RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 C8orf34Q49A92 452 aa9.34□□□□□ -0.91
USP54-210ENST00000466048 PXDNLA1KZ92 1463 aa9.34□□□□□ -0.91
USP54-210ENST00000466048 ERBB3P21860 1342 aa9.34□□□□□ -0.91
USP54-210ENST00000466048 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
USP54-210ENST00000466048 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
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USP54-210ENST00000466048 ANKRD45Q5TZF3 282 aa9.34□□□□□ -0.91
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USP54-210ENST00000466048 LGR6Q9HBX8 967 aa9.28□□□□□ -0.92
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USP54-210ENST00000466048 ATP10DQ9P241 1426 aa9.26□□□□□ -0.93
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USP54-210ENST00000466048 F6X3S4 739 aa9.25□□□□□ -0.93
USP54-210ENST00000466048 POLD1P28340 1107 aa9.25□□□□□ -0.93
USP54-210ENST00000466048 KSR2Q6VAB6 950 aa9.25□□□□□ -0.93
USP54-210ENST00000466048 FLAD1Q8NFF5 587 aa9.25□□□□□ -0.93
USP54-210ENST00000466048 C22orf23Q9BZE7 217 aa9.25□□□□□ -0.93
USP54-210ENST00000466048 LRRCC1Q9C099 1032 aa9.25□□□□□ -0.93
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