RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-221	ENST00000511747	POLA2	Q14181	598 aa		32.84	■■■□□ 2.85
SH3BP2-221	ENST00000511747	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	32.83	■■■□□ 2.85
SH3BP2-221	ENST00000511747	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		32.83	■■■□□ 2.85
SH3BP2-221	ENST00000511747	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	32.82	■■■□□ 2.84
SH3BP2-221	ENST00000511747	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		32.82	■■■□□ 2.84
SH3BP2-221	ENST00000511747	SLIT1	O75093	1534 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SH3BP2-221	ENST00000511747	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SH3BP2-221	ENST00000511747	SRGAP3	O43295	1099 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SH3BP2-221	ENST00000511747	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	32.81	■■■□□ 2.84
SH3BP2-221	ENST00000511747	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
SH3BP2-221	ENST00000511747	KCNA6	P17658	529 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SH3BP2-221	ENST00000511747	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SH3BP2-221	ENST00000511747	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SH3BP2-221	ENST00000511747	C14orf37	Q86TY3	774 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SH3BP2-221	ENST00000511747	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SH3BP2-221	ENST00000511747	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	32.77	■■■□□ 2.84
SH3BP2-221	ENST00000511747	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SH3BP2-221	ENST00000511747	SGSM2	O43147	1006 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SH3BP2-221	ENST00000511747	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	32.77	■■■□□ 2.84
SH3BP2-221	ENST00000511747	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	32.76	■■■□□ 2.83
SH3BP2-221	ENST00000511747	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	32.76	■■■□□ 2.83
SH3BP2-221	ENST00000511747	LGR6	Q9HBX8	967 aa		32.76	■■■□□ 2.83
SH3BP2-221	ENST00000511747	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		32.75	■■■□□ 2.83
SH3BP2-221	ENST00000511747	BEND3	Q5T5X7	828 aa		32.75	■■■□□ 2.83
SH3BP2-221	ENST00000511747	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		32.75	■■■□□ 2.83
SH3BP2-221	ENST00000511747	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		32.75	■■■□□ 2.83
SH3BP2-221	ENST00000511747	RAD50	Q92878	1312 aa		32.74	■■■□□ 2.83
SH3BP2-221	ENST00000511747	OFD1	O75665	1012 aa		32.74	■■■□□ 2.83
SH3BP2-221	ENST00000511747	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		32.74	■■■□□ 2.83
SH3BP2-221	ENST00000511747	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
SH3BP2-221	ENST00000511747	PLEKHG5	O94827	1062 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SH3BP2-221	ENST00000511747	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SH3BP2-221	ENST00000511747	CNTROB	Q8N137	903 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SH3BP2-221	ENST00000511747	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SH3BP2-221	ENST00000511747	NBPF4	Q96M43	638 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SH3BP2-221	ENST00000511747	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SH3BP2-221	ENST00000511747	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	32.72	■■■□□ 2.83
SH3BP2-221	ENST00000511747	RNF214	Q8ND24	703 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SH3BP2-221	ENST00000511747	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	32.72	■■■□□ 2.83
SH3BP2-221	ENST00000511747	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SH3BP2-221	ENST00000511747	HOXB7	P09629	217 aa		32.71	■■■□□ 2.83
SH3BP2-221	ENST00000511747	IP6K1	Q92551	441 aa		32.71	■■■□□ 2.83
SH3BP2-221	ENST00000511747	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	32.71	■■■□□ 2.83
SH3BP2-221	ENST00000511747	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	32.7	■■■□□ 2.83
SH3BP2-221	ENST00000511747	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	32.7	■■■□□ 2.82
SH3BP2-221	ENST00000511747	KCNQ3	O43525	872 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SH3BP2-221	ENST00000511747	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	32.69	■■■□□ 2.82
SH3BP2-221	ENST00000511747	TPM2	P07951	284 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SH3BP2-221	ENST00000511747	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	32.69	■■■□□ 2.82
