RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481031.5

HECW1-208, Transcript of HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1, human

TSL 5

Gene HECW1, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HECW1-208	ENST00000481031	ACE	P12821	1306 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	PIK3C2A	O00443	1686 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	MYOM1	P52179	1685 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	NBPF26	B4DH59	902 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	KDM4A	O75164	1064 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	FDX1	P10109	184 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	USP46	P62068	366 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	TMF1	P82094	1093 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	SEMA3F	Q13275	785 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	PNMA1	Q8ND90	353 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	ALG2	Q9H553	416 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	USP35	Q9P2H5	1018 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	NRAP	Q86VF7	1730 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	USP47	Q96K76	1375 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	LRP6	O75581	1613 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	SBF2	Q86WG5	1849 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	NLRP13	Q86W25	1043 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	TESK2	Q96S53	571 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	EYA1	Q99502	592 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	CABP1	Q9NZU7	370 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	COL18A1	P39060	1754 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	USP6	P35125	1406 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	ABTB2	Q8N961	1025 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	NGLY1	Q96IV0	654 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	PNMA3	Q9UL41	463 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HECW1-208	ENST00000481031	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	HOXA2	O43364	376 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	MTMR2	Q13614	643 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	PRR7	Q8TB68	274 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	C8orf37	Q96NL8	207 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	UCN2	Q96RP3	112 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	SLIT2	O94813	1529 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	ABCC6	O95255	1503 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	SSH2	Q76I76	1423 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	AFF2	P51816	1311 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	ADAMTS2	O95450	1211 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	RXRB	P28702	533 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	PACS2	Q86VP3	889 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	TMC1	Q8TDI8	760 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	SLC39A7	Q92504	469 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	TATDN2	Q93075	761 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	USP21	Q9UK80	565 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	SLIT3	O75094	1523 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	USP19	O94966	1318 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	CPD	O75976	1380 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	USP31	Q70CQ4	1352 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	HAX1	O00165	279 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	ATP9B	O43861	1147 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	GPR37L1	O60883	481 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	GC	P02774	474 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	ERCC3	P19447	782 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	GCGR	P47871	477 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	POTEA	Q6S8J7	498 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	TSKS	Q9UJT2	592 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	EP400	Q96L91	3159 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	ATRN	O75882	1429 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HECW1-208	ENST00000481031		A0A1W2PP64	1363 aa		4.93	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.4 ms