RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, human

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SIMC1-208	ENST00000495423	RNF181	Q9P0P0	153 aa		31.49	■■■□□ 2.63
SIMC1-208	ENST00000495423	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	31.49	■■■□□ 2.63
SIMC1-208	ENST00000495423	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		31.48	■■■□□ 2.63
SIMC1-208	ENST00000495423	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		31.48	■■■□□ 2.63
SIMC1-208	ENST00000495423	ZPR1	O75312	459 aa		31.47	■■■□□ 2.63
SIMC1-208	ENST00000495423	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		31.46	■■■□□ 2.63
SIMC1-208	ENST00000495423	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	31.44	■■■□□ 2.62
SIMC1-208	ENST00000495423	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		31.44	■■■□□ 2.62
SIMC1-208	ENST00000495423	LGR6	Q9HBX8	967 aa		31.43	■■■□□ 2.62
SIMC1-208	ENST00000495423	NARF	Q9UHQ1	456 aa		31.43	■■■□□ 2.62
SIMC1-208	ENST00000495423	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		31.43	■■■□□ 2.62
SIMC1-208	ENST00000495423	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	31.43	■■■□□ 2.62
SIMC1-208	ENST00000495423	KLRG1	Q96E93	195 aa		31.42	■■■□□ 2.62
SIMC1-208	ENST00000495423	COL15A1	P39059	1388 aa		31.42	■■■□□ 2.62
SIMC1-208	ENST00000495423	RRAGC	Q9HB90	399 aa		31.41	■■■□□ 2.62
SIMC1-208	ENST00000495423	PCNT	O95613	3336 aa		31.41	■■■□□ 2.62
SIMC1-208	ENST00000495423	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	31.4	■■■□□ 2.62
SIMC1-208	ENST00000495423	NFIX	Q14938	502 aa		31.4	■■■□□ 2.62
SIMC1-208	ENST00000495423	JMY	Q8N9B5	988 aa		31.39	■■■□□ 2.62
SIMC1-208	ENST00000495423	HTRA3	P83110	453 aa		31.38	■■■□□ 2.61
SIMC1-208	ENST00000495423	SLC39A6	Q13433	755 aa		31.38	■■■□□ 2.61
SIMC1-208	ENST00000495423	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	31.38	■■■□□ 2.61
SIMC1-208	ENST00000495423	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		31.38	■■■□□ 2.61
SIMC1-208	ENST00000495423	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	31.37	■■■□□ 2.61
SIMC1-208	ENST00000495423	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		31.37	■■■□□ 2.61
SIMC1-208	ENST00000495423	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		31.37	■■■□□ 2.61
SIMC1-208	ENST00000495423	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		31.36	■■■□□ 2.61
SIMC1-208	ENST00000495423	RASSF7	Q02833	373 aa		31.35	■■■□□ 2.61
SIMC1-208	ENST00000495423	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	31.35	■■■□□ 2.61
SIMC1-208	ENST00000495423	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		31.34	■■■□□ 2.61
SIMC1-208	ENST00000495423	SCN7A	Q01118	1682 aa		31.33	■■■□□ 2.61
SIMC1-208	ENST00000495423	SERPINB2	P05120	415 aa		31.33	■■■□□ 2.61
SIMC1-208	ENST00000495423	HMOX1	P09601	288 aa		31.33	■■■□□ 2.61
SIMC1-208	ENST00000495423	LMNB1	P20700	586 aa		31.33	■■■□□ 2.61
SIMC1-208	ENST00000495423	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		31.31	■■■□□ 2.6
SIMC1-208	ENST00000495423	PRELP	P51888	382 aa		31.31	■■■□□ 2.6
SIMC1-208	ENST00000495423	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	31.31	■■■□□ 2.6
SIMC1-208	ENST00000495423	TTLL6	Q8N841	843 aa		31.31	■■■□□ 2.6
SIMC1-208	ENST00000495423	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		31.3	■■■□□ 2.6
SIMC1-208	ENST00000495423	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	31.29	■■■□□ 2.6
SIMC1-208	ENST00000495423	GLTPD2	A6NH11	291 aa		31.28	■■■□□ 2.6
SIMC1-208	ENST00000495423	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		31.27	■■■□□ 2.6
SIMC1-208	ENST00000495423	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	31.26	■■■□□ 2.59
SIMC1-208	ENST00000495423	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	31.26	■■■□□ 2.59
SIMC1-208	ENST00000495423		H0YIN7	160 aa		31.25	■■■□□ 2.59
SIMC1-208	ENST00000495423	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	31.25	■■■□□ 2.59
SIMC1-208	ENST00000495423	CACNA1S	Q13698	1873 aa		31.25	■■■□□ 2.59
SIMC1-208	ENST00000495423	NFKBIE	O00221	500 aa		31.24	■■■□□ 2.59
SIMC1-208	ENST00000495423	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	31.24	■■■□□ 2.59
SIMC1-208	ENST00000495423	STARD3NL	O95772	234 aa		31.24	■■■□□ 2.59
SIMC1-208	ENST00000495423		A0A087WZG4	1122 aa		31.23	■■■□□ 2.59
