RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 SBF1O95248 1867 aa15.77■□□□□ 0.11
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PRAME-210ENST00000442481 SLC52A2Q9HAB3 445 aa15.76■□□□□ 0.11
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PRAME-210ENST00000442481 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
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PRAME-210ENST00000442481 COL15A1P39059 1388 aa15.74■□□□□ 0.11
PRAME-210ENST00000442481 CAPN15O75808 1086 aa15.73■□□□□ 0.11
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PRAME-210ENST00000442481 DNAJC10Q8IXB1 793 aa15.73■□□□□ 0.11
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PRAME-210ENST00000442481 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP15.62■□□□□ 0.09
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PRAME-210ENST00000442481 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
PRAME-210ENST00000442481 ST5P78524 1137 aa15.61■□□□□ 0.09
PRAME-210ENST00000442481 ERFEQ4G0M1 354 aa15.61■□□□□ 0.09
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PRAME-210ENST00000442481 HEG1Q9ULI3 1381 aa15.61■□□□□ 0.09
PRAME-210ENST00000442481 SCN7AQ01118 1682 aa15.6■□□□□ 0.09
PRAME-210ENST00000442481 GNAT3A8MTJ3 354 aa15.6■□□□□ 0.09
PRAME-210ENST00000442481 ZNF790Q6PG37 636 aa15.6■□□□□ 0.09
PRAME-210ENST00000442481 CNBD1Q8NA66 436 aa15.6■□□□□ 0.09
PRAME-210ENST00000442481 FMNL2Q96PY5 1086 aa15.6■□□□□ 0.09
PRAME-210ENST00000442481 SETDB2Q96T68 719 aa15.6■□□□□ 0.09
PRAME-210ENST00000442481 TAOK3Q9H2K8 898 aa15.6■□□□□ 0.09
PRAME-210ENST00000442481 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
PRAME-210ENST00000442481 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
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PRAME-210ENST00000442481 C21orf2O43822 256 aa15.58■□□□□ 0.08
PRAME-210ENST00000442481 TBC1D9BQ66K14 1250 aa15.58■□□□□ 0.08
PRAME-210ENST00000442481 CCDC24Q8N4L8 307 aa15.58■□□□□ 0.08
PRAME-210ENST00000442481 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
PRAME-210ENST00000442481 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa15.57■□□□□ 0.08
PRAME-210ENST00000442481 STYK1Q6J9G0 422 aa15.57■□□□□ 0.08
PRAME-210ENST00000442481 PRR5LQ6MZQ0 368 aa15.57■□□□□ 0.08
PRAME-210ENST00000442481 CHADLQ6NUI6 762 aa15.57■□□□□ 0.08
PRAME-210ENST00000442481 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
PRAME-210ENST00000442481 CREBZFQ9NS37 354 aa15.57■□□□□ 0.08
PRAME-210ENST00000442481 ZNF652Q9Y2D9 606 aa15.57■□□□□ 0.08
PRAME-210ENST00000442481 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
PRAME-210ENST00000442481 POTEIP0CG38 1075 aa15.56■□□□□ 0.08
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