RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-211ENST00000467464 NUDCQ9Y266 331 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRF-211ENST00000467464 PARP3Q9Y6F1 533 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRF-211ENST00000467464 A0A0G2JLW4 131 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRF-211ENST00000467464 KCNQ3O43525 872 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRF-211ENST00000467464 KCNA3P22001 575 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRF-211ENST00000467464 USPL1Q5W0Q7 1092 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRF-211ENST00000467464 ATP10DQ9P241 1426 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRF-211ENST00000467464 DPEP1P16444 411 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRF-211ENST00000467464 EIF5P55010 431 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PTPRF-211ENST00000467464 TTC5Q8N0Z6 440 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRF-211ENST00000467464 NARFQ9UHQ1 456 aa16.02■□□□□ 0.16
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PTPRF-211ENST00000467464 FMNL2Q96PY5 1086 aa15.99■□□□□ 0.15
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PTPRF-211ENST00000467464 NRXN2Q9P2S2 1712 aa15.99■□□□□ 0.15
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PTPRF-211ENST00000467464 A0A087WZG4 1122 aa15.93■□□□□ 0.14
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PTPRF-211ENST00000467464 PIM2Q9P1W9 311 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRF-211ENST00000467464 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PTPRF-211ENST00000467464 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa15.92■□□□□ 0.14
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PTPRF-211ENST00000467464 BCORQ6W2J9 1755 aa15.89■□□□□ 0.13
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PTPRF-211ENST00000467464 KIF3CO14782 793 aa15.88■□□□□ 0.13
PTPRF-211ENST00000467464 PRR5LQ6MZQ0 368 aa15.88■□□□□ 0.13
PTPRF-211ENST00000467464 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
PTPRF-211ENST00000467464 KDM3BQ7LBC6 1761 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRF-211ENST00000467464 DLEC1Q9Y238 1755 aa15.87■□□□□ 0.13
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PTPRF-211ENST00000467464 C9orf131Q5VYM1 1079 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRF-211ENST00000467464 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PTPRF-211ENST00000467464 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa15.85■□□□□ 0.13
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PTPRF-211ENST00000467464 C2CD5Q86YS7 1000 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-211ENST00000467464 CCDC24Q8N4L8 307 aa15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-211ENST00000467464 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
PTPRF-211ENST00000467464 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRF-211ENST00000467464 CLEC4GQ6UXB4 293 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRF-211ENST00000467464 BRIP1Q9BX63 1249 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRF-211ENST00000467464 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
PTPRF-211ENST00000467464 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRF-211ENST00000467464 LAMB4A4D0S4 1761 aa15.84■□□□□ 0.13
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PTPRF-211ENST00000467464 NEFMP07197 916 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRF-211ENST00000467464 RASSF7Q02833 373 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRF-211ENST00000467464 TTLL6Q8N841 843 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRF-211ENST00000467464 SETDB2Q96T68 719 aa15.83■□□□□ 0.12
PTPRF-211ENST00000467464 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
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PTPRF-211ENST00000467464 NFKBIEO00221 500 aa15.82■□□□□ 0.12
PTPRF-211ENST00000467464 CNBD1Q8NA66 436 aa15.82■□□□□ 0.12
PTPRF-211ENST00000467464 RNF181Q9P0P0 153 aa15.82■□□□□ 0.12
PTPRF-211ENST00000467464 TMPOP42166 694 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
PTPRF-211ENST00000467464 HLFQ16534 295 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRF-211ENST00000467464 CEP350Q5VT06 3117 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRF-211ENST00000467464 NMRK2Q9NPI5 230 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRF-211ENST00000467464 PDE6BP35913 854 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRF-211ENST00000467464 RIPK4P57078 832 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRF-211ENST00000467464 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
PTPRF-211ENST00000467464 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa15.8■□□□□ 0.12
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