RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
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NELFE-210ENST00000491139 RASSF7Q02833 373 aa28.4■■■□□ 2.14
NELFE-210ENST00000491139 NFIXQ14938 502 aa28.4■■■□□ 2.14
NELFE-210ENST00000491139 NARFQ9UHQ1 456 aa28.4■■■□□ 2.14
NELFE-210ENST00000491139 LGR6Q9HBX8 967 aa28.39■■■□□ 2.14
NELFE-210ENST00000491139 LMNB1P20700 586 aa28.38■■■□□ 2.13
NELFE-210ENST00000491139 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
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NELFE-210ENST00000491139 SLC39A6Q13433 755 aa28.37■■■□□ 2.13
NELFE-210ENST00000491139 COL15A1P39059 1388 aa28.37■■■□□ 2.13
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NELFE-210ENST00000491139 TTLL6Q8N841 843 aa28.35■■■□□ 2.13
NELFE-210ENST00000491139 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa28.35■■■□□ 2.13
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NELFE-210ENST00000491139 MRC1P22897 1456 aa28.32■■■□□ 2.12
NELFE-210ENST00000491139 NRXN2Q9P2S2 1712 aa28.32■■■□□ 2.12
NELFE-210ENST00000491139 H0YIN7 160 aa28.31■■■□□ 2.12
NELFE-210ENST00000491139 PRELPP51888 382 aa28.31■■■□□ 2.12
NELFE-210ENST00000491139 VSIG10Q8N0Z9 540 aa28.31■■■□□ 2.12
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NELFE-210ENST00000491139 DLEC1Q9Y238 1755 aa28.29■■■□□ 2.12
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NELFE-210ENST00000491139 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.27■■■□□ 2.12
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NELFE-210ENST00000491139 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa28.25■■■□□ 2.11
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NELFE-210ENST00000491139 NFKBIEO00221 500 aa28.25■■■□□ 2.11
NELFE-210ENST00000491139 CAPN15O75808 1086 aa28.25■■■□□ 2.11
NELFE-210ENST00000491139 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
NELFE-210ENST00000491139 CARMIL3Q8ND23 1372 aa28.24■■■□□ 2.11
NELFE-210ENST00000491139 A0A087WZG4 1122 aa28.24■■■□□ 2.11
NELFE-210ENST00000491139 DPY19L2Q6NUT2 758 aa28.24■■■□□ 2.11
NELFE-210ENST00000491139 TTC5Q8N0Z6 440 aa28.24■■■□□ 2.11
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NELFE-210ENST00000491139 TIAM2Q8IVF5 1701 aa28.22■■■□□ 2.11
NELFE-210ENST00000491139 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa28.22■■■□□ 2.11
NELFE-210ENST00000491139 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP28.21■■■□□ 2.117e-7■□□□□ 9.6
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NELFE-210ENST00000491139 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
NELFE-210ENST00000491139 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
NELFE-210ENST00000491139 PDE6BP35913 854 aa28.2■■■□□ 2.1
NELFE-210ENST00000491139 BRIP1Q9BX63 1249 aa28.2■■■□□ 2.1
NELFE-210ENST00000491139 POTECB2RU33 542 aa28.19■■■□□ 2.1
NELFE-210ENST00000491139 TBC1D9BQ66K14 1250 aa28.19■■■□□ 2.1
NELFE-210ENST00000491139 UBR2Q8IWV8 1755 aa28.19■■■□□ 2.1
NELFE-210ENST00000491139 C21orf2O43822 256 aa28.18■■■□□ 2.1
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NELFE-210ENST00000491139 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa28.15■■■□□ 2.1
NELFE-210ENST00000491139 TEFQ10587 303 aa28.14■■■□□ 2.1
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NELFE-210ENST00000491139 CCDC24Q8N4L8 307 aa28.14■■■□□ 2.1
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NELFE-210ENST00000491139 NPHP1O15259 732 aa28.11■■■□□ 2.09
NELFE-210ENST00000491139 IL17REQ8NFR9 667 aa28.11■■■□□ 2.09
NELFE-210ENST00000491139 SETDB2Q96T68 719 aa28.11■■■□□ 2.09
NELFE-210ENST00000491139 LTBP3Q9NS15 1303 aa28.11■■■□□ 2.09
NELFE-210ENST00000491139 GNAT3A8MTJ3 354 aa28.1■■■□□ 2.09
NELFE-210ENST00000491139 CHADLQ6NUI6 762 aa28.1■■■□□ 2.09
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NELFE-210ENST00000491139 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
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NELFE-210ENST00000491139 ST5P78524 1137 aa28.07■■■□□ 2.08
NELFE-210ENST00000491139 STYK1Q6J9G0 422 aa28.07■■■□□ 2.08
NELFE-210ENST00000491139 KIF7Q2M1P5 1343 aa28.07■■■□□ 2.08
NELFE-210ENST00000491139 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
NELFE-210ENST00000491139 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
NELFE-210ENST00000491139 SOGA3Q5TF21 947 aa28.06■■■□□ 2.08
NELFE-210ENST00000491139 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
NELFE-210ENST00000491139 CAMTA2O94983 1202 aa28.05■■■□□ 2.08
NELFE-210ENST00000491139 SRGNP10124 158 aa28.05■■■□□ 2.08
NELFE-210ENST00000491139 MASTLQ96GX5 879 aa28.04■■■□□ 2.08
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