RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492185.5

NELFE-211, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,786 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-211ENST00000492185 ANXA1P04083 346 aa24.87■■□□□ 1.57
NELFE-211ENST00000492185 IL2RBP14784 551 aa24.86■■□□□ 1.57
NELFE-211ENST00000492185 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
NELFE-211ENST00000492185 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
NELFE-211ENST00000492185 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
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NELFE-211ENST00000492185 KSR2Q6VAB6 950 aa24.85■■□□□ 1.57
NELFE-211ENST00000492185 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
NELFE-211ENST00000492185 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
NELFE-211ENST00000492185 ALDH1L1O75891 902 aa24.84■■□□□ 1.57
NELFE-211ENST00000492185 ERVV-2B6SEH9 535 aa24.83■■□□□ 1.57
NELFE-211ENST00000492185 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa24.82■■□□□ 1.56
NELFE-211ENST00000492185 CABP4P57796 275 aa24.82■■□□□ 1.56
NELFE-211ENST00000492185 PLCH1Q4KWH8 1693 aa24.82■■□□□ 1.56
NELFE-211ENST00000492185 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
NELFE-211ENST00000492185 SSH3Q8TE77 659 aa24.82■■□□□ 1.56
NELFE-211ENST00000492185 LRP10Q7Z4F1 713 aa24.81■■□□□ 1.56
NELFE-211ENST00000492185 FMNL2Q96PY5 1086 aa24.81■■□□□ 1.56
NELFE-211ENST00000492185 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa24.81■■□□□ 1.56
NELFE-211ENST00000492185 POLA2Q14181 598 aa24.8■■□□□ 1.56
NELFE-211ENST00000492185 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa24.8■■□□□ 1.56
NELFE-211ENST00000492185 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa24.8■■□□□ 1.56
NELFE-211ENST00000492185 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
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NELFE-211ENST00000492185 TTC5Q8N0Z6 440 aa24.8■■□□□ 1.56
NELFE-211ENST00000492185 DISP2A7MBM2 1401 aa24.8■■□□□ 1.56
NELFE-211ENST00000492185 KCPQ6ZWJ8 1503 aa24.79■■□□□ 1.56
NELFE-211ENST00000492185 EVA1CP58658 441 aa24.79■■□□□ 1.56
NELFE-211ENST00000492185 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
NELFE-211ENST00000492185 STRN4Q9NRL3 753 aa24.79■■□□□ 1.56
NELFE-211ENST00000492185 TNS2Q63HR2 1409 aa24.78■■□□□ 1.56
NELFE-211ENST00000492185 OSBPL3Q9H4L5 887 aa24.78■■□□□ 1.56
NELFE-211ENST00000492185 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
NELFE-211ENST00000492185 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
NELFE-211ENST00000492185 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
NELFE-211ENST00000492185 UTYO14607 1347 aa24.77■■□□□ 1.56
NELFE-211ENST00000492185 SALL3Q9BXA9 1300 aa24.77■■□□□ 1.56
NELFE-211ENST00000492185 WNK3Q9BYP7 1800 aa24.77■■□□□ 1.56
NELFE-211ENST00000492185 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
NELFE-211ENST00000492185 MTX1Q13505 466 aa24.76■■□□□ 1.55
NELFE-211ENST00000492185 LINS1Q8NG48 757 aa24.76■■□□□ 1.55
NELFE-211ENST00000492185 PHLPP1O60346 1717 aa24.75■■□□□ 1.55
NELFE-211ENST00000492185 C22orf23Q9BZE7 217 aa24.75■■□□□ 1.55
NELFE-211ENST00000492185 BTG4Q9NY30 223 aa24.75■■□□□ 1.55
NELFE-211ENST00000492185 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa24.75■■□□□ 1.55
NELFE-211ENST00000492185 USP16Q9Y5T5 823 aa24.75■■□□□ 1.55
NELFE-211ENST00000492185 ERBB4Q15303 1308 aa24.75■■□□□ 1.55
NELFE-211ENST00000492185 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
NELFE-211ENST00000492185 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa24.74■■□□□ 1.55
NELFE-211ENST00000492185 CDC45O75419 566 aa24.73■■□□□ 1.55
NELFE-211ENST00000492185 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa24.73■■□□□ 1.55
NELFE-211ENST00000492185 LRRCC1Q9C099 1032 aa24.73■■□□□ 1.55
NELFE-211ENST00000492185 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa24.73■■□□□ 1.55
NELFE-211ENST00000492185 RBM25P49756 843 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
NELFE-211ENST00000492185 HDAC5Q9UQL6 1122 aa24.72■■□□□ 1.55
NELFE-211ENST00000492185 NRAPQ86VF7 1730 aa24.71■■□□□ 1.55
NELFE-211ENST00000492185 LRP6O75581 1613 aa24.71■■□□□ 1.55
NELFE-211ENST00000492185 RAB11FIP3O75154 756 aa24.71■■□□□ 1.55
NELFE-211ENST00000492185 XAGE3Q8WTP9 111 aa24.71■■□□□ 1.55
NELFE-211ENST00000492185 APBB1O00213 710 aa24.7■■□□□ 1.55
NELFE-211ENST00000492185 PDE1AP54750 535 aa24.7■■□□□ 1.55
NELFE-211ENST00000492185 ITGB4P16144 1822 aa24.7■■□□□ 1.54
NELFE-211ENST00000492185 IGKV5-2P06315 115 aa24.69■■□□□ 1.54
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NELFE-211ENST00000492185 COPS6Q7L5N1 327 aa24.69■■□□□ 1.54
NELFE-211ENST00000492185 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
NELFE-211ENST00000492185 STAP2Q9UGK3 403 aa24.69■■□□□ 1.54
NELFE-211ENST00000492185 GRM8O00222 908 aa24.68■■□□□ 1.54
NELFE-211ENST00000492185 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
NELFE-211ENST00000492185 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
NELFE-211ENST00000492185 NUP188Q5SRE5 1749 aa24.68■■□□□ 1.54
NELFE-211ENST00000492185 MYL6BP14649 208 aa24.67■■□□□ 1.54
NELFE-211ENST00000492185 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
NELFE-211ENST00000492185 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
NELFE-211ENST00000492185 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
NELFE-211ENST00000492185 AOX1Q06278 1338 aa24.67■■□□□ 1.54
NELFE-211ENST00000492185 SRGAP3O43295 1099 aa24.67■■□□□ 1.54
NELFE-211ENST00000492185 SLC4A3P48751 1232 aa24.67■■□□□ 1.54
NELFE-211ENST00000492185 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.67■■□□□ 1.54
NELFE-211ENST00000492185 SDSP20132 328 aa24.66■■□□□ 1.54
NELFE-211ENST00000492185 BECN1Q14457 450 aa24.66■■□□□ 1.54
NELFE-211ENST00000492185 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
NELFE-211ENST00000492185 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.65■■□□□ 1.54
NELFE-211ENST00000492185 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa24.65■■□□□ 1.54
NELFE-211ENST00000492185 COL15A1P39059 1388 aa24.65■■□□□ 1.54
NELFE-211ENST00000492185 KAZALD1Q96I82 304 aa24.65■■□□□ 1.54
NELFE-211ENST00000492185 NBPF26B4DH59 902 aa24.64■■□□□ 1.53
NELFE-211ENST00000492185 NBPF14Q5TI25 921 aa24.64■■□□□ 1.53
NELFE-211ENST00000492185 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
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NELFE-211ENST00000492185 SURF6O75683 361 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
NELFE-211ENST00000492185 MX1P20591 662 aa24.63■■□□□ 1.53
NELFE-211ENST00000492185 NEXNQ0ZGT2 675 aa24.63■■□□□ 1.53
NELFE-211ENST00000492185 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa24.63■■□□□ 1.53
NELFE-211ENST00000492185 NWD2Q9ULI1 1742 aa24.62■■□□□ 1.53
NELFE-211ENST00000492185 GCKRQ14397 625 aa24.62■■□□□ 1.53
NELFE-211ENST00000492185 KIF1BPQ96EK5 621 aa24.62■■□□□ 1.53
NELFE-211ENST00000492185 SUCLG2Q96I99 432 aa24.62■■□□□ 1.53
NELFE-211ENST00000492185 PLBD2Q8NHP8 589 aa24.62■■□□□ 1.53
NELFE-211ENST00000492185 RHPN1Q8TCX5 695 aa24.62■■□□□ 1.53
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