SIMC1-208	ENST00000495423	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		31.22	■■■□□ 2.59
SIMC1-208	ENST00000495423	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	31.22	■■■□□ 2.59
SIMC1-208	ENST00000495423	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		31.22	■■■□□ 2.59
SIMC1-208	ENST00000495423	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	31.21	■■■□□ 2.59
SIMC1-208	ENST00000495423	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		31.21	■■■□□ 2.59
SIMC1-208	ENST00000495423	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		31.21	■■■□□ 2.59
SIMC1-208	ENST00000495423	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		31.2	■■■□□ 2.59
SIMC1-208	ENST00000495423	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	31.2	■■■□□ 2.59
SIMC1-208	ENST00000495423	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		31.19	■■■□□ 2.58
SIMC1-208	ENST00000495423	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		31.18	■■■□□ 2.58
SIMC1-208	ENST00000495423	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		31.17	■■■□□ 2.58
SIMC1-208	ENST00000495423	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	31.17	■■■□□ 2.58
SIMC1-208	ENST00000495423	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		31.17	■■■□□ 2.58
SIMC1-208	ENST00000495423	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	31.17	■■■□□ 2.58
SIMC1-208	ENST00000495423	SLX4	Q8IY92	1834 aa		31.17	■■■□□ 2.58
SIMC1-208	ENST00000495423	ZNF790	Q6PG37	636 aa		31.16	■■■□□ 2.58
SIMC1-208	ENST00000495423	POTEC	B2RU33	542 aa		31.15	■■■□□ 2.58
SIMC1-208	ENST00000495423	PDE6B	P35913	854 aa		31.15	■■■□□ 2.58
SIMC1-208	ENST00000495423	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	31.14	■■■□□ 2.58
SIMC1-208	ENST00000495423	TEF	Q10587	303 aa		31.14	■■■□□ 2.58
SIMC1-208	ENST00000495423	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		31.14	■■■□□ 2.58
SIMC1-208	ENST00000495423	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		31.14	■■■□□ 2.58
SIMC1-208	ENST00000495423	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		31.13	■■■□□ 2.57
SIMC1-208	ENST00000495423	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		31.13	■■■□□ 2.57
SIMC1-208	ENST00000495423	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	31.12	■■■□□ 2.57
SIMC1-208	ENST00000495423	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		31.12	■■■□□ 2.57
SIMC1-208	ENST00000495423	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	31.12	■■■□□ 2.57
SIMC1-208	ENST00000495423	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		31.11	■■■□□ 2.57
SIMC1-208	ENST00000495423	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		31.11	■■■□□ 2.57
SIMC1-208	ENST00000495423	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		31.1	■■■□□ 2.57
SIMC1-208	ENST00000495423	C21orf2	O43822	256 aa		31.1	■■■□□ 2.57
SIMC1-208	ENST00000495423	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		31.08	■■■□□ 2.57
SIMC1-208	ENST00000495423	ERFE	Q4G0M1	354 aa		31.08	■■■□□ 2.57
SIMC1-208	ENST00000495423	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		31.08	■■■□□ 2.57
SIMC1-208	ENST00000495423	TNS4	Q8IZW8	715 aa		31.07	■■■□□ 2.56
SIMC1-208	ENST00000495423	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	31.07	■■■□□ 2.56
SIMC1-208	ENST00000495423	SCN4A	P35499	1836 aa		31.07	■■■□□ 2.56
SIMC1-208	ENST00000495423	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	31.06	■■■□□ 2.56
SIMC1-208	ENST00000495423	CAMTA2	O94983	1202 aa		31.06	■■■□□ 2.56
SIMC1-208	ENST00000495423	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		31.06	■■■□□ 2.56
SIMC1-208	ENST00000495423	A1BG	P04217	495 aa		31.05	■■■□□ 2.56
SIMC1-208	ENST00000495423	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	31.05	■■■□□ 2.56
SIMC1-208	ENST00000495423	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	31.05	■■■□□ 2.56
SIMC1-208	ENST00000495423	CNBD1	Q8NA66	436 aa		31.05	■■■□□ 2.56
SIMC1-208	ENST00000495423	SETDB2	Q96T68	719 aa		31.05	■■■□□ 2.56
SIMC1-208	ENST00000495423	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		31.05	■■■□□ 2.56
SIMC1-208	ENST00000495423	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	31.05	■■■□□ 2.56
SIMC1-208	ENST00000495423	STYK1	Q6J9G0	422 aa		31.04	■■■□□ 2.56
SIMC1-208	ENST00000495423	CNKSR1	Q969H4	720 aa		31.04	■■■□□ 2.56

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