RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484571.5

VWA3B-215, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 3

Gene VWA3B, Length 717 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-215ENST00000484571 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP27.34■■□□□ 1.97
VWA3B-215ENST00000484571 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
VWA3B-215ENST00000484571 NARFQ9UHQ1 456 aa27.34■■□□□ 1.97
VWA3B-215ENST00000484571 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa27.34■■□□□ 1.97
VWA3B-215ENST00000484571 A0A087WZG4 1122 aa27.33■■□□□ 1.97
VWA3B-215ENST00000484571 PLEKHF1Q96S99 279 aa27.33■■□□□ 1.97
VWA3B-215ENST00000484571 KIF13BQ9NQT8 1826 aa27.32■■□□□ 1.96
VWA3B-215ENST00000484571 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
VWA3B-215ENST00000484571 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
VWA3B-215ENST00000484571 FKBP8Q14318 412 aa27.31■■□□□ 1.96
VWA3B-215ENST00000484571 MCM10Q7L590 875 aa27.31■■□□□ 1.96
VWA3B-215ENST00000484571 EIF5P55010 431 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
VWA3B-215ENST00000484571 TM4SF1P30408 202 aa27.29■■□□□ 1.96
VWA3B-215ENST00000484571 USPL1Q5W0Q7 1092 aa27.29■■□□□ 1.96
VWA3B-215ENST00000484571 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa27.29■■□□□ 1.96
VWA3B-215ENST00000484571 PXDNLA1KZ92 1463 aa27.28■■□□□ 1.96
VWA3B-215ENST00000484571 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
VWA3B-215ENST00000484571 NFE2L2Q16236 605 aa27.28■■□□□ 1.96
VWA3B-215ENST00000484571 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
VWA3B-215ENST00000484571 CANXP27824 592 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
VWA3B-215ENST00000484571 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
VWA3B-215ENST00000484571 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
VWA3B-215ENST00000484571 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
VWA3B-215ENST00000484571 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
VWA3B-215ENST00000484571 DDR1Q08345 913 aa27.25■■□□□ 1.95
VWA3B-215ENST00000484571 KCNQ3O43525 872 aa27.23■■□□□ 1.95
VWA3B-215ENST00000484571 DCTN1Q14203 1278 aa27.23■■□□□ 1.95
VWA3B-215ENST00000484571 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
VWA3B-215ENST00000484571 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa27.21■■□□□ 1.95
VWA3B-215ENST00000484571 BCL2L12Q9HB09 334 aa27.21■■□□□ 1.95
VWA3B-215ENST00000484571 NFIXQ14938 502 aa27.2■■□□□ 1.94
VWA3B-215ENST00000484571 A0A0G2JLW4 131 aa27.18■■□□□ 1.94
VWA3B-215ENST00000484571 RGL2O15211 777 aa27.18■■□□□ 1.94
VWA3B-215ENST00000484571 A1BGP04217 495 aa27.18■■□□□ 1.94
VWA3B-215ENST00000484571 DPEP1P16444 411 aa27.18■■□□□ 1.94
VWA3B-215ENST00000484571 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
VWA3B-215ENST00000484571 USP16Q9Y5T5 823 aa27.18■■□□□ 1.94
VWA3B-215ENST00000484571 LMOD3Q0VAK6 560 aa27.17■■□□□ 1.94
VWA3B-215ENST00000484571 BABAM1Q9NWV8 329 aa27.16■■□□□ 1.94
VWA3B-215ENST00000484571 SCN7AQ01118 1682 aa27.16■■□□□ 1.94
VWA3B-215ENST00000484571 DLG5Q8TDM6 1919 aa27.16■■□□□ 1.94
VWA3B-215ENST00000484571 NRXN2Q9P2S2 1712 aa27.16■■□□□ 1.94
VWA3B-215ENST00000484571 PIM2Q9P1W9 311 aa27.15■■□□□ 1.94
VWA3B-215ENST00000484571 SERPINB2P05120 415 aa27.14■■□□□ 1.94
VWA3B-215ENST00000484571 KCNA3P22001 575 aa27.14■■□□□ 1.94
VWA3B-215ENST00000484571 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP27.14■■□□□ 1.94
VWA3B-215ENST00000484571 CLEC4GQ6UXB4 293 aa27.13■■□□□ 1.93
VWA3B-215ENST00000484571 BCS1LQ9Y276 419 aa27.13■■□□□ 1.93
VWA3B-215ENST00000484571 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
VWA3B-215ENST00000484571 KDM3BQ7LBC6 1761 aa27.12■■□□□ 1.93
VWA3B-215ENST00000484571 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
VWA3B-215ENST00000484571 CAMTA2O94983 1202 aa27.12■■□□□ 1.93
VWA3B-215ENST00000484571 RIPK4P57078 832 aa27.12■■□□□ 1.93
VWA3B-215ENST00000484571 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa27.12■■□□□ 1.93
VWA3B-215ENST00000484571 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa27.12■■□□□ 1.93
VWA3B-215ENST00000484571 ADCY9O60503 1353 aa27.11■■□□□ 1.93
VWA3B-215ENST00000484571 CARMIL3Q8ND23 1372 aa27.11■■□□□ 1.93
VWA3B-215ENST00000484571 TMPOP42166 694 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
VWA3B-215ENST00000484571 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
VWA3B-215ENST00000484571 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
VWA3B-215ENST00000484571 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa27.1■■□□□ 1.93
VWA3B-215ENST00000484571 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
VWA3B-215ENST00000484571 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
VWA3B-215ENST00000484571 RUNDC1Q96C34 613 aa27.1■■□□□ 1.93
VWA3B-215ENST00000484571 MIS18AQ9NYP9 233 aa27.1■■□□□ 1.93
VWA3B-215ENST00000484571 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
VWA3B-215ENST00000484571 TBC1D9BQ66K14 1250 aa27.09■■□□□ 1.93
VWA3B-215ENST00000484571 WWC3Q9ULE0 1092 aa27.09■■□□□ 1.93
VWA3B-215ENST00000484571 ZNF652Q9Y2D9 606 aa27.09■■□□□ 1.93
VWA3B-215ENST00000484571 SETDB2Q96T68 719 aa27.08■■□□□ 1.93
VWA3B-215ENST00000484571 LAMB4A4D0S4 1761 aa27.07■■□□□ 1.92
VWA3B-215ENST00000484571 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
VWA3B-215ENST00000484571 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
VWA3B-215ENST00000484571 NBPF26B4DH59 902 aa27.06■■□□□ 1.92
VWA3B-215ENST00000484571 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
VWA3B-215ENST00000484571 NBPF15Q8N660 670 aa27.06■■□□□ 1.92
VWA3B-215ENST00000484571 ERBB4Q15303 1308 aa27.06■■□□□ 1.92
VWA3B-215ENST00000484571 BCORQ6W2J9 1755 aa27.06■■□□□ 1.92
VWA3B-215ENST00000484571 ATP10DQ9P241 1426 aa27.06■■□□□ 1.92
VWA3B-215ENST00000484571 BICDL1Q6ZP65 573 aa27.05■■□□□ 1.92
VWA3B-215ENST00000484571 BRIP1Q9BX63 1249 aa27.05■■□□□ 1.92
VWA3B-215ENST00000484571 TSPYL4Q9UJ04 414 aa27.05■■□□□ 1.92
VWA3B-215ENST00000484571 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa27.04■■□□□ 1.92
VWA3B-215ENST00000484571 CHRNA5P30532 468 aa27.04■■□□□ 1.92
VWA3B-215ENST00000484571 PDE6BP35913 854 aa27.03■■□□□ 1.92
VWA3B-215ENST00000484571 ADAMTS8Q9UP79 889 aa27.03■■□□□ 1.92
VWA3B-215ENST00000484571 H0YIN7 160 aa27.02■■□□□ 1.92
VWA3B-215ENST00000484571 PRR5LQ6MZQ0 368 aa27.02■■□□□ 1.92
VWA3B-215ENST00000484571 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa27.02■■□□□ 1.92
VWA3B-215ENST00000484571 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
VWA3B-215ENST00000484571 CNBD1Q8NA66 436 aa27.01■■□□□ 1.91
VWA3B-215ENST00000484571 ST5P78524 1137 aa27■■□□□ 1.91
VWA3B-215ENST00000484571 C2CD5Q86YS7 1000 aa27■■□□□ 1.91
VWA3B-215ENST00000484571 CCDC146Q8IYE0 955 aa27■■□□□ 1.91
VWA3B-215ENST00000484571 DLEC1Q9Y238 1755 aa26.99■■□□□ 1.91
VWA3B-215ENST00000484571 ERVV-1B6SEH8 477 aa26.99■■□□□ 1.91
VWA3B-215ENST00000484571 TTLL6Q8N841 843 aa26.99■■□□□ 1.91
VWA3B-215ENST00000484571 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
VWA3B-215ENST00000484571 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.97■■□□□ 1.91
VWA3B-215ENST00000484571 CHL1O00533 1208 aa26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms