P1-201ENST00000514813 LTN1O94822 1766 aa8.39□□□□□ -1.07
RRN3P1-201ENST00000514813 GOLGA2Q08379 1002 aa8.39□□□□□ -1.07
RRN3P1-201ENST00000514813 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC4A9Q96Q91 983 aa8.39□□□□□ -1.07
RRN3P1-201ENST00000514813 DUSP27Q5VZP5 1158 aa8.38□□□□□ -1.07
RRN3P1-201ENST00000514813 NLGN1Q8N2Q7 840 aa8.38□□□□□ -1.07
RRN3P1-201ENST00000514813 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RRN3P1-201ENST00000514813 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa8.38□□□□□ -1.07
RRN3P1-201ENST00000514813 TMCO4Q5TGY1 634 aa8.38□□□□□ -1.07
RRN3P1-201ENST00000514813 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RRN3P1-201ENST00000514813 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RRN3P1-201ENST00000514813 RPS6KA4O75676 772 aa8.37□□□□□ -1.07
RRN3P1-201ENST00000514813 DISP2A7MBM2 1401 aa8.37□□□□□ -1.07
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