RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473298.6

SOGA3-205, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2

Gene SOGA3, Length 3,350 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-205ENST00000473298 CHGBP05060 677 aa12.24□□□□□ -0.45
SOGA3-205ENST00000473298 STK3Q13188 491 aa12.24□□□□□ -0.45
SOGA3-205ENST00000473298 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
SOGA3-205ENST00000473298 AACSQ86V21 672 aa12.24□□□□□ -0.45
SOGA3-205ENST00000473298 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
SOGA3-205ENST00000473298 RTL1A6NKG5 1358 aa12.24□□□□□ -0.45
SOGA3-205ENST00000473298 DNAAF4Q8WXU2 420 aa12.24□□□□□ -0.45
SOGA3-205ENST00000473298 GNAI3P08754 354 aa12.23□□□□□ -0.45
SOGA3-205ENST00000473298 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
SOGA3-205ENST00000473298 STK11IPQ8N1F8 1099 aa12.23□□□□□ -0.45
SOGA3-205ENST00000473298 STRCP1A6NGW2 1772 aa12.23□□□□□ -0.45
SOGA3-205ENST00000473298 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa12.23□□□□□ -0.45
SOGA3-205ENST00000473298 ARHGAP45Q92619 1136 aa12.23□□□□□ -0.45
SOGA3-205ENST00000473298 C1orf167Q5SNV9 1468 aa12.23□□□□□ -0.45
SOGA3-205ENST00000473298 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
SOGA3-205ENST00000473298 NPHP3Q7Z494 1330 aa12.23□□□□□ -0.45
SOGA3-205ENST00000473298 COPS6Q7L5N1 327 aa12.22□□□□□ -0.45
SOGA3-205ENST00000473298 SBNO1A3KN83 1393 aa12.22□□□□□ -0.45
SOGA3-205ENST00000473298 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
SOGA3-205ENST00000473298 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
SOGA3-205ENST00000473298 SLFNL1Q499Z3 407 aa12.22□□□□□ -0.45
SOGA3-205ENST00000473298 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
SOGA3-205ENST00000473298 IL25Q9H293 177 aa12.22□□□□□ -0.45
SOGA3-205ENST00000473298 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa12.22□□□□□ -0.45
SOGA3-205ENST00000473298 XAGE3Q8WTP9 111 aa12.22□□□□□ -0.45
SOGA3-205ENST00000473298 IP6K1Q92551 441 aa12.22□□□□□ -0.45
SOGA3-205ENST00000473298 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa12.22□□□□□ -0.45
SOGA3-205ENST00000473298 USP16Q9Y5T5 823 aa12.22□□□□□ -0.45
SOGA3-205ENST00000473298 ERC2O15083 957 aa12.21□□□□□ -0.45
SOGA3-205ENST00000473298 TOM1O60784 492 aa12.21□□□□□ -0.45
SOGA3-205ENST00000473298 CHMP4CQ96CF2 233 aa12.21□□□□□ -0.45
SOGA3-205ENST00000473298 TTC21AQ8NDW8 1320 aa12.21□□□□□ -0.45
SOGA3-205ENST00000473298 ST18O60284 1047 aa12.21□□□□□ -0.45
SOGA3-205ENST00000473298 FGD1P98174 961 aa12.21□□□□□ -0.45
SOGA3-205ENST00000473298 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa12.21□□□□□ -0.45
SOGA3-205ENST00000473298 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
SOGA3-205ENST00000473298 MAP3K5Q99683 1374 aa12.21□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa12.21□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 GOLGA6L22H0YM25 854 aa12.2□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 CABP4P57796 275 aa12.2□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 AAMPQ13685 434 aa12.2□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 ANTXR1Q9H6X2 564 aa12.2□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 IGSF1Q8N6C5 1336 aa12.2□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 FERMT3Q86UX7 667 aa12.2□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 GBP4Q96PP9 640 aa12.2□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 REC8O95072 547 aa12.19□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 ADAMTS2O95450 1211 aa12.19□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 RHPN1Q8TCX5 695 aa12.19□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 LRRC2Q9BYS8 371 aa12.19□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 ANKARQ7Z5J8 1434 aa12.19□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 TATP17735 454 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 GPTP24298 496 aa12.19□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP12.19□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 SNRKQ9NRH2 765 aa12.19□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa12.19□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 KIF2CQ99661 725 aa12.19□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 MST1RQ04912 1400 aa12.19□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 PTPRCP08575 1304 aa12.19□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa12.18□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 RNMTO43148 476 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 USP26Q9BXU7 913 aa12.18□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 AATKQ6ZMQ8 1374 aa12.18□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 A1BGP04217 495 aa12.18□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 NECAB1Q8N987 351 aa12.18□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 FBXW7Q969H0 707 aa12.18□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 FSD1Q9BTV5 496 aa12.18□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 ITSN1Q15811 1721 aa12.17□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 MCCP23508 829 aa12.17□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 ATP8B2P98198 1209 aa12.17□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 NEXNQ0ZGT2 675 aa12.17□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 USP32Q8NFA0 1604 aa12.17□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 KCNH5Q8NCM2 988 aa12.16□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP12.16□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 FMN2Q9NZ56 1722 aa12.16□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 FIBPO43427 364 aa12.16□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 KCNQ4P56696 695 aa12.16□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 SUCLG2Q96I99 432 aa12.16□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 ADGRB2O60241 1585 aa12.16□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 NWD1Q149M9 1564 aa12.16□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 A0A087WZG4 1122 aa12.15□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa12.15□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 FAM227BQ96M60 508 aa12.15□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 CASTP20810 708 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 FAM173BQ6P4H8 233 aa12.15□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
SOGA3-205ENST00000473298 GORABQ5T7V8 394 aa12.15□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms