RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
GTPBP1-211ENST00000487538 CAMKK2Q96RR4 588 aa13.11□□□□□ -0.31
GTPBP1-211ENST00000487538 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
GTPBP1-211ENST00000487538 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa13.11□□□□□ -0.31
GTPBP1-211ENST00000487538 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa13.11□□□□□ -0.31
GTPBP1-211ENST00000487538 CYP27B1O15528 508 aa13.1□□□□□ -0.31
GTPBP1-211ENST00000487538 KCNQ3O43525 872 aa13.1□□□□□ -0.31
GTPBP1-211ENST00000487538 IL2RBP14784 551 aa13.1□□□□□ -0.31
GTPBP1-211ENST00000487538 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
GTPBP1-211ENST00000487538 DDB1Q16531 1140 aa13.1□□□□□ -0.31
GTPBP1-211ENST00000487538 G2E3Q7L622 706 aa13.1□□□□□ -0.31
GTPBP1-211ENST00000487538 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC52A2Q9HAB3 445 aa13.1□□□□□ -0.31
GTPBP1-211ENST00000487538 HEG1Q9ULI3 1381 aa13.09□□□□□ -0.31
GTPBP1-211ENST00000487538 FLIIQ13045 1269 aa13.09□□□□□ -0.31
GTPBP1-211ENST00000487538 SKAP1Q86WV1 359 aa13.09□□□□□ -0.31
GTPBP1-211ENST00000487538 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
GTPBP1-211ENST00000487538 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
GTPBP1-211ENST00000487538 NECTIN2Q92692 538 aa13.09□□□□□ -0.31
GTPBP1-211ENST00000487538 PAPPAQ13219 1627 aa13.09□□□□□ -0.31
GTPBP1-211ENST00000487538 DOT1LQ8TEK3 1739 aa13.08□□□□□ -0.32
GTPBP1-211ENST00000487538 CCT4P50991 539 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
GTPBP1-211ENST00000487538 CACNA1FO60840 1977 aa13.08□□□□□ -0.32
GTPBP1-211ENST00000487538 PXDNLA1KZ92 1463 aa13.08□□□□□ -0.32
GTPBP1-211ENST00000487538 CASZ1Q86V15 1759 aa13.07□□□□□ -0.32
GTPBP1-211ENST00000487538 BTAF1O14981 1849 aa13.07□□□□□ -0.32
GTPBP1-211ENST00000487538 APBA3O96018 575 aa13.07□□□□□ -0.32
GTPBP1-211ENST00000487538 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
GTPBP1-211ENST00000487538 PTF1AQ7RTS3 328 aa13.07□□□□□ -0.32
GTPBP1-211ENST00000487538 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
GTPBP1-211ENST00000487538 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
GTPBP1-211ENST00000487538 RGS3P49796 1198 aa13.06□□□□□ -0.32
GTPBP1-211ENST00000487538 CABP4P57796 275 aa13.06□□□□□ -0.32
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF790Q6PG37 636 aa13.06□□□□□ -0.32
GTPBP1-211ENST00000487538 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
GTPBP1-211ENST00000487538 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
GTPBP1-211ENST00000487538 F6X3S4 739 aa13.05□□□□□ -0.32
GTPBP1-211ENST00000487538 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
GTPBP1-211ENST00000487538 SMC5Q8IY18 1101 aa13.05□□□□□ -0.32
GTPBP1-211ENST00000487538 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa13.05□□□□□ -0.32
GTPBP1-211ENST00000487538 C1orf115Q9H7X2 142 aa13.05□□□□□ -0.32
GTPBP1-211ENST00000487538 CHPF2Q9P2E5 772 aa13.05□□□□□ -0.32
GTPBP1-211ENST00000487538 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa13.05□□□□□ -0.32
GTPBP1-211ENST00000487538 PDE4AP27815 886 aa13.04□□□□□ -0.32
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC4A10Q6U841 1118 aa13.04□□□□□ -0.32
GTPBP1-211ENST00000487538 TTC5Q8N0Z6 440 aa13.04□□□□□ -0.32
GTPBP1-211ENST00000487538 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
GTPBP1-211ENST00000487538 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa13.03□□□□□ -0.32
GTPBP1-211ENST00000487538 ERVV-2B6SEH9 535 aa13.03□□□□□ -0.32
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC39A6Q13433 755 aa13.03□□□□□ -0.32
GTPBP1-211ENST00000487538 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
GTPBP1-211ENST00000487538 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
GTPBP1-211ENST00000487538 ATP10DQ9P241 1426 aa13.03□□□□□ -0.32
GTPBP1-211ENST00000487538 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 GCC1Q96CN9 775 aa13.02□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 MEIS3Q99687 375 aa13.02□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 BACH2Q9BYV9 841 aa13.02□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 C5P01031 1676 aa13.02□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 EXOC5O00471 708 aa13.01□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 PLSCR1O15162 318 aa13.01□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 ANKRD44Q8N8A2 993 aa13.01□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 FMNL2Q96PY5 1086 aa13.01□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 HYPKQ9NX55 129 aa13.01□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 LY75O60449 1722 aa13□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa13□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 GNAI3P08754 354 aa13□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 NUCB1Q02818 461 aa13□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM161AQ3B820 660 aa13□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 SIRT2Q8IXJ6 389 aa13□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP13□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 LAMB4A4D0S4 1761 aa12.99□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 KCNQ2O43526 872 aa12.99□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 GNAI2P04899 355 aa12.99□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 CEP85Q6P2H3 762 aa12.99□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 DNAAF4Q8WXU2 420 aa12.99□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 ADCY9O60503 1353 aa12.98□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa12.98□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 DDX58O95786 925 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 ANXA1P04083 346 aa12.98□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 PROSER3Q2NL68 480 aa12.98□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 PROM2Q8N271 834 aa12.98□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa12.98□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 UBR2Q8IWV8 1755 aa12.98□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 KCPQ6ZWJ8 1503 aa12.98□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 QSER1Q2KHR3 1735 aa12.97□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 PI4KAP2A4QPH2 592 aa12.97□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 HMMRO75330 724 aa12.97□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 PDIA6Q15084 440 aa12.97□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 KSR2Q6VAB6 950 aa12.97□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 CHD1LQ86WJ1 897 aa12.97□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa12.97□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 C8orf34Q49A92 452 aa12.96□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 BEND3Q5T5X7 828 aa12.96□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 ACSBG1Q96GR2 724 aa12.96□□□□□ -0.33
GTPBP1-211ENST00000487538 DCTPP1Q9H773 170 aa12.96□□□□□ -0.33
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