RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460130.5

TCL6-204, Transcript of T cell leukemia/lymphoma 6, human

TSL 3 BASIC

Gene TCL6, Length 911 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCL6-204	ENST00000460130	TRIM37	O94972	964 aa		15.46	■□□□□ 0.07
TCL6-204	ENST00000460130	AAMP	Q13685	434 aa		15.46	■□□□□ 0.07
TCL6-204	ENST00000460130	ZNF790	Q6PG37	636 aa		15.46	■□□□□ 0.07
TCL6-204	ENST00000460130	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		15.46	■□□□□ 0.07
TCL6-204	ENST00000460130	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		15.46	■□□□□ 0.07
TCL6-204	ENST00000460130	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	15.45	■□□□□ 0.06
TCL6-204	ENST00000460130	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	15.45	■□□□□ 0.06
TCL6-204	ENST00000460130	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	15.44	■□□□□ 0.06
TCL6-204	ENST00000460130	IGHD	P01880	384 aa		15.44	■□□□□ 0.06
TCL6-204	ENST00000460130	SLC4A2	P04920	1241 aa		15.44	■□□□□ 0.06
TCL6-204	ENST00000460130	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		15.44	■□□□□ 0.06
TCL6-204	ENST00000460130	PTPRC	P08575	1304 aa		15.43	■□□□□ 0.06
TCL6-204	ENST00000460130	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		15.43	■□□□□ 0.06
TCL6-204	ENST00000460130	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	15.43	■□□□□ 0.06
TCL6-204	ENST00000460130	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		15.43	■□□□□ 0.06
TCL6-204	ENST00000460130	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	15.43	■□□□□ 0.06
TCL6-204	ENST00000460130	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	15.43	■□□□□ 0.06
TCL6-204	ENST00000460130	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	15.43	■□□□□ 0.06
TCL6-204	ENST00000460130	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		15.43	■□□□□ 0.06
TCL6-204	ENST00000460130	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		15.43	■□□□□ 0.06
TCL6-204	ENST00000460130	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		15.43	■□□□□ 0.06
TCL6-204	ENST00000460130	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
TCL6-204	ENST00000460130	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	15.42	■□□□□ 0.06
TCL6-204	ENST00000460130	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	15.42	■□□□□ 0.06
TCL6-204	ENST00000460130	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		15.42	■□□□□ 0.06
TCL6-204	ENST00000460130	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		15.41	■□□□□ 0.06
TCL6-204	ENST00000460130	NECTIN2	Q92692	538 aa		15.41	■□□□□ 0.06
TCL6-204	ENST00000460130	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	15.4	■□□□□ 0.06
TCL6-204	ENST00000460130	PALLD	Q8WX93	1383 aa		15.4	■□□□□ 0.06
TCL6-204	ENST00000460130	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		15.4	■□□□□ 0.06
TCL6-204	ENST00000460130	LY75	O60449	1722 aa		15.4	■□□□□ 0.06
TCL6-204	ENST00000460130	FLII	Q13045	1269 aa		15.39	■□□□□ 0.05
TCL6-204	ENST00000460130	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	15.39	■□□□□ 0.05
TCL6-204	ENST00000460130	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	15.39	■□□□□ 0.05
TCL6-204	ENST00000460130	APBA3	O96018	575 aa		15.38	■□□□□ 0.05
TCL6-204	ENST00000460130	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	15.38	■□□□□ 0.05
TCL6-204	ENST00000460130	PDIA6	Q15084	440 aa		15.38	■□□□□ 0.05
TCL6-204	ENST00000460130	STK31	Q9BXU1	1019 aa		15.38	■□□□□ 0.05
TCL6-204	ENST00000460130	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		15.37	■□□□□ 0.05
TCL6-204	ENST00000460130		F6X3S4	739 aa		15.37	■□□□□ 0.05
TCL6-204	ENST00000460130	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	15.37	■□□□□ 0.05
TCL6-204	ENST00000460130	SIK1	P57059	783 aa		15.37	■□□□□ 0.05
TCL6-204	ENST00000460130	PROSER3	Q2NL68	480 aa		15.37	■□□□□ 0.05
TCL6-204	ENST00000460130	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		15.37	■□□□□ 0.05
TCL6-204	ENST00000460130	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		15.37	■□□□□ 0.05
TCL6-204	ENST00000460130	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		15.37	■□□□□ 0.05
TCL6-204	ENST00000460130	TJP1	Q07157	1748 aa		15.37	■□□□□ 0.05
TCL6-204	ENST00000460130	ANXA1	P04083	346 aa		15.36	■□□□□ 0.05
TCL6-204	ENST00000460130	ATP6V1A	P38606	617 aa		15.36	■□□□□ 0.05
TCL6-204	ENST00000460130	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		15.36	■□□□□ 0.05
TCL6-204	ENST00000460130	SKAP1	Q86WV1	359 aa		15.36	■□□□□ 0.05
TCL6-204	ENST00000460130	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		15.36	■□□□□ 0.05
TCL6-204	ENST00000460130	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		15.36	■□□□□ 0.05
TCL6-204	ENST00000460130	USP16	Q9Y5T5	823 aa		15.36	■□□□□ 0.05
TCL6-204	ENST00000460130	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	15.35	■□□□□ 0.05
TCL6-204	ENST00000460130	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	15.35	■□□□□ 0.05
TCL6-204	ENST00000460130	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TCL6-204	ENST00000460130	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		15.35	■□□□□ 0.05
TCL6-204	ENST00000460130	KCNQ4	P56696	695 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TCL6-204	ENST00000460130	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	15.34	■□□□□ 0.05
TCL6-204	ENST00000460130	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TCL6-204	ENST00000460130	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	15.34	■□□□□ 0.05
TCL6-204	ENST00000460130	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TCL6-204	ENST00000460130	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	15.34	■□□□□ 0.05
TCL6-204	ENST00000460130	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TCL6-204	ENST00000460130	ADCY9	O60503	1353 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TCL6-204	ENST00000460130	ATP10D	Q9P241	1426 aa		15.34	■□□□□ 0.05
TCL6-204	ENST00000460130	PLSCR1	O15162	318 aa		15.33	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	ITPK1	Q13572	414 aa		15.33	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	ILDR2	Q71H61	639 aa		15.33	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	15.33	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	15.33	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	15.32	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	TXNRD1	Q16881	649 aa		15.32	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	15.32	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	15.32	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	STARD3NL	O95772	234 aa		15.31	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	A1BG	P04217	495 aa		15.31	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	15.31	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	15.31	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	15.31	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	MEIS3	Q99687	375 aa		15.31	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	15.31	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		15.31	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	15.3	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	BAG6	P46379	1132 aa		15.3	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	15.3	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		15.3	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	CCDC125	Q86Z20	511 aa		15.3	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	SMC5	Q8IY18	1101 aa		15.3	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	PROM2	Q8N271	834 aa		15.3	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		15.3	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	15.3	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	15.3	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		15.3	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	HYPK	Q9NX55	129 aa		15.3	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		15.29	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		15.29	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	NBPF26	B4DH59	902 aa		15.29	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	15.29	■□□□□ 0.04

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