RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466222.6

CAPN3-209, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN3, Length 1,934 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-209ENST00000466222 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
CAPN3-209ENST00000466222 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
CAPN3-209ENST00000466222 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
CAPN3-209ENST00000466222 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.62■■□□□ 1.37
CAPN3-209ENST00000466222 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CAPN3-209ENST00000466222 F6X3S4 739 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPN3-209ENST00000466222 ARHGAP45Q92619 1136 aa23.6■■□□□ 1.37
CAPN3-209ENST00000466222 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
CAPN3-209ENST00000466222 FLIIQ13045 1269 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPN3-209ENST00000466222 PDIA6Q15084 440 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPN3-209ENST00000466222 SLC4A9Q96Q91 983 aa23.59■■□□□ 1.37
CAPN3-209ENST00000466222 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
CAPN3-209ENST00000466222 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPN3-209ENST00000466222 KCPQ6ZWJ8 1503 aa23.58■■□□□ 1.37
CAPN3-209ENST00000466222 MYL6BP14649 208 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPN3-209ENST00000466222 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPN3-209ENST00000466222 RGS12O14924 1447 aa23.57■■□□□ 1.36
CAPN3-209ENST00000466222 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
CAPN3-209ENST00000466222 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
CAPN3-209ENST00000466222 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
CAPN3-209ENST00000466222 PDE4AP27815 886 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPN3-209ENST00000466222 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CAPN3-209ENST00000466222 BACH2Q9BYV9 841 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPN3-209ENST00000466222 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CAPN3-209ENST00000466222 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CAPN3-209ENST00000466222 ABCC4O15439 1325 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPN3-209ENST00000466222 DNAJC10Q8IXB1 793 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPN3-209ENST00000466222 PTPRCP08575 1304 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPN3-209ENST00000466222 A1BGP04217 495 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPN3-209ENST00000466222 POTEAQ6S8J7 498 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPN3-209ENST00000466222 SLC4A10Q6U841 1118 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPN3-209ENST00000466222 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
CAPN3-209ENST00000466222 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.36
CAPN3-209ENST00000466222 NBPF26B4DH59 902 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPN3-209ENST00000466222 NBPF14Q5TI25 921 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPN3-209ENST00000466222 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
CAPN3-209ENST00000466222 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CAPN3-209ENST00000466222 NBPF15Q8N660 670 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPN3-209ENST00000466222 LRP10Q7Z4F1 713 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPN3-209ENST00000466222 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPN3-209ENST00000466222 KRT27Q7Z3Y8 459 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPN3-209ENST00000466222 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPN3-209ENST00000466222 RXRBP28702 533 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPN3-209ENST00000466222 KCNQ4P56696 695 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPN3-209ENST00000466222 PI4KAP2A4QPH2 592 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPN3-209ENST00000466222 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPN3-209ENST00000466222 CHMP4AQ9BY43 222 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPN3-209ENST00000466222 PAPPAQ13219 1627 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPN3-209ENST00000466222 HYPKQ9NX55 129 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPN3-209ENST00000466222 COPS6Q7L5N1 327 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPN3-209ENST00000466222 VSIG10Q8N0Z9 540 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPN3-209ENST00000466222 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPN3-209ENST00000466222 C5P01031 1676 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPN3-209ENST00000466222 PALLDQ8WX93 1383 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPN3-209ENST00000466222 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPN3-209ENST00000466222 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
CAPN3-209ENST00000466222 SIK1P57059 783 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPN3-209ENST00000466222 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CAPN3-209ENST00000466222 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.47■■□□□ 1.35
CAPN3-209ENST00000466222 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPN3-209ENST00000466222 ITGB4P16144 1822 aa23.46■■□□□ 1.35
CAPN3-209ENST00000466222 ATP6V1AP38606 617 aa23.45■■□□□ 1.35
CAPN3-209ENST00000466222 ITPK1Q13572 414 aa23.45■■□□□ 1.35
CAPN3-209ENST00000466222 ADCY9O60503 1353 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPN3-209ENST00000466222 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CAPN3-209ENST00000466222 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.45■■□□□ 1.34
CAPN3-209ENST00000466222 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPN3-209ENST00000466222 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CAPN3-209ENST00000466222 UBR2Q8IWV8 1755 aa23.44■■□□□ 1.34
CAPN3-209ENST00000466222 STARD3NLO95772 234 aa23.43■■□□□ 1.34
CAPN3-209ENST00000466222 TTLL7Q6ZT98 887 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPN3-209ENST00000466222 DNAAF4Q8WXU2 420 aa23.42■■□□□ 1.34
CAPN3-209ENST00000466222 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
CAPN3-209ENST00000466222 TRIM37O94972 964 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPN3-209ENST00000466222 KSR2Q6VAB6 950 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPN3-209ENST00000466222 MEIS3Q99687 375 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPN3-209ENST00000466222 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CAPN3-209ENST00000466222 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa23.41■■□□□ 1.34
CAPN3-209ENST00000466222 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPN3-209ENST00000466222 IGHDP01880 384 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPN3-209ENST00000466222 FAM196AQ6ZSG2 479 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPN3-209ENST00000466222 DDRGK1Q96HY6 314 aa23.4■■□□□ 1.34
CAPN3-209ENST00000466222 CCT4P50991 539 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
CAPN3-209ENST00000466222 BEND3Q5T5X7 828 aa23.39■■□□□ 1.34
CAPN3-209ENST00000466222 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
CAPN3-209ENST00000466222 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPN3-209ENST00000466222 RIC3Q7Z5B4 369 aa23.39■■□□□ 1.33
CAPN3-209ENST00000466222 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
CAPN3-209ENST00000466222 ERBB4Q15303 1308 aa23.38■■□□□ 1.33
CAPN3-209ENST00000466222 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CAPN3-209ENST00000466222 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CAPN3-209ENST00000466222 DDX58O95786 925 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CAPN3-209ENST00000466222 CRKLP46109 303 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CAPN3-209ENST00000466222 LINC00116Q8NCU8 138 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPN3-209ENST00000466222 ARXQ96QS3 562 aa23.36■■□□□ 1.33
CAPN3-209ENST00000466222 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
CAPN3-209ENST00000466222 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa23.35■■□□□ 1.33
CAPN3-209ENST00000466222 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.35■■□□□ 1.33
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