SH3BP2-221	ENST00000511747	USP48	Q86UV5	1035 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SH3BP2-221	ENST00000511747	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SH3BP2-221	ENST00000511747	RASEF	Q8IZ41	740 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SH3BP2-221	ENST00000511747	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SH3BP2-221	ENST00000511747	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		32.68	■■■□□ 2.82
SH3BP2-221	ENST00000511747	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	32.68	■■■□□ 2.82
SH3BP2-221	ENST00000511747	ANXA1	P04083	346 aa		32.68	■■■□□ 2.82
SH3BP2-221	ENST00000511747	TTC14	Q96N46	770 aa		32.68	■■■□□ 2.82
SH3BP2-221	ENST00000511747	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
SH3BP2-221	ENST00000511747	TSPY26P	Q9H489	355 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SH3BP2-221	ENST00000511747	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	32.66	■■■□□ 2.82
SH3BP2-221	ENST00000511747	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	32.66	■■■□□ 2.82
SH3BP2-221	ENST00000511747	AK2	P54819	239 aa		32.66	■■■□□ 2.82
SH3BP2-221	ENST00000511747	SPG7	Q9UQ90	795 aa		32.66	■■■□□ 2.82
SH3BP2-221	ENST00000511747	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SH3BP2-221	ENST00000511747	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SH3BP2-221	ENST00000511747	BTBD11	A6QL63	1104 aa		32.64	■■■□□ 2.82
SH3BP2-221	ENST00000511747	TEF	Q10587	303 aa		32.64	■■■□□ 2.82
SH3BP2-221	ENST00000511747	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	32.64	■■■□□ 2.82
SH3BP2-221	ENST00000511747	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		32.64	■■■□□ 2.82
SH3BP2-221	ENST00000511747	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
SH3BP2-221	ENST00000511747	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
SH3BP2-221	ENST00000511747	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
SH3BP2-221	ENST00000511747	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		32.63	■■■□□ 2.81
SH3BP2-221	ENST00000511747	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
SH3BP2-221	ENST00000511747	RUFY3	Q7L099	469 aa		32.62	■■■□□ 2.81
SH3BP2-221	ENST00000511747	ADCY9	O60503	1353 aa		32.62	■■■□□ 2.81
SH3BP2-221	ENST00000511747	PHF14	O94880	888 aa		32.62	■■■□□ 2.81
SH3BP2-221	ENST00000511747	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SH3BP2-221	ENST00000511747	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	32.6	■■■□□ 2.81
SH3BP2-221	ENST00000511747	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SH3BP2-221	ENST00000511747	USP54	Q70EL1	1684 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SH3BP2-221	ENST00000511747	MCM5	P33992	734 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SH3BP2-221	ENST00000511747	MTX1	Q13505	466 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SH3BP2-221	ENST00000511747	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SH3BP2-221	ENST00000511747	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SH3BP2-221	ENST00000511747	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	32.6	■■■□□ 2.81
SH3BP2-221	ENST00000511747	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	32.59	■■■□□ 2.81
SH3BP2-221	ENST00000511747	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	32.59	■■■□□ 2.81
SH3BP2-221	ENST00000511747	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	32.59	■■■□□ 2.81
SH3BP2-221	ENST00000511747	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		32.59	■■■□□ 2.81
SH3BP2-221	ENST00000511747	SYT1	P21579	422 aa		32.59	■■■□□ 2.81
SH3BP2-221	ENST00000511747	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		32.59	■■■□□ 2.81
SH3BP2-221	ENST00000511747	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
SH3BP2-221	ENST00000511747	STX6	O43752	255 aa		32.58	■■■□□ 2.81
SH3BP2-221	ENST00000511747	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
SH3BP2-221	ENST00000511747	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
SH3BP2-221	ENST00000511747	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		32.58	■■■□□ 2.81
SH3BP2-221	ENST00000511747	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	32.57	■■■□□ 2.8
SH3BP2-221	ENST00000511747	CPA1	P15085	419 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SH3BP2-221	ENST00000511747	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	32.57	■■■□□ 2.8

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