RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493552.1

CTBP2-210, Transcript of C-terminal binding protein 2, human

TSL 5

Gene CTBP2, Length 100 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTBP2-210	ENST00000493552	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	LMNB1	P20700	586 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	SLC39A6	Q13433	755 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	NFIX	Q14938	502 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	TTLL6	Q8N841	843 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	KLRG1	Q96E93	195 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	COL15A1	P39059	1388 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	TJP1	Q07157	1748 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	GLTPD2	A6NH11	291 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	PDE6B	P35913	854 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	HTRA3	P83110	453 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	TEF	Q10587	303 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	JMY	Q8N9B5	988 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	NPHP1	O15259	732 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	RASSF7	Q02833	373 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	SETDB2	Q96T68	719 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	CEP350	Q5VT06	3117 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	MRC1	P22897	1456 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	WDR90	Q96KV7	1748 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CTBP2-210	ENST00000493552	NFKBIE	O00221	500 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	C21orf2	O43822	256 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	ERFE	Q4G0M1	354 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	ZNF790	Q6PG37	636 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	CNKSR1	Q969H4	720 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	BTBD11	A6QL63	1104 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	A1BG	P04217	495 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	PRELP	P51888	382 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	ST5	P78524	1137 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	SOGA3	Q5TF21	947 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	STYK1	Q6J9G0	422 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	TNS4	Q8IZW8	715 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	CNBD1	Q8NA66	436 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	CFAP53	Q96M91	514 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	POTEC	B2RU33	542 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	CAPN15	O75808	1086 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	SRGN	P10124	158 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	CHADL	Q6NUI6	762 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	MASTL	Q96GX5	879 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	NUDC	Q9Y266	331 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	KCNQ3	O43525	872 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	CAMTA2	O94983	1202 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CTBP2-210	ENST00000493552	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63

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