RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 RBM25P49756 843 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
TOM1-216ENST00000492723 PKD1L3Q7Z443 1732 aa20.7■□□□□ 0.9
TOM1-216ENST00000492723 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
TOM1-216ENST00000492723 KSR2Q6VAB6 950 aa20.69■□□□□ 0.9
TOM1-216ENST00000492723 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.69■□□□□ 0.9
TOM1-216ENST00000492723 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
TOM1-216ENST00000492723 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa20.68■□□□□ 0.9
TOM1-216ENST00000492723 TTC5Q8N0Z6 440 aa20.68■□□□□ 0.9
TOM1-216ENST00000492723 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
TOM1-216ENST00000492723 SDSP20132 328 aa20.68■□□□□ 0.9
TOM1-216ENST00000492723 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
TOM1-216ENST00000492723 SSH3Q8TE77 659 aa20.68■□□□□ 0.9
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TOM1-216ENST00000492723 PDE1AP54750 535 aa20.67■□□□□ 0.9
TOM1-216ENST00000492723 CABP4P57796 275 aa20.67■□□□□ 0.9
TOM1-216ENST00000492723 PDIA6Q15084 440 aa20.67■□□□□ 0.9
TOM1-216ENST00000492723 MRC1P22897 1456 aa20.66■□□□□ 0.9
TOM1-216ENST00000492723 SRGAP3O43295 1099 aa20.66■□□□□ 0.9
TOM1-216ENST00000492723 DDX58O95786 925 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
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TOM1-216ENST00000492723 STRN4Q9NRL3 753 aa20.66■□□□□ 0.9
TOM1-216ENST00000492723 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
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TOM1-216ENST00000492723 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
TOM1-216ENST00000492723 C5P01031 1676 aa20.65■□□□□ 0.9
TOM1-216ENST00000492723 ALDH1L1O75891 902 aa20.65■□□□□ 0.9
TOM1-216ENST00000492723 MYL6BP14649 208 aa20.65■□□□□ 0.9
TOM1-216ENST00000492723 ABCA3Q99758 1704 aa20.64■□□□□ 0.9
TOM1-216ENST00000492723 POLA2Q14181 598 aa20.64■□□□□ 0.9
TOM1-216ENST00000492723 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
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TOM1-216ENST00000492723 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa20.64■□□□□ 0.89
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TOM1-216ENST00000492723 FMNL2Q96PY5 1086 aa20.64■□□□□ 0.89
TOM1-216ENST00000492723 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
TOM1-216ENST00000492723 EVA1CP58658 441 aa20.63■□□□□ 0.89
TOM1-216ENST00000492723 NFKBIBQ15653 356 aa20.63■□□□□ 0.89
TOM1-216ENST00000492723 TSHZ3Q63HK5 1081 aa20.63■□□□□ 0.89
TOM1-216ENST00000492723 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
TOM1-216ENST00000492723 MX1P20591 662 aa20.63■□□□□ 0.89
TOM1-216ENST00000492723 CASC1Q6TDU7 716 aa20.63■□□□□ 0.89
TOM1-216ENST00000492723 CARD10Q9BWT7 1032 aa20.63■□□□□ 0.89
TOM1-216ENST00000492723 SALL3Q9BXA9 1300 aa20.63■□□□□ 0.89
TOM1-216ENST00000492723 NHSL1Q5SYE7 1610 aa20.63■□□□□ 0.89
TOM1-216ENST00000492723 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
TOM1-216ENST00000492723 LINS1Q8NG48 757 aa20.62■□□□□ 0.89
TOM1-216ENST00000492723 USP16Q9Y5T5 823 aa20.62■□□□□ 0.89
TOM1-216ENST00000492723 IL2RBP14784 551 aa20.61■□□□□ 0.89
TOM1-216ENST00000492723 RIC3Q7Z5B4 369 aa20.61■□□□□ 0.89
TOM1-216ENST00000492723 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa20.61■□□□□ 0.89
