RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		15.41	■□□□□ 0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		15.41	■□□□□ 0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	NFAT5	O94916	1531 aa		15.41	■□□□□ 0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	ABCC6	O95255	1503 aa		15.41	■□□□□ 0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	RGPD5	Q99666	1765 aa		15.4	■□□□□ 0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		15.4	■□□□□ 0.06
SKAP2-209	ENST00000497511	CHD4	Q14839	1912 aa		15.39	■□□□□ 0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		15.39	■□□□□ 0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	15.39	■□□□□ 0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	NME9	Q86XW9	330 aa		15.39	■□□□□ 0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	PSEN2	P49810	448 aa		15.38	■□□□□ 0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	15.38	■□□□□ 0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		15.37	■□□□□ 0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	USP31	Q70CQ4	1352 aa		15.36	■□□□□ 0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	PAPPA	Q13219	1627 aa		15.36	■□□□□ 0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	TK2	O00142	265 aa		15.36	■□□□□ 0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	GRIN3B	O60391	1043 aa		15.36	■□□□□ 0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNQ4	P56696	695 aa		15.36	■□□□□ 0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	IFFO2	Q5TF58	517 aa		15.36	■□□□□ 0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		15.36	■□□□□ 0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	NEUROD1	Q13562	356 aa		15.35	■□□□□ 0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		15.35	■□□□□ 0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		15.35	■□□□□ 0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	BTAF1	O14981	1849 aa		15.35	■□□□□ 0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP3K7	O43318	606 aa		15.34	■□□□□ 0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	15.34	■□□□□ 0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		15.34	■□□□□ 0.05
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		15.33	■□□□□ 0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		15.33	■□□□□ 0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		15.33	■□□□□ 0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	15.33	■□□□□ 0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	OSBP	P22059	807 aa		15.32	■□□□□ 0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		15.32	■□□□□ 0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		15.32	■□□□□ 0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	SEMA3E	O15041	775 aa		15.31	■□□□□ 0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	IP6K1	Q92551	441 aa		15.31	■□□□□ 0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		15.31	■□□□□ 0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		15.31	■□□□□ 0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	15.3	■□□□□ 0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	MSL1	Q68DK7	614 aa		15.3	■□□□□ 0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		15.3	■□□□□ 0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		15.3	■□□□□ 0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		15.3	■□□□□ 0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		15.3	■□□□□ 0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	15.29	■□□□□ 0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	USP47	Q96K76	1375 aa		15.29	■□□□□ 0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	15.29	■□□□□ 0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	AMPH	P49418	695 aa		15.29	■□□□□ 0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	15.29	■□□□□ 0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	15.29	■□□□□ 0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		15.29	■□□□□ 0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC24A1	O60721	1099 aa		15.28	■□□□□ 0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	LTN1	O94822	1766 aa		15.28	■□□□□ 0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	15.27	■□□□□ 0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	15.27	■□□□□ 0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	15.27	■□□□□ 0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	COG3	Q96JB2	828 aa		15.27	■□□□□ 0.04
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP10D	Q9P241	1426 aa		15.26	■□□□□ 0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		15.26	■□□□□ 0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		15.26	■□□□□ 0.03
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PP64	1363 aa		15.25	■□□□□ 0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		15.25	■□□□□ 0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		15.25	■□□□□ 0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	HOXC9	P31274	260 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		15.24	■□□□□ 0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		15.23	■□□□□ 0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	USP54	Q70EL1	1684 aa		15.23	■□□□□ 0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	COL9A1	P20849	921 aa		15.23	■□□□□ 0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		15.23	■□□□□ 0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		15.23	■□□□□ 0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	NSD2	O96028	1365 aa		15.23	■□□□□ 0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		15.22	■□□□□ 0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		15.21	■□□□□ 0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		15.21	■□□□□ 0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	AK7	Q96M32	723 aa		15.21	■□□□□ 0.03
SKAP2-209	ENST00000497511	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	HSPA6	P17066	643 aa		15.2	■□□□□ 0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	FBLN1	P23142	703 aa		15.2	■□□□□ 0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	MEGF6	O75095	1541 aa		15.2	■□□□□ 0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	HR	O43593	1189 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		15.19	■□□□□ 0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	CEP350	Q5VT06	3117 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	MMRN1	Q13201	1228 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	NBPF4	Q96M43	638 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	PALLD	Q8WX93	1383 aa		15.18	■□□□□ 0.02
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		15.17	■□□□□ 0.02

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