RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 RHPN1Q8TCX5 695 aa24.95■■□□□ 1.58
IMP4-208ENST00000460766 CHMP4AQ9BY43 222 aa24.94■■□□□ 1.58
IMP4-208ENST00000460766 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
IMP4-208ENST00000460766 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
IMP4-208ENST00000460766 ZDHHC9Q9Y397 364 aa24.94■■□□□ 1.58
IMP4-208ENST00000460766 MCM2P49736 904 aa24.93■■□□□ 1.58
IMP4-208ENST00000460766 ANAPC15P60006 121 aa24.93■■□□□ 1.58
IMP4-208ENST00000460766 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
IMP4-208ENST00000460766 LMBRD1Q9NUN5 540 aa24.93■■□□□ 1.58
IMP4-208ENST00000460766 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
IMP4-208ENST00000460766 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.93■■□□□ 1.58
IMP4-208ENST00000460766 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.92■■□□□ 1.58
IMP4-208ENST00000460766 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
IMP4-208ENST00000460766 C1orf141Q5JVX7 400 aa24.91■■□□□ 1.58
IMP4-208ENST00000460766 KIF1BPQ96EK5 621 aa24.91■■□□□ 1.58
IMP4-208ENST00000460766 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
IMP4-208ENST00000460766 GCP02774 474 aa24.91■■□□□ 1.58
IMP4-208ENST00000460766 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
IMP4-208ENST00000460766 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
IMP4-208ENST00000460766 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
IMP4-208ENST00000460766 ORAI2Q96SN7 254 aa24.9■■□□□ 1.58
IMP4-208ENST00000460766 IL25Q9H293 177 aa24.9■■□□□ 1.58
IMP4-208ENST00000460766 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
IMP4-208ENST00000460766 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa24.9■■□□□ 1.58
IMP4-208ENST00000460766 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
IMP4-208ENST00000460766 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.9■■□□□ 1.58
IMP4-208ENST00000460766 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
IMP4-208ENST00000460766 PI4K2BQ8TCG2 481 aa24.89■■□□□ 1.57
IMP4-208ENST00000460766 RNMTO43148 476 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
IMP4-208ENST00000460766 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
IMP4-208ENST00000460766 ADCY9O60503 1353 aa24.88■■□□□ 1.57
IMP4-208ENST00000460766 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
IMP4-208ENST00000460766 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.87■■□□□ 1.57
IMP4-208ENST00000460766 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
IMP4-208ENST00000460766 CHAMP1Q96JM3 812 aa24.87■■□□□ 1.57
IMP4-208ENST00000460766 ANKRD24Q8TF21 1146 aa24.87■■□□□ 1.57
IMP4-208ENST00000460766 NASPP49321 788 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
IMP4-208ENST00000460766 CUL4AQ13619 759 aa24.86■■□□□ 1.57
IMP4-208ENST00000460766 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa24.86■■□□□ 1.57
IMP4-208ENST00000460766 PXDNQ92626 1479 aa24.85■■□□□ 1.57
IMP4-208ENST00000460766 KDM3BQ7LBC6 1761 aa24.85■■□□□ 1.57
IMP4-208ENST00000460766 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa24.85■■□□□ 1.57
IMP4-208ENST00000460766 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa24.85■■□□□ 1.57
IMP4-208ENST00000460766 CNTROBQ8N137 903 aa24.85■■□□□ 1.57
IMP4-208ENST00000460766 RGPD2P0DJD1 1756 aa24.84■■□□□ 1.57
IMP4-208ENST00000460766 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
IMP4-208ENST00000460766 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
IMP4-208ENST00000460766 HSPA4P34932 840 aa24.83■■□□□ 1.57
IMP4-208ENST00000460766 PROSER3Q2NL68 480 aa24.83■■□□□ 1.57