TOM1-216ENST00000492723 RAB11FIP3O75154 756 aa20.61■□□□□ 0.89
TOM1-216ENST00000492723 HSCBQ8IWL3 235 aa20.61■□□□□ 0.89
TOM1-216ENST00000492723 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa20.61■□□□□ 0.89
TOM1-216ENST00000492723 XAGE3Q8WTP9 111 aa20.6■□□□□ 0.89
TOM1-216ENST00000492723 KIF2CQ99661 725 aa20.6■□□□□ 0.89
TOM1-216ENST00000492723 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
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TOM1-216ENST00000492723 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
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TOM1-216ENST00000492723 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.58■□□□□ 0.89
TOM1-216ENST00000492723 GRM8O00222 908 aa20.58■□□□□ 0.88
TOM1-216ENST00000492723 RHPN1Q8TCX5 695 aa20.58■□□□□ 0.88
TOM1-216ENST00000492723 STAP2Q9UGK3 403 aa20.57■□□□□ 0.88
TOM1-216ENST00000492723 NEXNQ0ZGT2 675 aa20.57■□□□□ 0.88
TOM1-216ENST00000492723 MTX1Q13505 466 aa20.57■□□□□ 0.88
TOM1-216ENST00000492723 KIF1BPQ96EK5 621 aa20.57■□□□□ 0.88
TOM1-216ENST00000492723 ERVV-2B6SEH9 535 aa20.56■□□□□ 0.88
TOM1-216ENST00000492723 IGKV5-2P06315 115 aa20.56■□□□□ 0.88
TOM1-216ENST00000492723 NUTM1Q86Y26 1132 aa20.56■□□□□ 0.88
TOM1-216ENST00000492723 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.56■□□□□ 0.88
TOM1-216ENST00000492723 SNX21Q969T3 373 aa20.56■□□□□ 0.88
TOM1-216ENST00000492723 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
TOM1-216ENST00000492723 USP26Q9BXU7 913 aa20.55■□□□□ 0.88
TOM1-216ENST00000492723 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa20.55■□□□□ 0.88
TOM1-216ENST00000492723 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa20.55■□□□□ 0.88
TOM1-216ENST00000492723 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.55■□□□□ 0.88
TOM1-216ENST00000492723 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
TOM1-216ENST00000492723 SUCLG2Q96I99 432 aa20.54■□□□□ 0.88
TOM1-216ENST00000492723 MYD88Q99836 296 aa20.54■□□□□ 0.88
TOM1-216ENST00000492723 UTYO14607 1347 aa20.54■□□□□ 0.88
TOM1-216ENST00000492723 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
TOM1-216ENST00000492723 RILPL2Q969X0 211 aa20.54■□□□□ 0.88
TOM1-216ENST00000492723 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
TOM1-216ENST00000492723 NEURL1BA8MQ27 555 aa20.53■□□□□ 0.88
TOM1-216ENST00000492723 ERC2O15083 957 aa20.53■□□□□ 0.88
TOM1-216ENST00000492723 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
TOM1-216ENST00000492723 BTG4Q9NY30 223 aa20.53■□□□□ 0.88
TOM1-216ENST00000492723 REC8O95072 547 aa20.53■□□□□ 0.88
TOM1-216ENST00000492723 AOX1Q06278 1338 aa20.53■□□□□ 0.88
TOM1-216ENST00000492723 KAZALD1Q96I82 304 aa20.52■□□□□ 0.88
TOM1-216ENST00000492723 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
TOM1-216ENST00000492723 GLI3P10071 1580 aa20.51■□□□□ 0.87
TOM1-216ENST00000492723 GCKRQ14397 625 aa20.51■□□□□ 0.87
TOM1-216ENST00000492723 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
TOM1-216ENST00000492723 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
TOM1-216ENST00000492723 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa20.51■□□□□ 0.87
TOM1-216ENST00000492723 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
TOM1-216ENST00000492723 SHANK3Q9BYB0 1731 aa20.5■□□□□ 0.87
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