IMP4-208ENST00000460766 ZNF445P59923 1031 aa24.83■■□□□ 1.57
IMP4-208ENST00000460766 GPT2Q8TD30 523 aa24.83■■□□□ 1.57
IMP4-208ENST00000460766 LMO7Q8WWI1 1683 aa24.82■■□□□ 1.56
IMP4-208ENST00000460766 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
IMP4-208ENST00000460766 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.82■■□□□ 1.56
IMP4-208ENST00000460766 SGSM2O43147 1006 aa24.82■■□□□ 1.56
IMP4-208ENST00000460766 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
IMP4-208ENST00000460766 IL17RAQ96F46 866 aa24.82■■□□□ 1.56
IMP4-208ENST00000460766 CLCN1P35523 988 aa24.81■■□□□ 1.56
IMP4-208ENST00000460766 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
IMP4-208ENST00000460766 NCAPD2Q15021 1401 aa24.81■■□□□ 1.56
IMP4-208ENST00000460766 BRD1O95696 1058 aa24.81■■□□□ 1.56
IMP4-208ENST00000460766 AXIN2Q9Y2T1 843 aa24.81■■□□□ 1.56
IMP4-208ENST00000460766 ESPNB1AK53 854 aa24.8■■□□□ 1.56
IMP4-208ENST00000460766 KSR2Q6VAB6 950 aa24.8■■□□□ 1.56
IMP4-208ENST00000460766 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
IMP4-208ENST00000460766 RAD50Q92878 1312 aa24.8■■□□□ 1.56
IMP4-208ENST00000460766 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
IMP4-208ENST00000460766 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
IMP4-208ENST00000460766 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
IMP4-208ENST00000460766 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
IMP4-208ENST00000460766 ALDH1L1O75891 902 aa24.79■■□□□ 1.56
IMP4-208ENST00000460766 MTX1Q13505 466 aa24.79■■□□□ 1.56
IMP4-208ENST00000460766 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
IMP4-208ENST00000460766 CCDC173Q0VFZ6 552 aa24.78■■□□□ 1.56
IMP4-208ENST00000460766 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa24.78■■□□□ 1.56
IMP4-208ENST00000460766 ERBB4Q15303 1308 aa24.78■■□□□ 1.56
IMP4-208ENST00000460766 TTC41PQ6P2S7 1318 aa24.78■■□□□ 1.56
IMP4-208ENST00000460766 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
IMP4-208ENST00000460766 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
IMP4-208ENST00000460766 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
IMP4-208ENST00000460766 SPG7Q9UQ90 795 aa24.76■■□□□ 1.55
IMP4-208ENST00000460766 SNX14Q9Y5W7 946 aa24.76■■□□□ 1.55
IMP4-208ENST00000460766 SLIT3O75094 1523 aa24.76■■□□□ 1.55
IMP4-208ENST00000460766 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.76■■□□□ 1.55
IMP4-208ENST00000460766 HYPKQ9NX55 129 aa24.76■■□□□ 1.55
IMP4-208ENST00000460766 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa24.76■■□□□ 1.55
IMP4-208ENST00000460766 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
IMP4-208ENST00000460766 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
IMP4-208ENST00000460766 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa24.75■■□□□ 1.55
IMP4-208ENST00000460766 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
IMP4-208ENST00000460766 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
IMP4-208ENST00000460766 HEG1Q9ULI3 1381 aa24.75■■□□□ 1.55
IMP4-208ENST00000460766 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
IMP4-208ENST00000460766 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
IMP4-208ENST00000460766 HDAC5Q9UQL6 1122 aa24.74■■□□□ 1.55
IMP4-208ENST00000460766 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
IMP4-208ENST00000460766 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
IMP4-208ENST00000460766 ECHDC1Q9NTX5 307 aa24.74■■□□□ 1.55
IMP4-208ENST00000460766 TMEM63CQ9P1W3 806 aa24.74■■□□□ 1.55
IMP4-208ENST00000460766 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
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